MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010660	CA	3	6	143142	143147	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_010660	CTG	2	6	143229	143234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_010660	GT	3	6	143237	143242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_010660	CCG	2	6	143253	143258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_010660	TGA	2	6	143315	143320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010660	AAC	2	6	143459	143464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_010660	TCTT	2	8	143525	143532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_010660	GAT	2	6	143574	143579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_010660	CAG	2	6	143671	143676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_010660	CAT	2	6	143680	143685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_010660	T	6	6	143685	143690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_010660	CTTCGC	2	12	143706	143717	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_010660	GCG	2	6	143754	143759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_010660	GGT	2	6	143808	143813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_010660	GAA	2	6	144143	144148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_010660	T	7	7	144151	144157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_010660	AATAT	2	10	144172	144181	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_010660	ATG	2	6	144202	144207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734291
3019	NC_010660	GAC	2	6	144221	144226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734291
3020	NC_010660	TTA	2	6	144304	144309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734291
3021	NC_010660	TGA	2	6	144348	144353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734291
3022	NC_010660	C	6	6	144372	144377	0 %	0 %	0 %	100 %	187734291
3023	NC_010660	TAA	2	6	144446	144451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734291
3024	NC_010660	GTT	2	6	144455	144460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734291
3025	NC_010660	AT	3	6	144510	144515	50 %	50 %	0 %	0 %	187734291
3026	NC_010660	TTG	2	6	144639	144644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734291
3027	NC_010660	ATT	2	6	144661	144666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734291
3028	NC_010660	T	6	6	144702	144707	0 %	100 %	0 %	0 %	187734291
3029	NC_010660	ATTA	2	8	144738	144745	50 %	50 %	0 %	0 %	187734291
3030	NC_010660	AATT	2	8	144753	144760	50 %	50 %	0 %	0 %	187734291
3031	NC_010660	TTG	2	6	144778	144783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734291
3032	NC_010660	AT	3	6	144786	144791	50 %	50 %	0 %	0 %	187734291
3033	NC_010660	ATC	2	6	144879	144884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734291
3034	NC_010660	TAT	2	6	144891	144896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734291
3035	NC_010660	G	6	6	145012	145017	0 %	0 %	100 %	0 %	187734291
3036	NC_010660	TTA	2	6	145033	145038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734291
3037	NC_010660	TGA	2	6	145047	145052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734291
3038	NC_010660	A	6	6	145088	145093	100 %	0 %	0 %	0 %	187734291
3039	NC_010660	T	8	8	145209	145216	0 %	100 %	0 %	0 %	187734291
3040	NC_010660	AT	3	6	145251	145256	50 %	50 %	0 %	0 %	187734291
3041	NC_010660	TTA	2	6	145265	145270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734291
3042	NC_010660	ACTT	2	8	145308	145315	25 %	50 %	0 %	25 %	187734291
3043	NC_010660	ATG	2	6	145343	145348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734291
3044	NC_010660	TTTC	2	8	145354	145361	0 %	75 %	0 %	25 %	187734291
3045	NC_010660	GTTA	2	8	145365	145372	25 %	50 %	25 %	0 %	187734291
3046	NC_010660	AT	4	8	145424	145431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_010660	ATA	2	6	145453	145458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_010660	TTC	2	6	145472	145477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_010660	AGAA	2	8	145660	145667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_010660	ATT	2	6	145706	145711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_010660	TAT	2	6	145716	145721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_010660	T	7	7	145744	145750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_010660	AT	3	6	145788	145793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_010660	AT	3	6	145842	145847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_010660	ATA	2	6	145905	145910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_010660	T	7	7	145935	145941	0 %	100 %	0 %	0 %	187734495
3057	NC_010660	G	8	8	145964	145971	0 %	0 %	100 %	0 %	187734495
3058	NC_010660	A	6	6	145996	146001	100 %	0 %	0 %	0 %	187734495
3059	NC_010660	TGT	2	6	146027	146032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734495
3060	NC_010660	G	6	6	146052	146057	0 %	0 %	100 %	0 %	187734495
3061	NC_010660	ATT	2	6	146126	146131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3062	NC_010660	ATGGA	2	10	146173	146182	40 %	20 %	40 %	0 %	187734495
3063	NC_010660	TA	3	6	146190	146195	50 %	50 %	0 %	0 %	187734495
3064	NC_010660	CTT	2	6	146197	146202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734495
3065	NC_010660	TGG	2	6	146270	146275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3066	NC_010660	ATA	2	6	146284	146289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3067	NC_010660	ATG	2	6	146290	146295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3068	NC_010660	TGG	2	6	146315	146320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3069	NC_010660	AATC	2	8	146351	146358	50 %	25 %	0 %	25 %	187734495
3070	NC_010660	TGG	2	6	146372	146377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3071	NC_010660	GCG	2	6	146380	146385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734495
3072	NC_010660	TGG	2	6	146411	146416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3073	NC_010660	TAA	2	6	146446	146451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3074	NC_010660	ATT	2	6	146460	146465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3075	NC_010660	TGG	2	6	146477	146482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3076	NC_010660	TAGTGA	2	12	146492	146503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3077	NC_010660	G	6	6	146505	146510	0 %	0 %	100 %	0 %	187734495
3078	NC_010660	CAA	2	6	146552	146557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734495
3079	NC_010660	GGT	2	6	146571	146576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3080	NC_010660	AGC	2	6	146637	146642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734495
3081	NC_010660	CT	3	6	146643	146648	0 %	50 %	0 %	50 %	187734495
3082	NC_010660	TGC	2	6	146687	146692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734495
3083	NC_010660	GGTTAT	2	12	146697	146708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187734495
3084	NC_010660	GGT	2	6	146718	146723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3085	NC_010660	CAA	2	6	146756	146761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734495
3086	NC_010660	TGG	2	6	146783	146788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3087	NC_010660	G	6	6	146794	146799	0 %	0 %	100 %	0 %	187734495
3088	NC_010660	AT	3	6	146840	146845	50 %	50 %	0 %	0 %	187734495
3089	NC_010660	AGA	2	6	146858	146863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734495
3090	NC_010660	TGG	2	6	146906	146911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3091	NC_010660	CAA	2	6	146993	146998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734495
3092	NC_010660	AGT	2	6	147141	147146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3093	NC_010660	CAA	2	6	147176	147181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734495
3094	NC_010660	TAT	2	6	147197	147202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3095	NC_010660	AT	3	6	147274	147279	50 %	50 %	0 %	0 %	187734495
3096	NC_010660	ATC	2	6	147282	147287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734495
3097	NC_010660	ACT	2	6	147300	147305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734495
3098	NC_010660	GAAA	2	8	147410	147417	75 %	0 %	25 %	0 %	187734495
3099	NC_010660	CAT	2	6	147462	147467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734495
3100	NC_010660	GGGA	2	8	147508	147515	25 %	0 %	75 %	0 %	187734495
3101	NC_010660	A	7	7	147532	147538	100 %	0 %	0 %	0 %	187734495
3102	NC_010660	TAA	2	6	147626	147631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3103	NC_010660	TTA	2	6	147678	147683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3104	NC_010660	AAT	2	6	147705	147710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3105	NC_010660	T	6	6	147722	147727	0 %	100 %	0 %	0 %	187734495
3106	NC_010660	AAT	2	6	147789	147794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3107	NC_010660	ACA	2	6	147886	147891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734495
3108	NC_010660	GAGG	2	8	147957	147964	25 %	0 %	75 %	0 %	187734495
3109	NC_010660	ATT	2	6	147996	148001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3110	NC_010660	TTC	2	6	148010	148015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734495
3111	NC_010660	TTG	2	6	148048	148053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734495
3112	NC_010660	AGT	2	6	148182	148187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3113	NC_010660	GTA	2	6	148234	148239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3114	NC_010660	CA	3	6	148242	148247	50 %	0 %	0 %	50 %	187734495
3115	NC_010660	TC	3	6	148311	148316	0 %	50 %	0 %	50 %	187734495
3116	NC_010660	TTG	2	6	148339	148344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734495
3117	NC_010660	CTA	2	6	148348	148353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734495
3118	NC_010660	TCAGC	2	10	148358	148367	20 %	20 %	20 %	40 %	187734495
3119	NC_010660	ACC	2	6	148371	148376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734495
3120	NC_010660	TGG	2	6	148394	148399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3121	NC_010660	TGG	2	6	148466	148471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734495
3122	NC_010660	ATG	2	6	148501	148506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734495
3123	NC_010660	TAT	2	6	148520	148525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734495
3124	NC_010660	ATA	2	6	148558	148563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734495
3125	NC_010660	GAAC	2	8	148644	148651	50 %	0 %	25 %	25 %	187734495
3126	NC_010660	TA	3	6	148657	148662	50 %	50 %	0 %	0 %	187734495
3127	NC_010660	GGTT	2	8	148683	148690	0 %	50 %	50 %	0 %	187734495
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3242	NC_010660	GAC	2	6	154935	154940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734500
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3249	NC_010660	CTG	2	6	155325	155330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734500
3250	NC_010660	ATGC	2	8	155344	155351	25 %	25 %	25 %	25 %	187734500
3251	NC_010660	GAA	2	6	155373	155378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734500
3252	NC_010660	CTGA	2	8	155397	155404	25 %	25 %	25 %	25 %	187734500
3253	NC_010660	TGA	2	6	155420	155425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734500
3254	NC_010660	GAC	2	6	155496	155501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734500
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3256	NC_010660	CATC	2	8	155564	155571	25 %	25 %	0 %	50 %	187734500
3257	NC_010660	GTG	2	6	155596	155601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734500
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3260	NC_010660	GGA	2	6	155732	155737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734500
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3264	NC_010660	GCTG	2	8	155857	155864	0 %	25 %	50 %	25 %	187734500
3265	NC_010660	GAT	2	6	155958	155963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734500
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3271	NC_010660	TAC	2	6	156256	156261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_010660	GGA	2	6	156262	156267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_010660	TCT	2	6	156317	156322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_010660	CTG	2	6	156327	156332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3275	NC_010660	TGGC	2	8	156365	156372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3276	NC_010660	AATCTG	2	12	156447	156458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3277	NC_010660	ACA	2	6	156461	156466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3278	NC_010660	ACA	2	6	156689	156694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3279	NC_010660	CCG	2	6	156695	156700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3280	NC_010660	GA	3	6	156732	156737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_010660	GCT	2	6	156751	156756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3282	NC_010660	GTA	2	6	156816	156821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734343
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3285	NC_010660	A	7	7	157164	157170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3286	NC_010660	GTT	2	6	157212	157217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3287	NC_010660	GCC	2	6	157242	157247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3288	NC_010660	ATC	2	6	157348	157353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734404
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3307	NC_010660	TGA	2	6	158614	158619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3320	NC_010660	CTG	2	6	159417	159422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3327	NC_010660	GGT	2	6	159878	159883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3354	NC_010660	A	6	6	161026	161031	100 %	0 %	0 %	0 %	187734303
3355	NC_010660	A	6	6	161084	161089	100 %	0 %	0 %	0 %	187734303
3356	NC_010660	TAATG	2	10	161092	161101	40 %	40 %	20 %	0 %	187734303
3357	NC_010660	A	7	7	161134	161140	100 %	0 %	0 %	0 %	187734303
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3363	NC_010660	TAA	2	6	161382	161387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734303
3364	NC_010660	ATG	2	6	161388	161393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734303
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3371	NC_010660	GAAA	2	8	161645	161652	75 %	0 %	25 %	0 %	187734379
3372	NC_010660	ACA	2	6	161700	161705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734379
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