MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_011080	AC	3	6	4002666	4002671	50 %	0 %	0 %	50 %	194442591
84502	NC_011080	CGG	2	6	4002694	4002699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442591
84503	NC_011080	GCC	2	6	4002807	4002812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442591
84504	NC_011080	CAC	2	6	4002822	4002827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442591
84505	NC_011080	GAAA	2	8	4002828	4002835	75 %	0 %	25 %	0 %	194442591
84506	NC_011080	T	6	6	4002839	4002844	0 %	100 %	0 %	0 %	194442591
84507	NC_011080	CCA	2	6	4002893	4002898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442591
84508	NC_011080	CAT	2	6	4002920	4002925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442591
84509	NC_011080	CGA	2	6	4003092	4003097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442748
84510	NC_011080	GCA	2	6	4003338	4003343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442748
84511	NC_011080	TCA	2	6	4003365	4003370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442748
84512	NC_011080	TTG	2	6	4003390	4003395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442748
84513	NC_011080	AGA	2	6	4003444	4003449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442748
84514	NC_011080	CGC	2	6	4003488	4003493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442748
84515	NC_011080	AC	3	6	4003523	4003528	50 %	0 %	0 %	50 %	194442748
84516	NC_011080	GAT	2	6	4003537	4003542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442748
84517	NC_011080	TGT	2	6	4003548	4003553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442748
84518	NC_011080	CGG	2	6	4003560	4003565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442748
84519	NC_011080	GT	3	6	4003684	4003689	0 %	50 %	50 %	0 %	194442748
84520	NC_011080	GC	3	6	4003793	4003798	0 %	0 %	50 %	50 %	194442748
84521	NC_011080	GCC	2	6	4003888	4003893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443219
84522	NC_011080	CGCT	2	8	4004004	4004011	0 %	25 %	25 %	50 %	194443219
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84524	NC_011080	CCG	2	6	4004186	4004191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443219
84525	NC_011080	CCA	2	6	4004213	4004218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443219
84526	NC_011080	GCA	2	6	4004282	4004287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443219
84527	NC_011080	CGC	2	6	4004333	4004338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443219
84528	NC_011080	CGAA	2	8	4004376	4004383	50 %	0 %	25 %	25 %	194443219
84529	NC_011080	ATG	2	6	4004395	4004400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443219
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84532	NC_011080	AG	3	6	4004529	4004534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84533	NC_011080	CT	3	6	4004554	4004559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84534	NC_011080	CGC	2	6	4004584	4004589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84535	NC_011080	GTA	2	6	4004596	4004601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84536	NC_011080	CGT	2	6	4004618	4004623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84537	NC_011080	GTA	2	6	4004639	4004644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84538	NC_011080	TGT	2	6	4004656	4004661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84539	NC_011080	A	7	7	4004729	4004735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84540	NC_011080	GCA	2	6	4004739	4004744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84541	NC_011080	CGA	2	6	4004779	4004784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84542	NC_011080	CGGG	2	8	4004793	4004800	0 %	0 %	75 %	25 %	194445079
84543	NC_011080	ATC	2	6	4004952	4004957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445079
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84555	NC_011080	CCAT	2	8	4005600	4005607	25 %	25 %	0 %	50 %	194445079
84556	NC_011080	A	6	6	4005685	4005690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84557	NC_011080	GA	3	6	4005704	4005709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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84560	NC_011080	CAA	2	6	4005886	4005891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84561	NC_011080	C	7	7	4005958	4005964	0 %	0 %	0 %	100 %	194445607
84562	NC_011080	CTGT	2	8	4005992	4005999	0 %	50 %	25 %	25 %	194445607
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84591	NC_011080	GAG	2	6	4007206	4007211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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84601	NC_011080	GCG	3	9	4007477	4007485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446418
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84969	NC_011080	CGT	2	6	4025257	4025262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442949
84970	NC_011080	GTG	2	6	4025318	4025323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442949
84971	NC_011080	TGT	2	6	4025324	4025329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442949
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84977	NC_011080	CG	3	6	4025731	4025736	0 %	0 %	50 %	50 %	194445910
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84981	NC_011080	TGG	2	6	4025996	4026001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445910
84982	NC_011080	GC	3	6	4026017	4026022	0 %	0 %	50 %	50 %	194445910
84983	NC_011080	GCG	2	6	4026034	4026039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445910
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84987	NC_011080	AGCGC	2	10	4026235	4026244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84988	NC_011080	CAG	2	6	4026290	4026295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445602
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84999	NC_011080	TCGC	2	8	4026738	4026745	0 %	25 %	25 %	50 %	194445602
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