MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011080	TGC	2	6	328714	328719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7002	NC_011080	GGT	2	6	328766	328771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7003	NC_011080	GCC	3	9	328790	328798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442352
7004	NC_011080	CAGA	2	8	328811	328818	50 %	0 %	25 %	25 %	194442352
7005	NC_011080	AAC	2	6	328819	328824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442352
7006	NC_011080	GC	3	6	328832	328837	0 %	0 %	50 %	50 %	194442352
7007	NC_011080	A	6	6	328909	328914	100 %	0 %	0 %	0 %	194442352
7008	NC_011080	TGG	2	6	328918	328923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7009	NC_011080	CGC	2	6	328934	328939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442352
7010	NC_011080	CGGG	2	8	328958	328965	0 %	0 %	75 %	25 %	194442352
7011	NC_011080	CGG	2	6	328970	328975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7012	NC_011080	GGT	2	6	328983	328988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7013	NC_011080	TCGCT	2	10	329002	329011	0 %	40 %	20 %	40 %	194442352
7014	NC_011080	GC	3	6	329059	329064	0 %	0 %	50 %	50 %	194442352
7015	NC_011080	GGC	2	6	329066	329071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7016	NC_011080	GC	3	6	329085	329090	0 %	0 %	50 %	50 %	194442352
7017	NC_011080	GGC	2	6	329120	329125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7018	NC_011080	CTGC	2	8	329130	329137	0 %	25 %	25 %	50 %	194442352
7019	NC_011080	CTG	2	6	329154	329159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7020	NC_011080	GAT	2	6	329231	329236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442352
7021	NC_011080	CGA	2	6	329240	329245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7022	NC_011080	AGG	2	6	329293	329298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442352
7023	NC_011080	GCG	3	9	329332	329340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7024	NC_011080	AAC	2	6	329362	329367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442352
7025	NC_011080	AACC	2	8	329410	329417	50 %	0 %	0 %	50 %	194442352
7026	NC_011080	CAG	2	6	329460	329465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7027	NC_011080	T	6	6	329487	329492	0 %	100 %	0 %	0 %	194442352
7028	NC_011080	A	6	6	329508	329513	100 %	0 %	0 %	0 %	194442352
7029	NC_011080	GTG	2	6	329538	329543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7030	NC_011080	TGAT	2	8	329572	329579	25 %	50 %	25 %	0 %	194442352
7031	NC_011080	TGC	2	6	329593	329598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7032	NC_011080	CGG	2	6	329717	329722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7033	NC_011080	CTG	2	6	329742	329747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442352
7034	NC_011080	CGG	2	6	329770	329775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
7035	NC_011080	TGG	2	6	329791	329796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7036	NC_011080	GTG	2	6	329820	329825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442352
7037	NC_011080	CCG	2	6	329836	329841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442352
7038	NC_011080	GGT	2	6	329923	329928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443833
7039	NC_011080	TGGG	2	8	330038	330045	0 %	25 %	75 %	0 %	194443833
7040	NC_011080	GCGG	2	8	330048	330055	0 %	0 %	75 %	25 %	194443833
7041	NC_011080	GAC	2	6	330079	330084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443833
7042	NC_011080	CGC	2	6	330117	330122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443833
7043	NC_011080	TGGG	2	8	330201	330208	0 %	25 %	75 %	0 %	194443833
7044	NC_011080	GACT	2	8	330211	330218	25 %	25 %	25 %	25 %	194443833
7045	NC_011080	GCTG	2	8	330333	330340	0 %	25 %	50 %	25 %	194443833
7046	NC_011080	CTGG	2	8	330343	330350	0 %	25 %	50 %	25 %	194443833
7047	NC_011080	GGC	2	6	330358	330363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443833
7048	NC_011080	GCA	2	6	330364	330369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443833
7049	NC_011080	GCG	2	6	330388	330393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443833
7050	NC_011080	GGC	2	6	330396	330401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443833
7051	NC_011080	GTG	2	6	330448	330453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443833
7052	NC_011080	ACG	2	6	330475	330480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443833
7053	NC_011080	CGCAG	2	10	330486	330495	20 %	0 %	40 %	40 %	194443833
7054	NC_011080	GTA	2	6	330530	330535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443833
7055	NC_011080	GCGT	2	8	330546	330553	0 %	25 %	50 %	25 %	194443833
7056	NC_011080	GGCA	2	8	330591	330598	25 %	0 %	50 %	25 %	194443833
7057	NC_011080	GCA	2	6	330622	330627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443833
7058	NC_011080	AAT	2	6	330672	330677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443833
7059	NC_011080	TGG	2	6	330683	330688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_011080	GAA	2	6	330713	330718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_011080	TAA	2	6	330742	330747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_011080	TGC	3	9	330841	330849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_011080	ATA	2	6	330888	330893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_011080	CAT	2	6	330918	330923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_011080	TCAG	2	8	330925	330932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7066	NC_011080	T	6	6	330975	330980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_011080	A	6	6	331040	331045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_011080	GCT	2	6	331076	331081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_011080	TGG	2	6	331108	331113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_011080	CTG	2	6	331137	331142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_011080	AAT	2	6	331144	331149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_011080	TAT	2	6	331150	331155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_011080	CGGA	2	8	331159	331166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7074	NC_011080	AAT	2	6	331185	331190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_011080	T	8	8	331196	331203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_011080	AATTT	2	10	331247	331256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7081	NC_011080	ATT	2	6	331457	331462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444482
7082	NC_011080	AT	3	6	331496	331501	50 %	50 %	0 %	0 %	194444482
7083	NC_011080	AAAT	3	12	331505	331516	75 %	25 %	0 %	0 %	194444482
7084	NC_011080	GA	3	6	331519	331524	50 %	0 %	50 %	0 %	194444482
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7088	NC_011080	GGGCT	2	10	331612	331621	0 %	20 %	60 %	20 %	194444482
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7091	NC_011080	A	7	7	331741	331747	100 %	0 %	0 %	0 %	194444504
7092	NC_011080	GT	3	6	331873	331878	0 %	50 %	50 %	0 %	194445158
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7100	NC_011080	GACT	2	8	332216	332223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7101	NC_011080	GT	3	6	332310	332315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_011080	GCG	2	6	332323	332328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_011080	TGC	2	6	332388	332393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_011080	CAT	2	6	332411	332416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_011080	GGT	2	6	332548	332553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_011080	CCA	2	6	332570	332575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_011080	TGG	2	6	332706	332711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445674
7108	NC_011080	AACAA	2	10	332712	332721	80 %	0 %	0 %	20 %	194445674
7109	NC_011080	TGG	2	6	332786	332791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_011080	TTA	2	6	332844	332849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_011080	AATGC	2	10	332865	332874	40 %	20 %	20 %	20 %	194442538
7112	NC_011080	TAA	2	6	332889	332894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442538
7113	NC_011080	ATA	2	6	332905	332910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442538
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7115	NC_011080	TATGT	2	10	332949	332958	20 %	60 %	20 %	0 %	194442538
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7117	NC_011080	TATT	2	8	333085	333092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_011080	ATA	2	6	333140	333145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442493
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