MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1 chromosome

Total Repeats: 44624

< Previous12...78798081828384858687888990Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_010730	AT	4	8	1832602	1832609	50 %	50 %	0 %	0 %	188997671
44502	NC_010730	ACAG	2	8	1832615	1832622	50 %	0 %	25 %	25 %	188997671
44503	NC_010730	A	6	6	1832646	1832651	100 %	0 %	0 %	0 %	188997671
44504	NC_010730	TAAT	2	8	1832703	1832710	50 %	50 %	0 %	0 %	188997671
44505	NC_010730	CAG	2	6	1832869	1832874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997672
44506	NC_010730	TATC	2	8	1832893	1832900	25 %	50 %	0 %	25 %	188997672
44507	NC_010730	TTA	2	6	1832905	1832910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44508	NC_010730	AAT	2	6	1832929	1832934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
44509	NC_010730	T	6	6	1833011	1833016	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44510	NC_010730	CT	3	6	1833060	1833065	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
44511	NC_010730	AATATC	2	12	1833131	1833142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188997672
44512	NC_010730	TACT	2	8	1833169	1833176	25 %	50 %	0 %	25 %	188997672
44513	NC_010730	ATT	2	6	1833216	1833221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44514	NC_010730	T	8	8	1833220	1833227	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44515	NC_010730	TC	3	6	1833293	1833298	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
44516	NC_010730	GA	3	6	1833301	1833306	50 %	0 %	50 %	0 %	188997672
44517	NC_010730	ATA	2	6	1833368	1833373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
44518	NC_010730	T	6	6	1833385	1833390	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44519	NC_010730	T	6	6	1833472	1833477	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44520	NC_010730	AAT	2	6	1833489	1833494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
44521	NC_010730	T	7	7	1833506	1833512	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44522	NC_010730	CAG	2	6	1833559	1833564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997672
44523	NC_010730	GTT	2	6	1833584	1833589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997672
44524	NC_010730	AATTA	2	10	1833590	1833599	60 %	40 %	0 %	0 %	188997672
44525	NC_010730	ATTT	2	8	1833601	1833608	25 %	75 %	0 %	0 %	188997672
44526	NC_010730	TTTA	2	8	1833617	1833624	25 %	75 %	0 %	0 %	188997672
44527	NC_010730	TC	3	6	1833629	1833634	0 %	50 %	0 %	50 %	188997672
44528	NC_010730	TAT	2	6	1833655	1833660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44529	NC_010730	T	6	6	1833668	1833673	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44530	NC_010730	TCA	2	6	1833690	1833695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188997672
44531	NC_010730	AAT	2	6	1833707	1833712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997672
44532	NC_010730	TCT	3	9	1833717	1833725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997672
44533	NC_010730	ATT	2	6	1833731	1833736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44534	NC_010730	ATT	2	6	1833741	1833746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44535	NC_010730	T	7	7	1833858	1833864	0 %	100 %	0 %	0 %	188997672
44536	NC_010730	TAT	2	6	1833886	1833891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997672
44537	NC_010730	TA	3	6	1833911	1833916	50 %	50 %	0 %	0 %	188997672
44538	NC_010730	CTT	2	6	1833931	1833936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188997672
44539	NC_010730	AT	3	6	1833949	1833954	50 %	50 %	0 %	0 %	188997672
44540	NC_010730	AAT	2	6	1834026	1834031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44541	NC_010730	GTTTAT	2	12	1834040	1834051	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44542	NC_010730	AG	3	6	1834124	1834129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44543	NC_010730	A	6	6	1834178	1834183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44544	NC_010730	AC	3	6	1834257	1834262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44545	NC_010730	T	6	6	1834269	1834274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44546	NC_010730	TTA	2	6	1834316	1834321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44547	NC_010730	TAA	2	6	1834345	1834350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44548	NC_010730	TAA	2	6	1834358	1834363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44549	NC_010730	GGA	2	6	1834370	1834375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44550	NC_010730	AGCA	2	8	1834424	1834431	50 %	0 %	25 %	25 %	188997673
44551	NC_010730	GAA	2	6	1834453	1834458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
44552	NC_010730	TGC	3	9	1834518	1834526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997673
44553	NC_010730	A	6	6	1834572	1834577	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
44554	NC_010730	CAG	2	6	1834646	1834651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997673
44555	NC_010730	AGA	2	6	1834657	1834662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
44556	NC_010730	GAT	2	6	1834777	1834782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997673
44557	NC_010730	AGA	2	6	1834797	1834802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
44558	NC_010730	AG	3	6	1834819	1834824	50 %	0 %	50 %	0 %	188997673
44559	NC_010730	CT	3	6	1835020	1835025	0 %	50 %	0 %	50 %	188997673
44560	NC_010730	A	6	6	1835031	1835036	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
44561	NC_010730	TGC	2	6	1835091	1835096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997673
44562	NC_010730	GAA	2	6	1835101	1835106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
44563	NC_010730	ATT	2	6	1835193	1835198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997673
44564	NC_010730	CAAA	2	8	1835228	1835235	75 %	0 %	0 %	25 %	188997673
44565	NC_010730	AAT	2	6	1835316	1835321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997673
44566	NC_010730	A	6	6	1835464	1835469	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
44567	NC_010730	A	6	6	1835482	1835487	100 %	0 %	0 %	0 %	188997673
44568	NC_010730	CAACTG	2	12	1835597	1835608	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188997673
44569	NC_010730	GAA	2	6	1835629	1835634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997673
44570	NC_010730	CAAT	2	8	1835675	1835682	50 %	25 %	0 %	25 %	188997673
44571	NC_010730	ACTAT	2	10	1835723	1835732	40 %	40 %	0 %	20 %	188997673
44572	NC_010730	ATA	2	6	1835836	1835841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997673
44573	NC_010730	AAGC	2	8	1835843	1835850	50 %	0 %	25 %	25 %	188997673
44574	NC_010730	ACA	2	6	1835873	1835878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997673
44575	NC_010730	TCTT	2	8	1835896	1835903	0 %	75 %	0 %	25 %	188997673
44576	NC_010730	A	7	7	1835935	1835941	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
44577	NC_010730	TTATT	2	10	1835978	1835987	20 %	80 %	0 %	0 %	188997674
44578	NC_010730	GA	3	6	1836053	1836058	50 %	0 %	50 %	0 %	188997674
44579	NC_010730	AAG	2	6	1836176	1836181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997674
44580	NC_010730	CTTGG	2	10	1836214	1836223	0 %	40 %	40 %	20 %	188997674
44581	NC_010730	ACC	2	6	1836318	1836323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188997674
44582	NC_010730	ATA	2	6	1836355	1836360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
44583	NC_010730	TATG	2	8	1836466	1836473	25 %	50 %	25 %	0 %	188997674
44584	NC_010730	CCTT	2	8	1836483	1836490	0 %	50 %	0 %	50 %	188997674
44585	NC_010730	A	6	6	1836505	1836510	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
44586	NC_010730	TATT	2	8	1836513	1836520	25 %	75 %	0 %	0 %	188997674
44587	NC_010730	ATA	2	6	1836542	1836547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
44588	NC_010730	A	6	6	1836577	1836582	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
44589	NC_010730	TGA	2	6	1836612	1836617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997674
44590	NC_010730	TA	3	6	1836783	1836788	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
44591	NC_010730	TGC	2	6	1836798	1836803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188997674
44592	NC_010730	A	6	6	1836903	1836908	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
44593	NC_010730	AAC	2	6	1836928	1836933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997674
44594	NC_010730	GTT	2	6	1836940	1836945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997674
44595	NC_010730	AT	3	6	1836964	1836969	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
44596	NC_010730	ATT	2	6	1836982	1836987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997674
44597	NC_010730	AAG	2	6	1837043	1837048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997674
44598	NC_010730	A	6	6	1837060	1837065	100 %	0 %	0 %	0 %	188997674
44599	NC_010730	TA	3	6	1837072	1837077	50 %	50 %	0 %	0 %	188997674
44600	NC_010730	AAC	2	6	1837089	1837094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997674
44601	NC_010730	TAG	2	6	1837217	1837222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997674
44602	NC_010730	TAA	2	6	1837227	1837232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997674
44603	NC_010730	CAG	2	6	1837252	1837257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188997675
44604	NC_010730	CAAA	2	8	1837279	1837286	75 %	0 %	0 %	25 %	188997675
44605	NC_010730	AAC	2	6	1837307	1837312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997675
44606	NC_010730	A	6	6	1837338	1837343	100 %	0 %	0 %	0 %	188997675
44607	NC_010730	TGT	2	6	1837472	1837477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188997675
44608	NC_010730	TC	3	6	1837564	1837569	0 %	50 %	0 %	50 %	188997675
44609	NC_010730	TTA	2	6	1837581	1837586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997675
44610	NC_010730	TA	3	6	1837608	1837613	50 %	50 %	0 %	0 %	188997675
44611	NC_010730	GAT	2	6	1837635	1837640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188997675
44612	NC_010730	TAA	2	6	1837663	1837668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188997675
44613	NC_010730	ATAATT	2	12	1837690	1837701	50 %	50 %	0 %	0 %	188997675
44614	NC_010730	ATT	2	6	1837713	1837718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188997675
44615	NC_010730	CAA	2	6	1837780	1837785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188997675
44616	NC_010730	A	7	7	1837902	1837908	100 %	0 %	0 %	0 %	188997676
44617	NC_010730	CAT	2	6	1837989	1837994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188997676
44618	NC_010730	GAA	2	6	1838000	1838005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997676
44619	NC_010730	A	7	7	1838088	1838094	100 %	0 %	0 %	0 %	188997676
44620	NC_010730	AAG	2	6	1838109	1838114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188997676
44621	NC_010730	AAG	2	6	1838181	1838186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44622	NC_010730	T	6	6	1838289	1838294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44623	NC_010730	GAAAA	2	10	1838300	1838309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44624	NC_010730	TTC	2	6	1838318	1838323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...78798081828384858687888990Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.