MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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85002	NC_011080	CAT	2	6	4026800	4026805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445602
85003	NC_011080	TGA	2	6	4026813	4026818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445602
85004	NC_011080	GCT	3	9	4026886	4026894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445602
85005	NC_011080	CCA	2	6	4026895	4026900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445602
85006	NC_011080	GCC	2	6	4026902	4026907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445602
85007	NC_011080	TTA	2	6	4026969	4026974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445602
85008	NC_011080	TCT	2	6	4027031	4027036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445946
85009	NC_011080	GTTT	2	8	4027037	4027044	0 %	75 %	25 %	0 %	194445946
85010	NC_011080	TCAA	2	8	4027085	4027092	50 %	25 %	0 %	25 %	194445946
85011	NC_011080	GCC	2	6	4027133	4027138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445946
85012	NC_011080	TGC	2	6	4027139	4027144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445946
85013	NC_011080	TGT	2	6	4027146	4027151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194445946
85014	NC_011080	CAC	2	6	4027162	4027167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445946
85015	NC_011080	CAG	2	6	4027252	4027257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445946
85016	NC_011080	CG	3	6	4027281	4027286	0 %	0 %	50 %	50 %	194445946
85017	NC_011080	GCT	3	9	4027299	4027307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445946
85018	NC_011080	ACC	2	6	4027309	4027314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445946
85019	NC_011080	GA	4	8	4027316	4027323	50 %	0 %	50 %	0 %	194445946
85020	NC_011080	ACGC	2	8	4027432	4027439	25 %	0 %	25 %	50 %	194445946
85021	NC_011080	GC	3	6	4027508	4027513	0 %	0 %	50 %	50 %	194445946
85022	NC_011080	AGC	2	6	4027514	4027519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445946
85023	NC_011080	CAG	2	6	4027558	4027563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445946
85024	NC_011080	CG	3	6	4027576	4027581	0 %	0 %	50 %	50 %	194445946
85025	NC_011080	TTC	2	6	4027673	4027678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445946
85026	NC_011080	TTC	2	6	4027697	4027702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445946
85027	NC_011080	GTA	2	6	4027720	4027725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445946
85028	NC_011080	AAT	2	6	4027823	4027828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85029	NC_011080	T	6	6	4027875	4027880	0 %	100 %	0 %	0 %	194446726
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85031	NC_011080	CAG	3	9	4027911	4027919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446726
85032	NC_011080	TAA	2	6	4027931	4027936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446726
85033	NC_011080	CGCC	2	8	4027943	4027950	0 %	0 %	25 %	75 %	194446726
85034	NC_011080	TTG	2	6	4027959	4027964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446726
85035	NC_011080	CAT	2	6	4028028	4028033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446726
85036	NC_011080	TTGG	2	8	4028049	4028056	0 %	50 %	50 %	0 %	194446726
85037	NC_011080	ACA	2	6	4028069	4028074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446726
85038	NC_011080	CAG	2	6	4028109	4028114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446726
85039	NC_011080	ATC	2	6	4028164	4028169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446726
85040	NC_011080	TGC	2	6	4028308	4028313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446726
85041	NC_011080	CCA	2	6	4028321	4028326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446726
85042	NC_011080	AAAC	2	8	4028336	4028343	75 %	0 %	0 %	25 %	194446726
85043	NC_011080	CAA	2	6	4028351	4028356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446726
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85050	NC_011080	CG	3	6	4028591	4028596	0 %	0 %	50 %	50 %	194446726
85051	NC_011080	TGG	2	6	4028600	4028605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446726
85052	NC_011080	TCG	2	6	4028645	4028650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446726
85053	NC_011080	TTC	2	6	4028677	4028682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446726
85054	NC_011080	GCG	2	6	4028685	4028690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446726
85055	NC_011080	TTC	2	6	4028772	4028777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444007
85056	NC_011080	CGC	2	6	4028804	4028809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444007
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85058	NC_011080	GGTA	2	8	4028956	4028963	25 %	25 %	50 %	0 %	194444007
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85108	NC_011080	A	6	6	4031007	4031012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85109	NC_011080	ACCAG	2	10	4031029	4031038	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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85469	NC_011080	GCGA	2	8	4048391	4048398	25 %	0 %	50 %	25 %	194445542
85470	NC_011080	GAC	2	6	4048507	4048512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445542
85471	NC_011080	CGC	2	6	4048525	4048530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445542
85472	NC_011080	GA	3	6	4048542	4048547	50 %	0 %	50 %	0 %	194445542
85473	NC_011080	CGG	2	6	4048576	4048581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445542
85474	NC_011080	GC	3	6	4048658	4048663	0 %	0 %	50 %	50 %	194445542
85475	NC_011080	TCA	2	6	4048671	4048676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445542
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85477	NC_011080	GCA	2	6	4048735	4048740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445542
85478	NC_011080	CCA	2	6	4048810	4048815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445542
85479	NC_011080	CGG	2	6	4048864	4048869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445542
85480	NC_011080	CG	3	6	4048875	4048880	0 %	0 %	50 %	50 %	194445542
85481	NC_011080	GTA	2	6	4048929	4048934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445542
85482	NC_011080	CG	3	6	4048999	4049004	0 %	0 %	50 %	50 %	194445542
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85485	NC_011080	TGG	2	6	4049110	4049115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445542
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85488	NC_011080	CGG	2	6	4049444	4049449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445542
85489	NC_011080	GGC	2	6	4049464	4049469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445542
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85491	NC_011080	CCG	2	6	4049535	4049540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445542
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85495	NC_011080	CCTG	2	8	4049820	4049827	0 %	25 %	25 %	50 %	194445542
85496	NC_011080	ATCG	2	8	4049828	4049835	25 %	25 %	25 %	25 %	194445542
85497	NC_011080	CCG	2	6	4049850	4049855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445542
85498	NC_011080	CCG	2	6	4049895	4049900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445542
85499	NC_011080	TG	3	6	4049941	4049946	0 %	50 %	50 %	0 %	194445542
85500	NC_011080	AAT	3	9	4050017	4050025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445542

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