MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_010658	GCT	2	6	930018	930023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_010658	CTT	2	6	930029	930034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_010658	AG	3	6	930036	930041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_010658	TCGC	2	8	930091	930098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_010658	CTG	2	6	930193	930198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19006	NC_010658	GAT	2	6	930215	930220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730482
19007	NC_010658	GGC	2	6	930293	930298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730482
19008	NC_010658	GAC	2	6	930308	930313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730482
19009	NC_010658	CTC	2	6	930381	930386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730482
19010	NC_010658	CTG	2	6	930411	930416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730482
19011	NC_010658	GGC	2	6	930520	930525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730482
19012	NC_010658	TGT	2	6	930556	930561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730482
19013	NC_010658	AGC	2	6	930615	930620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19014	NC_010658	AGG	2	6	930667	930672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733739
19015	NC_010658	CTG	2	6	930687	930692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19016	NC_010658	CGT	2	6	930792	930797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19017	NC_010658	AGAA	2	8	930832	930839	75 %	0 %	25 %	0 %	187733739
19018	NC_010658	GAC	2	6	930864	930869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19019	NC_010658	ACCCGC	2	12	930897	930908	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	187733739
19020	NC_010658	GCT	2	6	930947	930952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19021	NC_010658	TGC	2	6	930966	930971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19022	NC_010658	GCC	2	6	931011	931016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733739
19023	NC_010658	GCT	2	6	931154	931159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19024	NC_010658	GCC	2	6	931225	931230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733739
19025	NC_010658	CTG	2	6	931254	931259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
19026	NC_010658	ATGC	2	8	931273	931280	25 %	25 %	25 %	25 %	187733739
19027	NC_010658	GAA	2	6	931302	931307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733739
19028	NC_010658	CTGA	2	8	931326	931333	25 %	25 %	25 %	25 %	187733739
19029	NC_010658	TGA	2	6	931349	931354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733739
19030	NC_010658	GAC	2	6	931425	931430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733739
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19032	NC_010658	CATC	2	8	931493	931500	25 %	25 %	0 %	50 %	187733739
19033	NC_010658	GTG	2	6	931525	931530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733739
19034	NC_010658	GCC	2	6	931593	931598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733739
19035	NC_010658	CGCC	2	8	931610	931617	0 %	0 %	25 %	75 %	187733739
19036	NC_010658	GGA	2	6	931661	931666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733739
19037	NC_010658	CGG	2	6	931723	931728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733739
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19040	NC_010658	GCTG	2	8	931786	931793	0 %	25 %	50 %	25 %	187733739
19041	NC_010658	GAT	2	6	931887	931892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733739
19042	NC_010658	GGCTG	2	10	931893	931902	0 %	20 %	60 %	20 %	187733739
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19044	NC_010658	GGATC	2	10	931974	931983	20 %	20 %	40 %	20 %	187733739
19045	NC_010658	GGA	2	6	931986	931991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733739
19046	NC_010658	GCT	2	6	932003	932008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733739
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19048	NC_010658	CGA	2	6	932215	932220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731407
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19050	NC_010658	ACA	2	6	932271	932276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731407
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19052	NC_010658	TGA	2	6	932431	932436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731407
19053	NC_010658	TA	3	6	932533	932538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_010658	GCG	2	6	932543	932548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_010658	AGC	2	6	932568	932573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_010658	CCA	2	6	932627	932632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19057	NC_010658	ACC	2	6	932729	932734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_010658	AAAT	2	8	932824	932831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_010658	TATG	2	8	932837	932844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_010658	GCT	2	6	932897	932902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19062	NC_010658	A	6	6	933039	933044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19063	NC_010658	TTGC	2	8	933046	933053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19064	NC_010658	AG	3	6	933116	933121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_010658	G	6	6	933121	933126	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19074	NC_010658	CAG	2	6	933687	933692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730903
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19088	NC_010658	GTAT	2	8	934404	934411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19094	NC_010658	TGA	2	6	934692	934697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732973
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19104	NC_010658	AGA	2	6	935320	935325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_010658	TA	3	6	935337	935342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19106	NC_010658	TAT	2	6	935349	935354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_010658	TGG	2	6	935358	935363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_010658	A	6	6	935395	935400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19109	NC_010658	A	6	6	935473	935478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_010658	GTG	2	6	935526	935531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_010658	TCG	2	6	935575	935580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19113	NC_010658	GGT	2	6	935714	935719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19114	NC_010658	G	8	8	935764	935771	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19115	NC_010658	AAAAC	2	10	935807	935816	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19116	NC_010658	A	6	6	935891	935896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_010658	A	6	6	935916	935921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19118	NC_010658	CAA	2	6	935939	935944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_010658	ATCC	2	8	935980	935987	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19120	NC_010658	TGT	2	6	935993	935998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19121	NC_010658	TGA	2	6	936011	936016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_010658	GTA	2	6	936055	936060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19248	NC_010658	GCT	2	6	942645	942650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19495	NC_010658	GCC	2	6	954801	954806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730316
19496	NC_010658	CACC	2	8	954815	954822	25 %	0 %	0 %	75 %	187730316
19497	NC_010658	GCG	2	6	954923	954928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730316
19498	NC_010658	CAGT	2	8	954948	954955	25 %	25 %	25 %	25 %	187730316
19499	NC_010658	CCG	2	6	954958	954963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730316
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