MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_010658	TCA	2	6	879552	879557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_010658	GTGG	2	8	879571	879578	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_010658	TTA	2	6	879581	879586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_010658	TA	3	6	879595	879600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_010658	ATC	2	6	879605	879610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_010658	GTC	2	6	879619	879624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_010658	T	6	6	879667	879672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_010658	ATC	2	6	879694	879699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_010658	CAAT	2	8	879858	879865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18010	NC_010658	T	6	6	879966	879971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_010658	AAT	2	6	879989	879994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_010658	T	8	8	880004	880011	0 %	100 %	0 %	0 %	187732247
18013	NC_010658	CAA	2	6	880114	880119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732247
18014	NC_010658	CTT	2	6	880129	880134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732247
18015	NC_010658	CCG	2	6	880142	880147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732247
18016	NC_010658	ATC	2	6	880160	880165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18017	NC_010658	ATC	2	6	880178	880183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18018	NC_010658	CAT	2	6	880225	880230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18019	NC_010658	CG	3	6	880252	880257	0 %	0 %	50 %	50 %	187732247
18020	NC_010658	TCA	2	6	880270	880275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18021	NC_010658	ATA	2	6	880364	880369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732247
18022	NC_010658	GAC	2	6	880432	880437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732247
18023	NC_010658	CGA	2	6	880446	880451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732247
18024	NC_010658	TTA	2	6	880593	880598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732247
18025	NC_010658	GAT	2	6	880613	880618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732247
18026	NC_010658	CG	3	6	880639	880644	0 %	0 %	50 %	50 %	187732247
18027	NC_010658	CAT	2	6	880682	880687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18028	NC_010658	GCG	2	6	880699	880704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732247
18029	NC_010658	TCA	2	6	880719	880724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732247
18030	NC_010658	GATT	2	8	880774	880781	25 %	50 %	25 %	0 %	187732247
18031	NC_010658	ACG	2	6	880787	880792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732247
18032	NC_010658	GTC	2	6	880810	880815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732247
18033	NC_010658	GGC	2	6	880860	880865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732247
18034	NC_010658	GCT	2	6	880887	880892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732247
18035	NC_010658	TAT	2	6	880960	880965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732247
18036	NC_010658	T	8	8	880965	880972	0 %	100 %	0 %	0 %	187732247
18037	NC_010658	AATC	2	8	881008	881015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18038	NC_010658	GCG	2	6	881029	881034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_010658	A	7	7	881055	881061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_010658	ACTG	2	8	881068	881075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18041	NC_010658	TTAA	2	8	881097	881104	50 %	50 %	0 %	0 %	187732045
18042	NC_010658	CGA	2	6	881153	881158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732045
18043	NC_010658	CTG	2	6	881215	881220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
18044	NC_010658	GTG	2	6	881351	881356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732045
18045	NC_010658	ATA	2	6	881383	881388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732045
18046	NC_010658	CTG	2	6	881391	881396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
18047	NC_010658	ACC	2	6	881414	881419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732045
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18049	NC_010658	ACG	2	6	881515	881520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732045
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18053	NC_010658	T	6	6	881740	881745	0 %	100 %	0 %	0 %	187732045
18054	NC_010658	CAA	2	6	881832	881837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732045
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18057	NC_010658	TGC	2	6	881885	881890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
18058	NC_010658	ACG	2	6	881947	881952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732045
18059	NC_010658	GTT	2	6	882009	882014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732045
18060	NC_010658	TGC	2	6	882099	882104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732045
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18062	NC_010658	TCT	2	6	882194	882199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732045
18063	NC_010658	CGAA	2	8	882241	882248	50 %	0 %	25 %	25 %	187732045
18064	NC_010658	GCC	2	6	882312	882317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732045
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18070	NC_010658	T	6	6	882981	882986	0 %	100 %	0 %	0 %	187731578
18071	NC_010658	ATC	4	12	883000	883011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731578
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18077	NC_010658	CGG	2	6	883329	883334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731578
18078	NC_010658	TGC	2	6	883339	883344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731578
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18080	NC_010658	ATC	2	6	883382	883387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_010658	ACT	2	6	883427	883432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18093	NC_010658	GTG	2	6	884108	884113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733900
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18100	NC_010658	CGT	2	6	884286	884291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733450
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18106	NC_010658	TTGAT	2	10	884527	884536	20 %	60 %	20 %	0 %	187733450
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18122	NC_010658	GCG	2	6	885014	885019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_010658	GGC	2	6	885050	885055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732707
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18496	NC_010658	CGCA	2	8	902284	902291	25 %	0 %	25 %	50 %	187730111
18497	NC_010658	TGG	2	6	902306	902311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730111
18498	NC_010658	CCA	2	6	902355	902360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730111
18499	NC_010658	TGG	2	6	902442	902447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730111
18500	NC_010658	CCAGAT	2	12	902493	902504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187730111

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