MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011072	GGC	2	6	242596	242601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194397797
5002	NC_011072	TCG	2	6	242636	242641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397797
5003	NC_011072	AGC	2	6	242650	242655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397797
5004	NC_011072	ATA	2	6	242719	242724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397797
5005	NC_011072	GTTT	2	8	242751	242758	0 %	75 %	25 %	0 %	194397797
5006	NC_011072	GTTT	2	8	242771	242778	0 %	75 %	25 %	0 %	194397797
5007	NC_011072	ACT	2	6	242819	242824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397797
5008	NC_011072	ACA	3	9	242849	242857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397797
5009	NC_011072	CTT	3	9	242907	242915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397797
5010	NC_011072	CAT	2	6	242937	242942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397797
5011	NC_011072	TCT	2	6	243140	243145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397797
5012	NC_011072	T	6	6	243145	243150	0 %	100 %	0 %	0 %	194397797
5013	NC_011072	TCA	2	6	243257	243262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397797
5014	NC_011072	CGT	2	6	243333	243338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397797
5015	NC_011072	TAA	2	6	243361	243366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397797
5016	NC_011072	AG	3	6	243495	243500	50 %	0 %	50 %	0 %	194397797
5017	NC_011072	GTA	2	6	243529	243534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397797
5018	NC_011072	T	6	6	243653	243658	0 %	100 %	0 %	0 %	194397797
5019	NC_011072	TTG	2	6	243668	243673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397797
5020	NC_011072	TCTT	2	8	243740	243747	0 %	75 %	0 %	25 %	194397797
5021	NC_011072	TTC	2	6	243838	243843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397797
5022	NC_011072	T	6	6	243850	243855	0 %	100 %	0 %	0 %	194397797
5023	NC_011072	AGT	2	6	243870	243875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397797
5024	NC_011072	GTT	2	6	243908	243913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397797
5025	NC_011072	TAG	2	6	243921	243926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397797
5026	NC_011072	AGT	2	6	243928	243933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397797
5027	NC_011072	GCA	2	6	243986	243991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397797
5028	NC_011072	TCT	2	6	243998	244003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397797
5029	NC_011072	GAA	2	6	244037	244042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397797
5030	NC_011072	GCT	2	6	244070	244075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397797
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5032	NC_011072	TGT	2	6	244113	244118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397797
5033	NC_011072	TGGT	2	8	244131	244138	0 %	50 %	50 %	0 %	194397797
5034	NC_011072	TCG	2	6	244145	244150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397797
5035	NC_011072	GCAA	2	8	244175	244182	50 %	0 %	25 %	25 %	194397797
5036	NC_011072	T	7	7	244248	244254	0 %	100 %	0 %	0 %	194397797
5037	NC_011072	CAAT	2	8	244292	244299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_011072	GAAA	2	8	244360	244367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011072	TA	3	6	244400	244405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011072	AAGCC	2	10	244439	244448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5041	NC_011072	TTA	2	6	244452	244457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011072	GAT	2	6	244462	244467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_011072	A	6	6	244516	244521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011072	CAAG	2	8	244536	244543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_011072	AAT	2	6	244559	244564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011072	TC	3	6	244587	244592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_011072	AC	3	6	244632	244637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_011072	GAT	2	6	244639	244644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011072	ATC	2	6	244661	244666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_011072	A	7	7	244676	244682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011072	A	6	6	244791	244796	100 %	0 %	0 %	0 %	194397766
5052	NC_011072	CAAA	2	8	244800	244807	75 %	0 %	0 %	25 %	194397766
5053	NC_011072	CAC	2	6	244816	244821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194397766
5054	NC_011072	GTG	2	6	244828	244833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397766
5055	NC_011072	A	6	6	244863	244868	100 %	0 %	0 %	0 %	194397766
5056	NC_011072	GTG	2	6	244971	244976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397766
5057	NC_011072	CTT	2	6	244977	244982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397766
5058	NC_011072	GTG	2	6	245032	245037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397766
5059	NC_011072	CTG	2	6	245243	245248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398272
5060	NC_011072	AAG	2	6	245282	245287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398272
5061	NC_011072	CAT	2	6	245334	245339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398272
5062	NC_011072	CGT	2	6	245362	245367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398272
5063	NC_011072	TGG	2	6	245370	245375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398272
5064	NC_011072	CGT	2	6	245413	245418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398272
5065	NC_011072	ACA	2	6	245419	245424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398272
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5067	NC_011072	GTG	2	6	245462	245467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398272
5068	NC_011072	AC	3	6	245469	245474	50 %	0 %	0 %	50 %	194398272
5069	NC_011072	TGC	2	6	245508	245513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398272
5070	NC_011072	AAC	2	6	245515	245520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398272
5071	NC_011072	GCA	2	6	245527	245532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398272
5072	NC_011072	GGTTGC	2	12	245655	245666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5073	NC_011072	ATG	2	6	245721	245726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011072	CGA	2	6	245776	245781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011072	GCA	2	6	245807	245812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_011072	CTAA	2	8	245834	245841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_011072	CAA	2	6	245917	245922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_011072	TTA	2	6	245967	245972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011072	AATAG	2	10	245985	245994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011072	AAAT	2	8	246002	246009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011072	AAAC	2	8	246015	246022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5082	NC_011072	A	6	6	246048	246053	100 %	0 %	0 %	0 %	194398605
5083	NC_011072	ACA	2	6	246095	246100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398605
5084	NC_011072	ACT	2	6	246101	246106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398605
5085	NC_011072	TAC	2	6	246119	246124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398605
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5087	NC_011072	GCAAGA	2	12	246187	246198	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	194398605
5088	NC_011072	CTG	2	6	246219	246224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398605
5089	NC_011072	CGA	2	6	246225	246230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398605
5090	NC_011072	AAC	2	6	246242	246247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398605
5091	NC_011072	CAT	2	6	246259	246264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398605
5092	NC_011072	AC	3	6	246267	246272	50 %	0 %	0 %	50 %	194398605
5093	NC_011072	CGTAT	2	10	246413	246422	20 %	40 %	20 %	20 %	194398605
5094	NC_011072	CAA	2	6	246427	246432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398605
5095	NC_011072	CCAAT	2	10	246506	246515	40 %	20 %	0 %	40 %	194398605
5096	NC_011072	GAA	2	6	246611	246616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
5097	NC_011072	ATTG	2	8	246664	246671	25 %	50 %	25 %	0 %	194398605
5098	NC_011072	GAA	2	6	246692	246697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
5099	NC_011072	TGA	3	9	246699	246707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398605
5100	NC_011072	GAA	2	6	246722	246727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
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5103	NC_011072	TG	3	6	246795	246800	0 %	50 %	50 %	0 %	194398605
5104	NC_011072	GAA	2	6	246914	246919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
5105	NC_011072	TGAC	2	8	246972	246979	25 %	25 %	25 %	25 %	194398605
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5107	NC_011072	TTC	2	6	247023	247028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398605
5108	NC_011072	GCT	2	6	247145	247150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398605
5109	NC_011072	TAC	2	6	247168	247173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398605
5110	NC_011072	ATC	2	6	247208	247213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398605
5111	NC_011072	TCAA	2	8	247220	247227	50 %	25 %	0 %	25 %	194398605
5112	NC_011072	CAAGA	2	10	247280	247289	60 %	0 %	20 %	20 %	194398605
5113	NC_011072	GAA	2	6	247316	247321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
5114	NC_011072	AAAC	2	8	247341	247348	75 %	0 %	0 %	25 %	194398605
5115	NC_011072	TTG	2	6	247404	247409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398605
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5119	NC_011072	TGG	2	6	247522	247527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398605
5120	NC_011072	GAA	2	6	247571	247576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398605
5121	NC_011072	ATTCGA	2	12	247585	247596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	194398605
5122	NC_011072	TCG	2	6	247605	247610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398605
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5124	NC_011072	ATG	2	6	247722	247727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398605
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5369	NC_011072	CTGA	2	8	260251	260258	25 %	25 %	25 %	25 %	194396951
5370	NC_011072	GCA	2	6	260268	260273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194396951
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5372	NC_011072	ATT	2	6	260310	260315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396951
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5375	NC_011072	A	7	7	260389	260395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_011072	A	6	6	260411	260416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_011072	A	6	6	260419	260424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5431	NC_011072	CAAA	2	8	262828	262835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5432	NC_011072	TAT	2	6	262871	262876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5474	NC_011072	TCTTTT	2	12	265145	265156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5491	NC_011072	AAGA	2	8	265836	265843	75 %	0 %	25 %	0 %	194398507
5492	NC_011072	CTT	2	6	265851	265856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398507
5493	NC_011072	TCA	2	6	265927	265932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398507
5494	NC_011072	TGA	2	6	266114	266119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398507
5495	NC_011072	ATAA	2	8	266146	266153	75 %	25 %	0 %	0 %	194398507
5496	NC_011072	GAAA	2	8	266157	266164	75 %	0 %	25 %	0 %	194396991
5497	NC_011072	CGGA	2	8	266194	266201	25 %	0 %	50 %	25 %	194396991
5498	NC_011072	TTGGA	2	10	266213	266222	20 %	40 %	40 %	0 %	194396991
5499	NC_011072	TGG	2	6	266228	266233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396991
5500	NC_011072	TCC	2	6	266276	266281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194396991

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