MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011072	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011072	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011072	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011072	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011072	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011072	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	194398133
8	NC_011072	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	194398133
9	NC_011072	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398133
10	NC_011072	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194398133
11	NC_011072	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398133
12	NC_011072	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
13	NC_011072	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398133
14	NC_011072	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398133
15	NC_011072	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	194398133
16	NC_011072	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398133
17	NC_011072	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
18	NC_011072	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	194398133
19	NC_011072	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
20	NC_011072	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	194398133
21	NC_011072	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398133
22	NC_011072	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398133
23	NC_011072	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
24	NC_011072	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398133
25	NC_011072	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398133
26	NC_011072	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	194398133
27	NC_011072	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398133
28	NC_011072	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398133
29	NC_011072	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	194398133
30	NC_011072	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	194398133
31	NC_011072	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	194398133
32	NC_011072	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	194398133
33	NC_011072	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	194398133
34	NC_011072	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398133
35	NC_011072	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011072	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011072	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011072	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011072	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011072	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011072	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011072	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397554
43	NC_011072	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	194397554
44	NC_011072	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397554
45	NC_011072	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	194397554
46	NC_011072	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
47	NC_011072	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
48	NC_011072	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
49	NC_011072	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397554
50	NC_011072	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
51	NC_011072	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	194397554
52	NC_011072	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397554
53	NC_011072	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397554
54	NC_011072	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	194397554
55	NC_011072	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
56	NC_011072	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	194397554
57	NC_011072	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
58	NC_011072	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397554
59	NC_011072	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397554
60	NC_011072	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397554
61	NC_011072	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	194397554
62	NC_011072	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397554
63	NC_011072	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	194397554
64	NC_011072	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	194397554
65	NC_011072	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397554
66	NC_011072	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011072	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396943
68	NC_011072	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	194396943
69	NC_011072	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	194396943
70	NC_011072	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396943
71	NC_011072	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396943
72	NC_011072	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396943
73	NC_011072	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011072	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011072	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
76	NC_011072	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
77	NC_011072	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398291
78	NC_011072	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	194398291
79	NC_011072	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
80	NC_011072	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	194398291
81	NC_011072	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398291
82	NC_011072	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
83	NC_011072	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
84	NC_011072	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	194398291
85	NC_011072	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
86	NC_011072	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
87	NC_011072	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398291
88	NC_011072	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	194398291
89	NC_011072	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	194398291
90	NC_011072	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	194398291
91	NC_011072	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
92	NC_011072	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398291
93	NC_011072	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398291
94	NC_011072	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
95	NC_011072	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398291
96	NC_011072	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	194398291
97	NC_011072	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011072	A	7	7	4341	4347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011072	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	194397946
100	NC_011072	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	194397946
101	NC_011072	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	194397946
102	NC_011072	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397946
103	NC_011072	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	194397946
104	NC_011072	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	194397946
105	NC_011072	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	194397946
106	NC_011072	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397946
107	NC_011072	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
108	NC_011072	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397946
109	NC_011072	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397946
110	NC_011072	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
111	NC_011072	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397946
112	NC_011072	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397946
113	NC_011072	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397946
114	NC_011072	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397946
115	NC_011072	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397105
116	NC_011072	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
117	NC_011072	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397105
118	NC_011072	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194397105
119	NC_011072	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
120	NC_011072	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
121	NC_011072	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397105
122	NC_011072	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
123	NC_011072	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	194397105
124	NC_011072	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397105
125	NC_011072	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	194397105
126	NC_011072	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
127	NC_011072	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397105
128	NC_011072	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	194397105
129	NC_011072	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
130	NC_011072	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	194397105
131	NC_011072	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	194397105
132	NC_011072	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
133	NC_011072	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397105
134	NC_011072	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
135	NC_011072	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397105
136	NC_011072	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397105
137	NC_011072	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	194397105
138	NC_011072	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	194397105
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262	NC_011072	TA	3	6	11785	11790	50 %	50 %	0 %	0 %	194398531
263	NC_011072	A	6	6	11792	11797	100 %	0 %	0 %	0 %	194398531
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268	NC_011072	A	6	6	11910	11915	100 %	0 %	0 %	0 %	194397408
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405	NC_011072	ATG	2	6	17764	17769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_011072	GGA	2	6	17897	17902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
407	NC_011072	TC	3	6	17983	17988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
408	NC_011072	ACC	2	6	18163	18168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
409	NC_011072	AAT	2	6	18183	18188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_011072	AGC	2	6	18243	18248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_011072	ATTC	2	8	18250	18257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
412	NC_011072	TG	3	6	18372	18377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
413	NC_011072	GAG	2	6	18393	18398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_011072	GA	3	6	18523	18528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
415	NC_011072	ACA	2	6	18549	18554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_011072	CTAA	2	8	18604	18611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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419	NC_011072	GA	3	6	18819	18824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
420	NC_011072	CT	3	6	18935	18940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
421	NC_011072	GAT	2	6	18953	18958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_011072	CGG	2	6	19044	19049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_011072	GA	3	6	19142	19147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
424	NC_011072	TAGG	2	8	19260	19267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
425	NC_011072	TAC	2	6	19314	19319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_011072	TCG	2	6	19653	19658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_011072	CGT	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_011072	TA	3	6	19937	19942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_011072	GA	3	6	19957	19962	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
433	NC_011072	GAAGTG	2	12	19982	19993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
434	NC_011072	ACTAAT	2	12	20012	20023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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436	NC_011072	GTA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_011072	ATG	2	6	20281	20286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
438	NC_011072	T	6	6	20340	20345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_011072	TAA	3	9	20352	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_011072	TCT	2	6	21825	21830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_011072	T	6	6	21845	21850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011072	TAA	2	6	21855	21860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_011072	TG	3	6	22963	22968	0 %	50 %	50 %	0 %	194397970
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