MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010660	GAA	2	6	167507	167512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734460
3502	NC_010660	ATC	2	6	167539	167544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734460
3503	NC_010660	GTT	2	6	167576	167581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734460
3504	NC_010660	TTAC	2	8	167764	167771	25 %	50 %	0 %	25 %	187734460
3505	NC_010660	TCA	2	6	167806	167811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734460
3506	NC_010660	GTAT	2	8	167951	167958	25 %	50 %	25 %	0 %	187734460
3507	NC_010660	AC	3	6	167968	167973	50 %	0 %	0 %	50 %	187734460
3508	NC_010660	GTGG	2	8	168131	168138	0 %	25 %	75 %	0 %	187734460
3509	NC_010660	CGA	2	6	168153	168158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734460
3510	NC_010660	CTC	2	6	168181	168186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734460
3511	NC_010660	GCAGAA	2	12	168189	168200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187734460
3512	NC_010660	TTA	2	6	168206	168211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734460
3513	NC_010660	GAT	2	6	168228	168233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734460
3514	NC_010660	CAC	3	9	168322	168330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734402
3515	NC_010660	ACG	2	6	168378	168383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734402
3516	NC_010660	AGG	2	6	168464	168469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734402
3517	NC_010660	ATT	2	6	168513	168518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734402
3518	NC_010660	TG	3	6	168584	168589	0 %	50 %	50 %	0 %	187734402
3519	NC_010660	GCC	2	6	168653	168658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734351
3520	NC_010660	GTT	2	6	168700	168705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734351
3521	NC_010660	ACA	2	6	168715	168720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734351
3522	NC_010660	GCCAG	2	10	168729	168738	20 %	0 %	40 %	40 %	187734351
3523	NC_010660	TCA	2	6	168804	168809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734351
3524	NC_010660	ACA	3	9	168910	168918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734370
3525	NC_010660	GCCCG	2	10	168928	168937	0 %	0 %	40 %	60 %	187734370
3526	NC_010660	TTAC	2	8	169016	169023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_010660	A	7	7	169052	169058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010660	GCA	2	6	169061	169066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_010660	A	6	6	169068	169073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_010660	AT	3	6	169140	169145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010660	AGC	2	6	169190	169195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734356
3532	NC_010660	TGCG	2	8	169301	169308	0 %	25 %	50 %	25 %	187734356
3533	NC_010660	CAG	2	6	169330	169335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734356
3534	NC_010660	AG	4	8	169433	169440	50 %	0 %	50 %	0 %	187734499
3535	NC_010660	GTTT	2	8	169449	169456	0 %	75 %	25 %	0 %	187734499
3536	NC_010660	ATT	2	6	169475	169480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734499
3537	NC_010660	GAC	2	6	169491	169496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734499
3538	NC_010660	CTG	2	6	169526	169531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734499
3539	NC_010660	GGT	2	6	169561	169566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734499
3540	NC_010660	ATG	2	6	169592	169597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734499
3541	NC_010660	GAA	2	6	169637	169642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734499
3542	NC_010660	TAAC	2	8	169897	169904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_010660	T	7	7	169964	169970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010660	TTA	2	6	169991	169996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010660	TAA	2	6	169997	170002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_010660	A	6	6	170001	170006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_010660	TTCAT	2	10	170016	170025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3548	NC_010660	CAT	2	6	170100	170105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734472
3549	NC_010660	ATAA	2	8	170113	170120	75 %	25 %	0 %	0 %	187734472
3550	NC_010660	TGA	2	6	170232	170237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734472
3551	NC_010660	AAT	2	6	170269	170274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734472
3552	NC_010660	GCT	2	6	170343	170348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734472
3553	NC_010660	TAAC	2	8	170369	170376	50 %	25 %	0 %	25 %	187734472
3554	NC_010660	A	7	7	170400	170406	100 %	0 %	0 %	0 %	187734472
3555	NC_010660	CCT	2	6	170449	170454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734472
3556	NC_010660	ACA	2	6	170475	170480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734472
3557	NC_010660	AAT	2	6	170638	170643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734472
3558	NC_010660	AG	3	6	170653	170658	50 %	0 %	50 %	0 %	187734472
3559	NC_010660	T	7	7	170661	170667	0 %	100 %	0 %	0 %	187734472
3560	NC_010660	GAAT	2	8	170715	170722	50 %	25 %	25 %	0 %	187734472
3561	NC_010660	ATC	2	6	170751	170756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734472
3562	NC_010660	ACA	2	6	170838	170843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734472
3563	NC_010660	ACAA	2	8	170897	170904	75 %	0 %	0 %	25 %	187734472
3564	NC_010660	CAG	2	6	171073	171078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734472
3565	NC_010660	TGC	2	6	171090	171095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734472
3566	NC_010660	CCT	2	6	171156	171161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734472
3567	NC_010660	GCTCT	2	10	171205	171214	0 %	40 %	20 %	40 %	187734472
3568	NC_010660	GGA	2	6	171249	171254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734472
3569	NC_010660	GAAT	2	8	171444	171451	50 %	25 %	25 %	0 %	187734472
3570	NC_010660	GCAG	2	8	171522	171529	25 %	0 %	50 %	25 %	187734472
3571	NC_010660	GATGCG	2	12	171610	171621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187734472
3572	NC_010660	CTGA	2	8	171679	171686	25 %	25 %	25 %	25 %	187734472
3573	NC_010660	CGG	2	6	171819	171824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734293
3574	NC_010660	CTC	2	6	171830	171835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734293
3575	NC_010660	CAA	2	6	171845	171850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734293
3576	NC_010660	GCC	2	6	171857	171862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734293
3577	NC_010660	TA	3	6	171910	171915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_010660	TA	3	6	171921	171926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_010660	GCA	2	6	172077	172082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734405
3580	NC_010660	CTG	3	9	172169	172177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734405
3581	NC_010660	ATG	2	6	172215	172220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734405
3582	NC_010660	CAGGA	2	10	172248	172257	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_010660	GTA	2	6	172267	172272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_010660	GCC	2	6	172295	172300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_010660	CAGC	2	8	172329	172336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_010660	GGCAG	2	10	172342	172351	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_010660	GGAA	2	8	172378	172385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010660	CA	3	6	172395	172400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_010660	TG	3	6	172422	172427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_010660	ATT	2	6	172488	172493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734275
3591	NC_010660	AAT	3	9	172515	172523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734275
3592	NC_010660	CAG	2	6	172582	172587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734275
3593	NC_010660	GTT	2	6	172725	172730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734275
3594	NC_010660	TGC	2	6	172762	172767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734275
3595	NC_010660	ATA	2	6	172816	172821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734275
3596	NC_010660	AG	3	6	172823	172828	50 %	0 %	50 %	0 %	187734275
3597	NC_010660	TGAGT	2	10	172859	172868	20 %	40 %	40 %	0 %	187734275
3598	NC_010660	AAAG	2	8	172911	172918	75 %	0 %	25 %	0 %	187734275
3599	NC_010660	TGT	2	6	173070	173075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734392
3600	NC_010660	TCAGAT	2	12	173077	173088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187734392
3601	NC_010660	GCCA	2	8	173164	173171	25 %	0 %	25 %	50 %	187734392
3602	NC_010660	CAG	2	6	173204	173209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734392
3603	NC_010660	AGA	2	6	173214	173219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734392
3604	NC_010660	TCC	2	6	173269	173274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734392
3605	NC_010660	CAGC	2	8	173297	173304	25 %	0 %	25 %	50 %	187734392
3606	NC_010660	ATCAC	2	10	173361	173370	40 %	20 %	0 %	40 %	187734392
3607	NC_010660	T	6	6	173411	173416	0 %	100 %	0 %	0 %	187734392
3608	NC_010660	CAC	2	6	173614	173619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734411
3609	NC_010660	AGGA	2	8	173637	173644	50 %	0 %	50 %	0 %	187734411
3610	NC_010660	ATGGAA	2	12	173651	173662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734411
3611	NC_010660	CAT	2	6	173687	173692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734411
3612	NC_010660	GCA	2	6	173712	173717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734411
3613	NC_010660	T	6	6	173752	173757	0 %	100 %	0 %	0 %	187734411
3614	NC_010660	CGT	2	6	173822	173827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734411
3615	NC_010660	A	6	6	173830	173835	100 %	0 %	0 %	0 %	187734411
3616	NC_010660	AAC	2	6	173867	173872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734411
3617	NC_010660	C	7	7	173885	173891	0 %	0 %	0 %	100 %	187734411
3618	NC_010660	GGTGG	2	10	173943	173952	0 %	20 %	80 %	0 %	187734411
3619	NC_010660	ATG	2	6	174004	174009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734411
3620	NC_010660	TAAA	2	8	174054	174061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_010660	T	7	7	174079	174085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_010660	TGT	2	6	174100	174105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_010660	ATA	2	6	174193	174198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_010660	TTG	2	6	174215	174220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_010660	AT	3	6	174238	174243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_010660	ATC	2	6	174409	174414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734389
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3753	NC_010660	ATC	2	6	180032	180037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3754	NC_010660	T	6	6	180141	180146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3755	NC_010660	TGG	2	6	180217	180222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3756	NC_010660	GCT	2	6	180310	180315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3758	NC_010660	CTT	2	6	180414	180419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3759	NC_010660	TGT	2	6	180420	180425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3761	NC_010660	GGT	2	6	180478	180483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_010660	GACA	2	8	180492	180499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3765	NC_010660	CACGG	2	10	180607	180616	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3771	NC_010660	GCG	2	6	180901	180906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3772	NC_010660	TGG	2	6	180947	180952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3774	NC_010660	TACC	2	8	180987	180994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3775	NC_010660	CGG	2	6	181007	181012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3776	NC_010660	TGG	2	6	181019	181024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3781	NC_010660	GGCT	2	8	181174	181181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3782	NC_010660	TCG	2	6	181189	181194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3784	NC_010660	TCG	2	6	181287	181292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3786	NC_010660	TTC	2	6	181300	181305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3870	NC_010660	GGT	2	6	185927	185932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3872	NC_010660	TGC	2	6	185995	186000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3875	NC_010660	GCA	2	6	186119	186124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3876	NC_010660	TGG	2	6	186184	186189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3877	NC_010660	CAG	2	6	186306	186311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3878	NC_010660	TGC	2	6	186320	186325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3879	NC_010660	TCA	2	6	186334	186339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3880	NC_010660	GCA	2	6	186533	186538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3881	NC_010660	ATG	2	6	186697	186702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3882	NC_010660	GCAGGT	2	12	186728	186739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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3998	NC_010660	CAGA	2	8	192570	192577	50 %	0 %	25 %	25 %	187734439
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4000	NC_010660	AC	3	6	192681	192686	50 %	0 %	0 %	50 %	187734439

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