MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_010658	GCG	2	6	855580	855585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732593
17503	NC_010658	GCC	2	6	855649	855654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732593
17504	NC_010658	ACC	2	6	855756	855761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732593
17505	NC_010658	TGC	2	6	855774	855779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732593
17506	NC_010658	ACA	2	6	855808	855813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732593
17507	NC_010658	TTC	2	6	855823	855828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732593
17508	NC_010658	AAC	2	6	855838	855843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732593
17509	NC_010658	TGC	2	6	855850	855855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732593
17510	NC_010658	TCA	2	6	855914	855919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732593
17511	NC_010658	TTCGAA	2	12	855939	855950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187732593
17512	NC_010658	GCA	2	6	855955	855960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732593
17513	NC_010658	GAT	2	6	855965	855970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732593
17514	NC_010658	GCA	2	6	855977	855982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732593
17515	NC_010658	GAA	2	6	856158	856163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732593
17516	NC_010658	TTG	2	6	856231	856236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_010658	TTAG	2	8	856238	856245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_010658	AT	3	6	856309	856314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_010658	CGG	2	6	856328	856333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17520	NC_010658	ATG	3	9	856347	856355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_010658	ATT	2	6	856373	856378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_010658	CGT	2	6	856405	856410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_010658	GA	3	6	856463	856468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_010658	TGA	2	6	856495	856500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_010658	TCA	2	6	856595	856600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_010658	AGG	2	6	856655	856660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_010658	A	6	6	856731	856736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_010658	TGT	2	6	856879	856884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733080
17529	NC_010658	TCAGAT	2	12	856886	856897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187733080
17530	NC_010658	GCCA	2	8	856973	856980	25 %	0 %	25 %	50 %	187733080
17531	NC_010658	CAG	2	6	857013	857018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733080
17532	NC_010658	AGA	2	6	857023	857028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733080
17533	NC_010658	TCC	2	6	857078	857083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733080
17534	NC_010658	CAGC	2	8	857106	857113	25 %	0 %	25 %	50 %	187733080
17535	NC_010658	ATCAC	2	10	857170	857179	40 %	20 %	0 %	40 %	187733080
17536	NC_010658	T	6	6	857220	857225	0 %	100 %	0 %	0 %	187733080
17537	NC_010658	CAC	2	6	857423	857428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731198
17538	NC_010658	AGGA	2	8	857446	857453	50 %	0 %	50 %	0 %	187731198
17539	NC_010658	ATGGAA	2	12	857460	857471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187731198
17540	NC_010658	CAT	2	6	857496	857501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731198
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17542	NC_010658	CGC	2	6	857566	857571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17543	NC_010658	TCA	2	6	857620	857625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732735
17544	NC_010658	CAG	2	6	857661	857666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732735
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17551	NC_010658	CAT	2	6	857951	857956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732735
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17553	NC_010658	CAAAAC	2	12	858047	858058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732735
17554	NC_010658	TGT	2	6	858065	858070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732735
17555	NC_010658	GAT	2	6	858176	858181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17556	NC_010658	CA	3	6	858218	858223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17557	NC_010658	CAG	2	6	858243	858248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_010658	AGC	2	6	858299	858304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_010658	AGGA	2	8	858337	858344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_010658	CTG	2	6	858352	858357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17561	NC_010658	GCC	2	6	858360	858365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17562	NC_010658	GTT	2	6	858375	858380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_010658	TGC	3	9	858395	858403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_010658	CTC	2	6	858462	858467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17565	NC_010658	AAG	2	6	858469	858474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17566	NC_010658	A	6	6	858494	858499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_010658	TGGA	2	8	858611	858618	25 %	25 %	50 %	0 %	187731591
17568	NC_010658	GCC	2	6	858621	858626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731591
17569	NC_010658	GTC	2	6	858630	858635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
17570	NC_010658	TGA	2	6	858640	858645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731591
17571	NC_010658	TCG	2	6	858703	858708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
17572	NC_010658	GCT	2	6	858718	858723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
17573	NC_010658	CTG	2	6	858819	858824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
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17575	NC_010658	CTG	2	6	858907	858912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
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17577	NC_010658	CTG	2	6	858952	858957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
17578	NC_010658	GCACT	2	10	858968	858977	20 %	20 %	20 %	40 %	187731591
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17581	NC_010658	CGT	2	6	859065	859070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731591
17582	NC_010658	AGTGG	2	10	859075	859084	20 %	20 %	60 %	0 %	187731591
17583	NC_010658	GAA	2	6	859156	859161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731591
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17591	NC_010658	CAGT	2	8	859770	859777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17592	NC_010658	AGG	2	6	859821	859826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_010658	TTA	2	6	859844	859849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_010658	TCA	2	6	859850	859855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17595	NC_010658	TGC	2	6	859939	859944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17597	NC_010658	CTTTT	2	10	859983	859992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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17600	NC_010658	ATTTT	2	10	860089	860098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17601	NC_010658	CAA	2	6	860111	860116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17602	NC_010658	TAAATA	2	12	860179	860190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17603	NC_010658	TTG	2	6	860258	860263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17604	NC_010658	A	8	8	860307	860314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_010658	CAT	2	6	860320	860325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17606	NC_010658	A	6	6	860334	860339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17607	NC_010658	TAA	2	6	860362	860367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17608	NC_010658	CAT	2	6	860374	860379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17609	NC_010658	AAT	2	6	860387	860392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17610	NC_010658	AT	3	6	860420	860425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_010658	TAA	2	6	860439	860444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_010658	ATAA	2	8	860459	860466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_010658	A	6	6	860528	860533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17614	NC_010658	ATA	2	6	860586	860591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731947
17615	NC_010658	AG	3	6	860651	860656	50 %	0 %	50 %	0 %	187731947
17616	NC_010658	CT	3	6	860658	860663	0 %	50 %	0 %	50 %	187731947
17617	NC_010658	GGC	2	6	860673	860678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731947
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17619	NC_010658	TTTA	2	8	860840	860847	25 %	75 %	0 %	0 %	187731947
17620	NC_010658	GCA	2	6	860872	860877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731947
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17622	NC_010658	GGCA	2	8	860983	860990	25 %	0 %	50 %	25 %	187732185
17623	NC_010658	CAT	2	6	861015	861020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732185
17624	NC_010658	GT	3	6	861045	861050	0 %	50 %	50 %	0 %	187732185
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17999	NC_010658	AGAC	2	8	879473	879480	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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