MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010660	GA	4	8	192744	192751	50 %	0 %	50 %	0 %	187734439
4002	NC_010660	ATC	2	6	192783	192788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734439
4003	NC_010660	TAAAG	2	10	192817	192826	60 %	20 %	20 %	0 %	187734439
4004	NC_010660	ACTTT	2	10	192827	192836	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4005	NC_010660	TGGC	2	8	192879	192886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_010660	GATGTA	2	12	192917	192928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_010660	TCT	2	6	192959	192964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_010660	CAA	2	6	193016	193021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_010660	CTT	2	6	193068	193073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_010660	GCTC	2	8	193079	193086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_010660	CAA	2	6	193127	193132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734377
4012	NC_010660	TTA	2	6	193135	193140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734377
4013	NC_010660	TAC	2	6	193311	193316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734377
4014	NC_010660	GCT	2	6	193336	193341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734377
4015	NC_010660	CAC	2	6	193396	193401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734377
4016	NC_010660	CTG	2	6	193434	193439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734377
4017	NC_010660	TACC	2	8	193504	193511	25 %	25 %	0 %	50 %	187734377
4018	NC_010660	CCGA	2	8	193547	193554	25 %	0 %	25 %	50 %	187734377
4019	NC_010660	TGC	2	6	193579	193584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734377
4020	NC_010660	AGG	2	6	193599	193604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734377
4021	NC_010660	GCC	2	6	193610	193615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734377
4022	NC_010660	GC	3	6	193616	193621	0 %	0 %	50 %	50 %	187734377
4023	NC_010660	ACAG	2	8	193644	193651	50 %	0 %	25 %	25 %	187734377
4024	NC_010660	CAGA	2	8	193739	193746	50 %	0 %	25 %	25 %	187734377
4025	NC_010660	CGT	2	6	193781	193786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734377
4026	NC_010660	CGT	2	6	193901	193906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734377
4027	NC_010660	CCT	2	6	193979	193984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_010660	AAT	2	6	193988	193993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_010660	A	6	6	194041	194046	100 %	0 %	0 %	0 %	187734309
4030	NC_010660	TACA	2	8	194054	194061	50 %	25 %	0 %	25 %	187734309
4031	NC_010660	A	6	6	194061	194066	100 %	0 %	0 %	0 %	187734309
4032	NC_010660	TCA	2	6	194072	194077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734309
4033	NC_010660	C	6	6	194100	194105	0 %	0 %	0 %	100 %	187734309
4034	NC_010660	ACT	2	6	194271	194276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_010660	CATT	2	8	194283	194290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_010660	CCTGT	2	10	194313	194322	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4037	NC_010660	GACA	2	8	194324	194331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_010660	GCG	2	6	194353	194358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_010660	ACA	2	6	194384	194389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_010660	CCCT	2	8	194445	194452	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4041	NC_010660	GCCCC	2	10	194468	194477	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4042	NC_010660	TGT	2	6	194517	194522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_010660	ATC	2	6	194532	194537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_010660	CTGG	2	8	194550	194557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_010660	GCG	2	6	194790	194795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_010660	TCA	2	6	194834	194839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_010660	GCAGG	2	10	194863	194872	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4048	NC_010660	CGG	2	6	194921	194926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_010660	CAT	2	6	194953	194958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_010660	GCC	2	6	194959	194964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_010660	TCA	2	6	195056	195061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_010660	CA	3	6	195074	195079	50 %	0 %	0 %	50 %	187734473
4053	NC_010660	TCA	2	6	195122	195127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734473
4054	NC_010660	CA	3	6	195146	195151	50 %	0 %	0 %	50 %	187734473
4055	NC_010660	CGG	2	6	195183	195188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734473
4056	NC_010660	GCC	2	6	195268	195273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734473
4057	NC_010660	TC	4	8	195368	195375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4058	NC_010660	T	6	6	195408	195413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_010660	CAG	2	6	195468	195473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4060	NC_010660	CG	3	6	195484	195489	0 %	0 %	50 %	50 %	187734340
4061	NC_010660	CTC	2	6	195501	195506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734340
4062	NC_010660	CGG	2	6	195529	195534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734340
4063	NC_010660	GCC	2	6	195546	195551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734340
4064	NC_010660	ATCC	2	8	195636	195643	25 %	25 %	0 %	50 %	187734340
4065	NC_010660	TC	3	6	195671	195676	0 %	50 %	0 %	50 %	187734340
4066	NC_010660	CA	3	6	195677	195682	50 %	0 %	0 %	50 %	187734340
4067	NC_010660	A	6	6	195720	195725	100 %	0 %	0 %	0 %	187734340
4068	NC_010660	CGG	2	6	195870	195875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734340
4069	NC_010660	CTT	2	6	195876	195881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734340
4070	NC_010660	GC	3	6	195900	195905	0 %	0 %	50 %	50 %	187734340
4071	NC_010660	TCC	2	6	195911	195916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734340
4072	NC_010660	GCCG	2	8	195918	195925	0 %	0 %	50 %	50 %	187734340
4073	NC_010660	T	7	7	195926	195932	0 %	100 %	0 %	0 %	187734340
4074	NC_010660	TCC	2	6	195957	195962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734340
4075	NC_010660	CGT	2	6	195996	196001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4076	NC_010660	AGC	2	6	196054	196059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4077	NC_010660	GAC	2	6	196184	196189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4078	NC_010660	AGA	2	6	196211	196216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734340
4079	NC_010660	GGC	2	6	196242	196247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734340
4080	NC_010660	CAG	2	6	196251	196256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4081	NC_010660	CAG	2	6	196287	196292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734340
4082	NC_010660	T	6	6	196408	196413	0 %	100 %	0 %	0 %	187734340
4083	NC_010660	GGCA	2	8	196424	196431	25 %	0 %	50 %	25 %	187734340
4084	NC_010660	CCGC	2	8	196567	196574	0 %	0 %	25 %	75 %	187734340
4085	NC_010660	AGGA	2	8	196579	196586	50 %	0 %	50 %	0 %	187734340
4086	NC_010660	ACA	2	6	196643	196648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734340
4087	NC_010660	GCT	2	6	196690	196695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734456
4088	NC_010660	GGT	2	6	196738	196743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734456
4089	NC_010660	AG	3	6	196809	196814	50 %	0 %	50 %	0 %	187734456
4090	NC_010660	TAA	2	6	196863	196868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734466
4091	NC_010660	CATA	2	8	196884	196891	50 %	25 %	0 %	25 %	187734466
4092	NC_010660	CAA	2	6	196909	196914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734466
4093	NC_010660	GGT	2	6	197009	197014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734466
4094	NC_010660	ACA	3	9	197307	197315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734386
4095	NC_010660	GAA	2	6	197349	197354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734386
4096	NC_010660	A	6	6	197353	197358	100 %	0 %	0 %	0 %	187734386
4097	NC_010660	TCT	2	6	197364	197369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734386
4098	NC_010660	GCG	2	6	197396	197401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734386
4099	NC_010660	CTG	2	6	197414	197419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734386
4100	NC_010660	GGA	2	6	197449	197454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734386
4101	NC_010660	CTG	2	6	197513	197518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734386
4102	NC_010660	AAT	2	6	197541	197546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734386
4103	NC_010660	ATGG	2	8	197636	197643	25 %	25 %	50 %	0 %	187734286
4104	NC_010660	TCGT	2	8	197660	197667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_010660	GCG	2	6	197883	197888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734329
4106	NC_010660	GCC	2	6	197900	197905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734329
4107	NC_010660	GC	3	6	198043	198048	0 %	0 %	50 %	50 %	187734329
4108	NC_010660	TGC	2	6	198095	198100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734329
4109	NC_010660	CCG	2	6	198235	198240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734329
4110	NC_010660	T	7	7	198282	198288	0 %	100 %	0 %	0 %	187734329
4111	NC_010660	CGG	2	6	198295	198300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734329
4112	NC_010660	ATA	2	6	198396	198401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734493
4113	NC_010660	TGA	2	6	198520	198525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734493
4114	NC_010660	GTG	2	6	198559	198564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734493
4115	NC_010660	AGG	2	6	198575	198580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734493
4116	NC_010660	TGA	2	6	198592	198597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734493
4117	NC_010660	TGT	2	6	198644	198649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_010660	ACAG	2	8	198654	198661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_010660	GAT	2	6	198675	198680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010660	CTA	2	6	198694	198699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_010660	CT	3	6	198718	198723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_010660	TTG	2	6	198726	198731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010660	T	6	6	198765	198770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_010660	ATC	2	6	198776	198781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_010660	TATC	2	8	198817	198824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_010660	AT	4	8	198860	198867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_010660	ATA	2	6	198878	198883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_010660	GTT	2	6	205674	205679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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