MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011072	TCC	2	6	142827	142832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194397844
3002	NC_011072	CT	3	6	142883	142888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_011072	CGT	2	6	142914	142919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_011072	GAA	2	6	142935	142940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011072	AAG	2	6	142941	142946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011072	TC	3	6	142970	142975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3007	NC_011072	TCA	2	6	143050	143055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397796
3008	NC_011072	AGG	2	6	143065	143070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397796
3009	NC_011072	T	6	6	143073	143078	0 %	100 %	0 %	0 %	194397796
3010	NC_011072	ATG	3	9	143124	143132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397796
3011	NC_011072	TTC	2	6	143224	143229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397796
3012	NC_011072	AGC	2	6	143263	143268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397796
3013	NC_011072	ACC	2	6	143366	143371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194397796
3014	NC_011072	AGA	2	6	143373	143378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397796
3015	NC_011072	ATG	2	6	143391	143396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397796
3016	NC_011072	A	6	6	143418	143423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011072	GAG	2	6	143442	143447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011072	CAG	2	6	143492	143497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011072	GAG	2	6	143517	143522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011072	GAA	2	6	143523	143528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011072	GA	3	6	143571	143576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011072	ATGA	2	8	143580	143587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011072	T	6	6	143609	143614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011072	GAG	2	6	143648	143653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011072	GAT	2	6	143663	143668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011072	TA	4	8	143691	143698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011072	TTTA	2	8	143701	143708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011072	ATT	2	6	143720	143725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011072	T	7	7	143740	143746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011072	GAT	2	6	143747	143752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011072	T	6	6	143861	143866	0 %	100 %	0 %	0 %	194398285
3032	NC_011072	TTA	2	6	143918	143923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398285
3033	NC_011072	GAA	2	6	144013	144018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398285
3034	NC_011072	GAA	2	6	144021	144026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398285
3035	NC_011072	AGA	2	6	144027	144032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398285
3036	NC_011072	A	6	6	144147	144152	100 %	0 %	0 %	0 %	194398285
3037	NC_011072	GAC	2	6	144202	144207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398285
3038	NC_011072	AT	3	6	144307	144312	50 %	50 %	0 %	0 %	194398285
3039	NC_011072	TAG	2	6	144339	144344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398285
3040	NC_011072	GTTA	2	8	144349	144356	25 %	50 %	25 %	0 %	194398285
3041	NC_011072	AT	3	6	144382	144387	50 %	50 %	0 %	0 %	194398285
3042	NC_011072	A	6	6	144403	144408	100 %	0 %	0 %	0 %	194398285
3043	NC_011072	ATC	2	6	144426	144431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398285
3044	NC_011072	TAT	2	6	144534	144539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398285
3045	NC_011072	AGT	2	6	144562	144567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011072	GTT	2	6	144643	144648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397525
3047	NC_011072	ATAA	2	8	144673	144680	75 %	25 %	0 %	0 %	194397525
3048	NC_011072	A	6	6	144684	144689	100 %	0 %	0 %	0 %	194397525
3049	NC_011072	TTC	2	6	144695	144700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397525
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3051	NC_011072	T	7	7	144756	144762	0 %	100 %	0 %	0 %	194397525
3052	NC_011072	ATA	2	6	144785	144790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397525
3053	NC_011072	ATT	2	6	144794	144799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397525
3054	NC_011072	ATT	2	6	144802	144807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397525
3055	NC_011072	ATG	2	6	144824	144829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397525
3056	NC_011072	ATT	2	6	144907	144912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397525
3057	NC_011072	CAAA	2	8	144941	144948	75 %	0 %	0 %	25 %	194397525
3058	NC_011072	A	6	6	144969	144974	100 %	0 %	0 %	0 %	194397525
3059	NC_011072	GA	3	6	144999	145004	50 %	0 %	50 %	0 %	194397525
3060	NC_011072	GTT	2	6	145007	145012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397525
3061	NC_011072	TA	3	6	145014	145019	50 %	50 %	0 %	0 %	194397525
3062	NC_011072	GTT	2	6	145045	145050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397525
3063	NC_011072	GAAG	2	8	145066	145073	50 %	0 %	50 %	0 %	194397525
3064	NC_011072	GTT	2	6	145086	145091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397525
3065	NC_011072	ATGTT	2	10	145130	145139	20 %	60 %	20 %	0 %	194397525
3066	NC_011072	GAAGCA	2	12	145153	145164	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194397525
3067	NC_011072	T	6	6	145172	145177	0 %	100 %	0 %	0 %	194397525
3068	NC_011072	T	7	7	145206	145212	0 %	100 %	0 %	0 %	194397525
3069	NC_011072	GAG	2	6	145236	145241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397525
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3071	NC_011072	GTTT	2	8	145273	145280	0 %	75 %	25 %	0 %	194397525
3072	NC_011072	TAA	2	6	145305	145310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397525
3073	NC_011072	CTT	2	6	145313	145318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397525
3074	NC_011072	GGA	2	6	145327	145332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397525
3075	NC_011072	A	7	7	145362	145368	100 %	0 %	0 %	0 %	194397525
3076	NC_011072	AAAT	2	8	145379	145386	75 %	25 %	0 %	0 %	194397525
3077	NC_011072	TAG	2	6	145472	145477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397525
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3079	NC_011072	TAAT	2	8	145541	145548	50 %	50 %	0 %	0 %	194397525
3080	NC_011072	ATTG	2	8	145554	145561	25 %	50 %	25 %	0 %	194397525
3081	NC_011072	ACAAA	2	10	145645	145654	80 %	0 %	0 %	20 %	194397525
3082	NC_011072	TTG	2	6	145664	145669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397525
3083	NC_011072	AAT	2	6	145763	145768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011072	A	7	7	145784	145790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011072	GGA	2	6	145905	145910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011072	A	6	6	145969	145974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011072	GGCT	2	8	146048	146055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_011072	AAT	2	6	146100	146105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011072	ATA	2	6	146109	146114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011072	AGG	2	6	146125	146130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011072	GAT	2	6	146137	146142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398479
3092	NC_011072	A	6	6	146145	146150	100 %	0 %	0 %	0 %	194398479
3093	NC_011072	CAGA	2	8	146201	146208	50 %	0 %	25 %	25 %	194398479
3094	NC_011072	TGA	2	6	146320	146325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398479
3095	NC_011072	CAA	2	6	146341	146346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398479
3096	NC_011072	GCT	2	6	146414	146419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398479
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3098	NC_011072	GGA	2	6	146434	146439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398479
3099	NC_011072	TCG	2	6	146470	146475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398479
3100	NC_011072	CCAT	2	8	146502	146509	25 %	25 %	0 %	50 %	194398479
3101	NC_011072	TAAA	2	8	146514	146521	75 %	25 %	0 %	0 %	194398479
3102	NC_011072	AGG	2	6	146538	146543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194398479
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3105	NC_011072	T	7	7	146649	146655	0 %	100 %	0 %	0 %	194398479
3106	NC_011072	CCT	2	6	146661	146666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194398479
3107	NC_011072	ATG	2	6	146820	146825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398479
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3109	NC_011072	TCTT	2	8	146868	146875	0 %	75 %	0 %	25 %	194398479
3110	NC_011072	CAAA	2	8	146876	146883	75 %	0 %	0 %	25 %	194398479
3111	NC_011072	TTTTC	2	10	147057	147066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_011072	TAT	2	6	147073	147078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_011072	TCC	2	6	147081	147086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_011072	TAA	2	6	147094	147099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011072	TAT	2	6	147103	147108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011072	AAT	2	6	147117	147122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011072	A	6	6	147161	147166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011072	T	6	6	147181	147186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011072	AGG	2	6	147354	147359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194396703
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3122	NC_011072	GCC	2	6	147509	147514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194396703
3123	NC_011072	AGA	2	6	147517	147522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396703
3124	NC_011072	ATA	2	6	147539	147544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011072	GAA	2	6	147549	147554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397280
3126	NC_011072	AAG	2	6	147560	147565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397280
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3128	NC_011072	TTA	2	6	147603	147608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397280
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3463	NC_011072	CTT	2	6	164819	164824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3469	NC_011072	TAAT	2	8	165094	165101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3492	NC_011072	CT	3	6	166694	166699	0 %	50 %	0 %	50 %	194398020
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3495	NC_011072	ATC	2	6	166904	166909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398020
3496	NC_011072	TGA	2	6	166914	166919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398020
3497	NC_011072	CTC	2	6	166936	166941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194398020
3498	NC_011072	A	6	6	167092	167097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_011072	TACA	2	8	167598	167605	50 %	25 %	0 %	25 %	194397420
3500	NC_011072	CAT	2	6	167658	167663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397420

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