MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 123609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010943	GGCG	2	8	509081	509088	0 %	0 %	75 %	25 %	190572555
13002	NC_010943	ATG	2	6	509106	509111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572555
13003	NC_010943	GC	3	6	509157	509162	0 %	0 %	50 %	50 %	190572555
13004	NC_010943	TGG	2	6	509186	509191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572555
13005	NC_010943	CTG	2	6	509256	509261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572555
13006	NC_010943	CGG	2	6	509262	509267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572555
13007	NC_010943	CG	4	8	509327	509334	0 %	0 %	50 %	50 %	190572555
13008	NC_010943	GCA	2	6	509429	509434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572555
13009	NC_010943	AC	3	6	509535	509540	50 %	0 %	0 %	50 %	190572555
13010	NC_010943	GGC	2	6	509542	509547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572555
13011	NC_010943	ACCC	2	8	509575	509582	25 %	0 %	0 %	75 %	190572555
13012	NC_010943	GCG	2	6	509593	509598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572555
13013	NC_010943	GCCG	2	8	509631	509638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13014	NC_010943	CA	3	6	509698	509703	50 %	0 %	0 %	50 %	190572556
13015	NC_010943	CTC	2	6	509743	509748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572556
13016	NC_010943	TCCGC	2	10	509769	509778	0 %	20 %	20 %	60 %	190572556
13017	NC_010943	GC	3	6	509817	509822	0 %	0 %	50 %	50 %	190572556
13018	NC_010943	ATCCGC	2	12	509824	509835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572556
13019	NC_010943	CGA	2	6	509925	509930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572556
13020	NC_010943	AGC	2	6	510046	510051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572557
13021	NC_010943	CCA	2	6	510053	510058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572557
13022	NC_010943	CGG	2	6	510106	510111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572557
13023	NC_010943	CCGC	2	8	510131	510138	0 %	0 %	25 %	75 %	190572557
13024	NC_010943	TTG	2	6	510336	510341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572557
13025	NC_010943	GC	4	8	510346	510353	0 %	0 %	50 %	50 %	190572557
13026	NC_010943	A	6	6	510416	510421	100 %	0 %	0 %	0 %	190572557
13027	NC_010943	CGT	2	6	510544	510549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572558
13028	NC_010943	CGG	2	6	510596	510601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572558
13029	NC_010943	AGC	2	6	510613	510618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572558
13030	NC_010943	CAG	2	6	510620	510625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572558
13031	NC_010943	AGC	2	6	510672	510677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572558
13032	NC_010943	TCC	2	6	510727	510732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572558
13033	NC_010943	GGA	2	6	510742	510747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_010943	GAGG	2	8	510787	510794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_010943	CTG	2	6	510838	510843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13036	NC_010943	CTG	2	6	510868	510873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13037	NC_010943	GGCG	2	8	510882	510889	0 %	0 %	75 %	25 %	190572559
13038	NC_010943	CAC	2	6	510907	510912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572559
13039	NC_010943	TGC	2	6	510920	510925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13040	NC_010943	ACA	2	6	511010	511015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572559
13041	NC_010943	CGG	2	6	511030	511035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572559
13042	NC_010943	CAC	2	6	511060	511065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572559
13043	NC_010943	GGC	2	6	511114	511119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572559
13044	NC_010943	GGC	2	6	511146	511151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572559
13045	NC_010943	CTG	2	6	511189	511194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572559
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13047	NC_010943	TC	3	6	511302	511307	0 %	50 %	0 %	50 %	190572559
13048	NC_010943	CGG	2	6	511392	511397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572559
13049	NC_010943	GTT	2	6	511412	511417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572559
13050	NC_010943	TG	3	6	511441	511446	0 %	50 %	50 %	0 %	190572559
13051	NC_010943	TGC	2	6	511534	511539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13052	NC_010943	GCTCA	2	10	511552	511561	20 %	20 %	20 %	40 %	190572559
13053	NC_010943	TGT	2	6	511647	511652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572559
13054	NC_010943	CGC	2	6	511689	511694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572559
13055	NC_010943	CAG	2	6	511714	511719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13056	NC_010943	CAG	2	6	511733	511738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13057	NC_010943	GTT	2	6	511750	511755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572559
13058	NC_010943	TTC	2	6	511916	511921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572559
13059	NC_010943	CGG	2	6	511956	511961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572559
13060	NC_010943	CAG	2	6	512020	512025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572559
13061	NC_010943	CAT	2	6	512034	512039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572559
13062	NC_010943	CCT	2	6	512085	512090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572559
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13065	NC_010943	CACG	2	8	512193	512200	25 %	0 %	25 %	50 %	190572560
13066	NC_010943	GGC	2	6	512289	512294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572560
13067	NC_010943	CTG	2	6	512367	512372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572560
13068	NC_010943	TGA	2	6	512382	512387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572560
13069	NC_010943	GC	3	6	512604	512609	0 %	0 %	50 %	50 %	190572560
13070	NC_010943	TGG	2	6	512610	512615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572560
13071	NC_010943	CGAT	2	8	512660	512667	25 %	25 %	25 %	25 %	190572560
13072	NC_010943	GCC	2	6	512691	512696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572560
13073	NC_010943	TGC	2	6	512709	512714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572560
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13075	NC_010943	GTA	2	6	512806	512811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572560
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13080	NC_010943	TGCTC	2	10	513019	513028	0 %	40 %	20 %	40 %	190572560
13081	NC_010943	TCC	2	6	513171	513176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_010943	C	6	6	513182	513187	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13083	NC_010943	ACC	2	6	513190	513195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13084	NC_010943	CAT	2	6	513201	513206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_010943	CCAG	2	8	513207	513214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13086	NC_010943	GCA	2	6	513219	513224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13089	NC_010943	CGA	2	6	513358	513363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572561
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13091	NC_010943	ACG	2	6	513444	513449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572561
13092	NC_010943	CGA	2	6	513454	513459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572561
13093	NC_010943	TAC	2	6	513473	513478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572561
13094	NC_010943	GAG	2	6	513500	513505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572561
13095	NC_010943	CTGC	2	8	513514	513521	0 %	25 %	25 %	50 %	190572561
13096	NC_010943	GGA	2	6	513532	513537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572561
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13101	NC_010943	GCT	2	6	513847	513852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572561
13102	NC_010943	GCC	2	6	513927	513932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572561
13103	NC_010943	GCCA	2	8	513944	513951	25 %	0 %	25 %	50 %	190572561
13104	NC_010943	CTG	2	6	513968	513973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572561
13105	NC_010943	TC	3	6	513994	513999	0 %	50 %	0 %	50 %	190572561
13106	NC_010943	TGC	2	6	514014	514019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572561
13107	NC_010943	GCCG	2	8	514023	514030	0 %	0 %	50 %	50 %	190572561
13108	NC_010943	GCC	2	6	514046	514051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572561
13109	NC_010943	CCG	2	6	514096	514101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572561
13110	NC_010943	GGC	2	6	514123	514128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572561
13111	NC_010943	CG	3	6	514174	514179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13112	NC_010943	CACGC	2	10	514201	514210	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13113	NC_010943	C	6	6	514210	514215	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13114	NC_010943	CAGC	2	8	514241	514248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_010943	CAGA	2	8	514259	514266	50 %	0 %	25 %	25 %	190572562
13116	NC_010943	GCGGG	2	10	514268	514277	0 %	0 %	80 %	20 %	190572562
13117	NC_010943	CTC	2	6	514348	514353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572562
13118	NC_010943	GCCGTT	2	12	514374	514385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572562
13119	NC_010943	CGCC	2	8	514426	514433	0 %	0 %	25 %	75 %	190572562
13120	NC_010943	CCG	3	9	514444	514452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572562
13121	NC_010943	CCT	2	6	514528	514533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572562
13122	NC_010943	CGG	2	6	514535	514540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572562
13123	NC_010943	CCGGC	2	10	514555	514564	0 %	0 %	40 %	60 %	190572562
13124	NC_010943	TGC	2	6	514570	514575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572562
13125	NC_010943	GTG	2	6	514638	514643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572562
13126	NC_010943	GGT	2	6	514700	514705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572562
13127	NC_010943	GAA	2	6	514751	514756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572562
13128	NC_010943	GCC	2	6	514776	514781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572562
13129	NC_010943	TGG	2	6	514804	514809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572562
13130	NC_010943	GCC	2	6	514818	514823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572562
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13142	NC_010943	GACC	2	8	515111	515118	25 %	0 %	25 %	50 %	190572562
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13145	NC_010943	GTGCTG	2	12	515190	515201	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	190572562
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13147	NC_010943	CTG	2	6	515262	515267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572562
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13150	NC_010943	GAA	2	6	515399	515404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572562
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13152	NC_010943	GC	3	6	515469	515474	0 %	0 %	50 %	50 %	190572562
13153	NC_010943	TTG	2	6	515607	515612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13154	NC_010943	TCG	2	6	515682	515687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572563
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13157	NC_010943	CGT	2	6	515821	515826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572563
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13172	NC_010943	TGC	2	6	516402	516407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572564
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13180	NC_010943	CTG	2	6	516725	516730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572564
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13207	NC_010943	CCG	2	6	517641	517646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572566
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13223	NC_010943	TGCA	2	8	518132	518139	25 %	25 %	25 %	25 %	190572566
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13226	NC_010943	GCAC	2	8	518250	518257	25 %	0 %	25 %	50 %	190572566
13227	NC_010943	GTG	2	6	518279	518284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572566
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13229	NC_010943	GCT	2	6	518344	518349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572566
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13231	NC_010943	GGC	2	6	518461	518466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572567
13232	NC_010943	GCGG	2	8	518473	518480	0 %	0 %	75 %	25 %	190572567
13233	NC_010943	GCG	2	6	518491	518496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572567
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13235	NC_010943	ACA	2	6	518514	518519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572567
13236	NC_010943	CG	3	6	518538	518543	0 %	0 %	50 %	50 %	190572567
13237	NC_010943	CAG	2	6	518619	518624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_010943	CCTGG	2	10	518625	518634	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13239	NC_010943	GCG	2	6	518657	518662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572568
13240	NC_010943	GC	3	6	518736	518741	0 %	0 %	50 %	50 %	190572568
13241	NC_010943	GCA	2	6	518753	518758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572568
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13362	NC_010943	TTG	2	6	523782	523787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572575
13363	NC_010943	GCC	2	6	523805	523810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572575
13364	NC_010943	CGC	2	6	523921	523926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572575
13365	NC_010943	GCC	2	6	523949	523954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572575
13366	NC_010943	GC	4	8	523985	523992	0 %	0 %	50 %	50 %	190572575
13367	NC_010943	AGC	2	6	524002	524007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572575
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13371	NC_010943	GGC	2	6	524139	524144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13372	NC_010943	GTG	2	6	524215	524220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572576
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13382	NC_010943	CTG	2	6	524453	524458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572576
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13385	NC_010943	CGGC	2	8	524544	524551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13394	NC_010943	CGA	2	6	524923	524928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572577
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13482	NC_010943	GCT	3	9	528087	528095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572580
13483	NC_010943	GCT	2	6	528126	528131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572580
13484	NC_010943	CG	3	6	528166	528171	0 %	0 %	50 %	50 %	190572580
13485	NC_010943	CA	3	6	528202	528207	50 %	0 %	0 %	50 %	190572580
13486	NC_010943	GAG	2	6	528217	528222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572580
13487	NC_010943	GC	3	6	528271	528276	0 %	0 %	50 %	50 %	190572580
13488	NC_010943	CG	3	6	528283	528288	0 %	0 %	50 %	50 %	190572580
13489	NC_010943	GCA	2	6	528317	528322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572580
13490	NC_010943	CTGG	2	8	528333	528340	0 %	25 %	50 %	25 %	190572580
13491	NC_010943	TGGG	2	8	528355	528362	0 %	25 %	75 %	0 %	190572580
13492	NC_010943	CGCA	2	8	528391	528398	25 %	0 %	25 %	50 %	190572580
13493	NC_010943	GGC	2	6	528399	528404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572580
13494	NC_010943	CGC	2	6	528417	528422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572580
13495	NC_010943	CGGGC	2	10	528436	528445	0 %	0 %	60 %	40 %	190572580
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13499	NC_010943	GCA	2	6	528510	528515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572580
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