MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011080	CGGG	2	8	305917	305924	0 %	0 %	75 %	25 %	194445947
6502	NC_011080	GA	3	6	305953	305958	50 %	0 %	50 %	0 %	194445947
6503	NC_011080	GCA	2	6	305966	305971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445947
6504	NC_011080	GCCAG	2	10	306001	306010	20 %	0 %	40 %	40 %	194445947
6505	NC_011080	GCTG	2	8	306044	306051	0 %	25 %	50 %	25 %	194445947
6506	NC_011080	GGCG	2	8	306103	306110	0 %	0 %	75 %	25 %	194445947
6507	NC_011080	ATC	2	6	306138	306143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_011080	GCA	2	6	306159	306164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_011080	CCTG	2	8	306274	306281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_011080	CCGT	2	8	306309	306316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_011080	A	8	8	306363	306370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_011080	T	8	8	306396	306403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_011080	AAG	2	6	306411	306416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_011080	CTT	2	6	306487	306492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_011080	CAT	3	9	306640	306648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446459
6516	NC_011080	CCA	2	6	306716	306721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446459
6517	NC_011080	CGA	2	6	306784	306789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6518	NC_011080	CAT	2	6	306812	306817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446459
6519	NC_011080	TG	3	6	306848	306853	0 %	50 %	50 %	0 %	194446459
6520	NC_011080	GGC	2	6	306883	306888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446459
6521	NC_011080	CTGGCG	2	12	306947	306958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194446459
6522	NC_011080	GCA	2	6	306998	307003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6523	NC_011080	AAC	2	6	307009	307014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446459
6524	NC_011080	CGC	2	6	307107	307112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446459
6525	NC_011080	CGGA	2	8	307156	307163	25 %	0 %	50 %	25 %	194446459
6526	NC_011080	CG	3	6	307203	307208	0 %	0 %	50 %	50 %	194446459
6527	NC_011080	CAG	2	6	307293	307298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6528	NC_011080	CGC	2	6	307299	307304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446459
6529	NC_011080	GC	3	6	307317	307322	0 %	0 %	50 %	50 %	194446459
6530	NC_011080	AGC	2	6	307369	307374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6531	NC_011080	TGGA	2	8	307377	307384	25 %	25 %	50 %	0 %	194446459
6532	NC_011080	CTG	2	6	307455	307460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6533	NC_011080	GCA	3	9	307472	307480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6534	NC_011080	GC	3	6	307521	307526	0 %	0 %	50 %	50 %	194446459
6535	NC_011080	G	6	6	307598	307603	0 %	0 %	100 %	0 %	194446459
6536	NC_011080	CAG	3	9	307617	307625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446459
6537	NC_011080	GTT	2	6	307661	307666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446459
6538	NC_011080	CATG	2	8	307764	307771	25 %	25 %	25 %	25 %	194444207
6539	NC_011080	CCG	2	6	307811	307816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444207
6540	NC_011080	TTG	2	6	307919	307924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444207
6541	NC_011080	CCG	2	6	307925	307930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444207
6542	NC_011080	TCC	2	6	307949	307954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194444207
6543	NC_011080	GGC	2	6	308149	308154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444207
6544	NC_011080	GCC	2	6	308198	308203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444207
6545	NC_011080	CCA	2	6	308312	308317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194444207
6546	NC_011080	TGCC	2	8	308338	308345	0 %	25 %	25 %	50 %	194444207
6547	NC_011080	CAGC	2	8	308356	308363	25 %	0 %	25 %	50 %	194444207
6548	NC_011080	GGT	2	6	308364	308369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444207
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6550	NC_011080	TCG	2	6	308553	308558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444207
6551	NC_011080	CTGC	2	8	308603	308610	0 %	25 %	25 %	50 %	194444207
6552	NC_011080	CGC	2	6	308639	308644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444207
6553	NC_011080	GGC	2	6	308930	308935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
6554	NC_011080	GGT	2	6	308946	308951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443419
6555	NC_011080	CAG	2	6	309018	309023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443419
6556	NC_011080	GCC	2	6	309039	309044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443419
6557	NC_011080	GCC	2	6	309101	309106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443419
6558	NC_011080	CAGC	2	8	309122	309129	25 %	0 %	25 %	50 %	194443419
6559	NC_011080	GGC	2	6	309130	309135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
6560	NC_011080	GCG	2	6	309137	309142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
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6562	NC_011080	CGCC	2	8	309167	309174	0 %	0 %	25 %	75 %	194443419
6563	NC_011080	CGC	2	6	309183	309188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443419
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6565	NC_011080	GGCAG	2	10	309227	309236	20 %	0 %	60 %	20 %	194443419
6566	NC_011080	GCG	2	6	309360	309365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
6567	NC_011080	GCG	2	6	309381	309386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
6568	NC_011080	ACG	2	6	309393	309398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443419
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6570	NC_011080	ATC	2	6	309463	309468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443419
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6574	NC_011080	TGA	2	6	309658	309663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443419
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6580	NC_011080	GCA	2	6	309953	309958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443419
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6584	NC_011080	CGG	2	6	310128	310133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
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6587	NC_011080	GCT	2	6	310188	310193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443419
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6589	NC_011080	CG	3	6	310250	310255	0 %	0 %	50 %	50 %	194443419
6590	NC_011080	GAC	2	6	310350	310355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443419
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6592	NC_011080	GGC	2	6	310491	310496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443419
6593	NC_011080	AAT	2	6	310588	310593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_011080	GC	3	6	310637	310642	0 %	0 %	50 %	50 %	194445579
6595	NC_011080	GGC	2	6	310761	310766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445579
6596	NC_011080	GC	3	6	310795	310800	0 %	0 %	50 %	50 %	194445579
6597	NC_011080	CATA	2	8	310835	310842	50 %	25 %	0 %	25 %	194445579
6598	NC_011080	GCG	2	6	310856	310861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445579
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6603	NC_011080	GCA	2	6	311057	311062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445579
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6606	NC_011080	GGT	2	6	311198	311203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445082
6607	NC_011080	CAG	2	6	311342	311347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445082
6608	NC_011080	GCG	2	6	311368	311373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445082
6609	NC_011080	AGCG	2	8	311379	311386	25 %	0 %	50 %	25 %	194445082
6610	NC_011080	CGC	2	6	311416	311421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445082
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6612	NC_011080	GCC	2	6	311483	311488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445082
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6614	NC_011080	GCC	2	6	311577	311582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445082
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6618	NC_011080	CA	4	8	311768	311775	50 %	0 %	0 %	50 %	194445082
6619	NC_011080	GGC	2	6	311794	311799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445082
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6621	NC_011080	AGC	2	6	311874	311879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445082
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6623	NC_011080	AAT	2	6	311973	311978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446571
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6872	NC_011080	CAGC	2	8	323392	323399	25 %	0 %	25 %	50 %	194443139
6873	NC_011080	GGCT	2	8	323448	323455	0 %	25 %	50 %	25 %	194443139
6874	NC_011080	GCG	2	6	323465	323470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443139
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6880	NC_011080	CTG	2	6	323726	323731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443139
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6884	NC_011080	CTG	2	6	323918	323923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443139
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6894	NC_011080	GCG	2	6	324329	324334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443139
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6903	NC_011080	TGAA	2	8	324593	324600	50 %	25 %	25 %	0 %	194443139
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6922	NC_011080	AT	3	6	325366	325371	50 %	50 %	0 %	0 %	194445934
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6925	NC_011080	GTA	2	6	325547	325552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6932	NC_011080	A	6	6	325833	325838	100 %	0 %	0 %	0 %	448967501
6933	NC_011080	TGA	2	6	325952	325957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967501
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6993	NC_011080	GGC	2	6	328307	328312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
6994	NC_011080	GC	3	6	328396	328401	0 %	0 %	50 %	50 %	194442352
6995	NC_011080	GGC	3	9	328481	328489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442352
6996	NC_011080	A	6	6	328532	328537	100 %	0 %	0 %	0 %	194442352
6997	NC_011080	CTGA	2	8	328539	328546	25 %	25 %	25 %	25 %	194442352
6998	NC_011080	CCG	2	6	328598	328603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442352
6999	NC_011080	CGC	2	6	328626	328631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442352
7000	NC_011080	GGCCT	2	10	328692	328701	0 %	20 %	40 %	40 %	194442352

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