MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011080	CGC	2	6	279727	279732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442764
6002	NC_011080	TGG	2	6	279735	279740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442764
6003	NC_011080	GTG	2	6	279767	279772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442764
6004	NC_011080	A	6	6	279774	279779	100 %	0 %	0 %	0 %	194442764
6005	NC_011080	CTG	2	6	279794	279799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
6006	NC_011080	GCT	2	6	279841	279846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
6007	NC_011080	TGC	2	6	280014	280019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
6008	NC_011080	GAT	2	6	280042	280047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442764
6009	NC_011080	CTG	2	6	280223	280228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
6010	NC_011080	TGCTC	2	10	280230	280239	0 %	40 %	20 %	40 %	194442764
6011	NC_011080	TCA	2	6	280415	280420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444278
6012	NC_011080	TCCCT	2	10	280577	280586	0 %	40 %	0 %	60 %	194444278
6013	NC_011080	T	6	6	280736	280741	0 %	100 %	0 %	0 %	194444278
6014	NC_011080	CT	3	6	280877	280882	0 %	50 %	0 %	50 %	194443631
6015	NC_011080	GCG	2	6	280908	280913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6016	NC_011080	TCA	2	6	280996	281001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443631
6017	NC_011080	GC	3	6	281135	281140	0 %	0 %	50 %	50 %	194443631
6018	NC_011080	GCA	2	6	281191	281196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6019	NC_011080	CTG	2	6	281222	281227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6020	NC_011080	CCGG	2	8	281249	281256	0 %	0 %	50 %	50 %	194443631
6021	NC_011080	CTT	2	6	281300	281305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443631
6022	NC_011080	GA	3	6	281317	281322	50 %	0 %	50 %	0 %	194443631
6023	NC_011080	T	6	6	281413	281418	0 %	100 %	0 %	0 %	194443631
6024	NC_011080	GC	4	8	281425	281432	0 %	0 %	50 %	50 %	194443631
6025	NC_011080	CT	3	6	281436	281441	0 %	50 %	0 %	50 %	194443631
6026	NC_011080	GCA	2	6	281443	281448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6027	NC_011080	GCG	2	6	281468	281473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6028	NC_011080	GCT	2	6	281512	281517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6029	NC_011080	ACTG	2	8	281543	281550	25 %	25 %	25 %	25 %	194443631
6030	NC_011080	CGG	2	6	281556	281561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6031	NC_011080	CT	3	6	281576	281581	0 %	50 %	0 %	50 %	194443631
6032	NC_011080	CGG	2	6	281606	281611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6033	NC_011080	GCG	2	6	281612	281617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6034	NC_011080	GCTG	2	8	281628	281635	0 %	25 %	50 %	25 %	194443631
6035	NC_011080	AGG	2	6	281688	281693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194443631
6036	NC_011080	TGGCGC	2	12	281694	281705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194443631
6037	NC_011080	CGA	2	6	281707	281712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6038	NC_011080	TGG	2	6	281771	281776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443631
6039	NC_011080	ACA	2	6	281794	281799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443631
6040	NC_011080	ACG	2	6	281804	281809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6041	NC_011080	CTGC	2	8	281843	281850	0 %	25 %	25 %	50 %	194443631
6042	NC_011080	GGC	2	6	281879	281884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443631
6043	NC_011080	GAA	2	6	281906	281911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443631
6044	NC_011080	CGA	2	6	282017	282022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6045	NC_011080	CGC	2	6	282030	282035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443631
6046	NC_011080	TGT	2	6	282036	282041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443631
6047	NC_011080	AGC	2	6	282094	282099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443631
6048	NC_011080	AGA	2	6	282100	282105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443631
6049	NC_011080	AAG	2	6	282108	282113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443631
6050	NC_011080	GCGCT	2	10	282142	282151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6051	NC_011080	CAC	2	6	282199	282204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_011080	CAA	2	6	282212	282217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011080	ATG	2	6	282409	282414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967498
6054	NC_011080	TCAT	2	8	282470	282477	25 %	50 %	0 %	25 %	448967498
6055	NC_011080	GCA	2	6	282507	282512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445341
6056	NC_011080	GCC	2	6	282555	282560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194445341
6057	NC_011080	CCT	2	6	282675	282680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_011080	CGT	2	6	282897	282902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445048
6059	NC_011080	ATG	2	6	282985	282990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445048
6060	NC_011080	TGA	2	6	283020	283025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445048
6061	NC_011080	ATC	2	6	283088	283093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445048
6062	NC_011080	GCGA	2	8	283162	283169	25 %	0 %	50 %	25 %	194445048
6063	NC_011080	GCG	2	6	283198	283203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445048
6064	NC_011080	TGG	2	6	283210	283215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445048
6065	NC_011080	CAG	2	6	283216	283221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445048
6066	NC_011080	GC	3	6	283235	283240	0 %	0 %	50 %	50 %	194445048
6067	NC_011080	CGA	2	6	283328	283333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194445048
6068	NC_011080	AAT	2	6	283369	283374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445048
6069	NC_011080	CG	3	6	283470	283475	0 %	0 %	50 %	50 %	194446732
6070	NC_011080	GGT	2	6	283485	283490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446732
6071	NC_011080	GCCA	2	8	283584	283591	25 %	0 %	25 %	50 %	194446732
6072	NC_011080	GAT	2	6	283605	283610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446732
6073	NC_011080	TCATTA	2	12	283615	283626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	194446732
6074	NC_011080	CGC	2	6	283758	283763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446732
6075	NC_011080	TCT	2	6	283785	283790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446732
6076	NC_011080	TCG	2	6	283814	283819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446732
6077	NC_011080	GGC	2	6	283965	283970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
6078	NC_011080	GCA	2	6	283986	283991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446048
6079	NC_011080	GCG	2	6	284000	284005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
6080	NC_011080	TGC	2	6	284006	284011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446048
6081	NC_011080	TGA	2	6	284072	284077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446048
6082	NC_011080	GAA	2	6	284101	284106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446048
6083	NC_011080	CGG	2	6	284144	284149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
6084	NC_011080	TAT	2	6	284188	284193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446048
6085	NC_011080	CG	3	6	284194	284199	0 %	0 %	50 %	50 %	194446048
6086	NC_011080	GTAT	3	12	284315	284326	25 %	50 %	25 %	0 %	194446048
6087	NC_011080	GCG	2	6	284338	284343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
6088	NC_011080	GGC	2	6	284415	284420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446048
6089	NC_011080	TGC	2	6	284444	284449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446048
6090	NC_011080	CACT	2	8	284556	284563	25 %	25 %	0 %	50 %	194446048
6091	NC_011080	CAA	2	6	284625	284630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_011080	TCG	2	6	284730	284735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6093	NC_011080	GTC	2	6	284825	284830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6094	NC_011080	GC	4	8	284851	284858	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
6095	NC_011080	AGC	2	6	285028	285033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6096	NC_011080	CAA	2	6	285205	285210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443070
6097	NC_011080	AGT	2	6	285247	285252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443070
6098	NC_011080	GGC	2	6	285293	285298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443070
6099	NC_011080	CGAT	2	8	285306	285313	25 %	25 %	25 %	25 %	194443070
6100	NC_011080	TCT	2	6	285381	285386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443070
6101	NC_011080	TTCA	2	8	285440	285447	25 %	50 %	0 %	25 %	194443070
6102	NC_011080	CGC	2	6	285457	285462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
6103	NC_011080	CAG	2	6	285467	285472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6104	NC_011080	CCA	2	6	285475	285480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443070
6105	NC_011080	CAG	2	6	285512	285517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6106	NC_011080	T	6	6	285529	285534	0 %	100 %	0 %	0 %	194443070
6107	NC_011080	CCA	2	6	285556	285561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443070
6108	NC_011080	CGC	2	6	285614	285619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
6109	NC_011080	GC	3	6	285621	285626	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
6110	NC_011080	GCG	2	6	285634	285639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443070
6111	NC_011080	CGC	2	6	285706	285711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
6112	NC_011080	GCC	2	6	285746	285751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443070
6113	NC_011080	CG	3	6	285776	285781	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
6114	NC_011080	TCA	2	6	285886	285891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443070
6115	NC_011080	CG	3	6	285898	285903	0 %	0 %	50 %	50 %	194443070
6116	NC_011080	TCA	2	6	285933	285938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443070
6117	NC_011080	GAA	2	6	285959	285964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443070
6118	NC_011080	CTT	2	6	286021	286026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443070
6119	NC_011080	GCA	2	6	286075	286080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443070
6120	NC_011080	CT	3	6	286110	286115	0 %	50 %	0 %	50 %	194443070
6121	NC_011080	GGCT	2	8	286127	286134	0 %	25 %	50 %	25 %	194443070
6122	NC_011080	GTT	2	6	286169	286174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443070
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6248	NC_011080	GGA	2	6	292526	292531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_011080	TCA	2	6	292551	292556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6251	NC_011080	CGT	2	6	292645	292650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6252	NC_011080	AC	3	6	292746	292751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6253	NC_011080	GTAG	2	8	292787	292794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6285	NC_011080	TTG	2	6	294578	294583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6378	NC_011080	CGC	2	6	299710	299715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444274
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6380	NC_011080	TGC	2	6	299764	299769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444274
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6386	NC_011080	AGTG	2	8	300119	300126	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6387	NC_011080	AGA	2	6	300143	300148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6499	NC_011080	CGCGG	2	10	305652	305661	0 %	0 %	60 %	40 %	194445947
6500	NC_011080	GATA	2	8	305840	305847	50 %	25 %	25 %	0 %	194445947

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