MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_010658	GTT	2	6	657540	657545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_010658	TAAAA	2	10	657706	657715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_010658	ATT	2	6	657746	657751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_010658	AAC	2	6	657853	657858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13505	NC_010658	A	7	7	657874	657880	100 %	0 %	0 %	0 %	187730175
13506	NC_010658	GTT	2	6	657922	657927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730175
13507	NC_010658	GCC	2	6	657952	657957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730175
13508	NC_010658	AAC	2	6	658001	658006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730175
13509	NC_010658	TGA	2	6	658011	658016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730175
13510	NC_010658	A	6	6	658122	658127	100 %	0 %	0 %	0 %	187730175
13511	NC_010658	GCA	2	6	658234	658239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_010658	AAG	2	6	658346	658351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_010658	CAG	2	6	658440	658445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_010658	GTG	2	6	658465	658470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_010658	GTG	2	6	658538	658543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_010658	GTT	2	6	658593	658598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_010658	TGGGC	2	10	658624	658633	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13518	NC_010658	CAG	2	6	658652	658657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_010658	CGG	2	6	658706	658711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_010658	GCAG	2	8	658750	658757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13521	NC_010658	CAGA	2	8	658787	658794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13522	NC_010658	CTG	2	6	658814	658819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_010658	CTT	2	6	658841	658846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_010658	GAA	2	6	658856	658861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_010658	TTG	2	6	659031	659036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_010658	T	7	7	659079	659085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_010658	TGG	2	6	659120	659125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_010658	TGA	2	6	659145	659150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_010658	TTA	2	6	659158	659163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_010658	AGCG	2	8	659197	659204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13531	NC_010658	CCA	2	6	659245	659250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_010658	ACC	2	6	659251	659256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_010658	GGT	2	6	659317	659322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_010658	CAG	2	6	659343	659348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_010658	TGA	2	6	659450	659455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_010658	GAT	2	6	659505	659510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_010658	ATGA	2	8	659546	659553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_010658	T	7	7	659559	659565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_010658	TCAT	2	8	659607	659614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13540	NC_010658	GGT	2	6	659646	659651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_010658	TTG	2	6	659652	659657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_010658	TGC	2	6	659785	659790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_010658	GCCA	2	8	659879	659886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13544	NC_010658	CAC	2	6	659901	659906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13545	NC_010658	CAA	2	6	659975	659980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_010658	CAGC	2	8	660012	660019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13547	NC_010658	T	6	6	660126	660131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_010658	AAT	2	6	660212	660217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_010658	CAC	2	6	660329	660334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13550	NC_010658	AGG	2	6	660352	660357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_010658	CAT	2	6	660402	660407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_010658	GCA	2	6	660427	660432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_010658	AAT	2	6	660473	660478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_010658	GAT	2	6	660580	660585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_010658	CA	3	6	660622	660627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_010658	CAG	2	6	660647	660652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_010658	AGC	2	6	660703	660708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13558	NC_010658	AGGA	2	8	660741	660748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_010658	CTG	2	6	660756	660761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_010658	GCC	2	6	660764	660769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13561	NC_010658	GTT	2	6	660779	660784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_010658	TGC	2	6	660799	660804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_010658	CTC	2	6	660866	660871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13564	NC_010658	AAG	2	6	660873	660878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_010658	A	6	6	660898	660903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_010658	TGGA	2	8	661015	661022	25 %	25 %	50 %	0 %	187734075
13567	NC_010658	GCC	2	6	661025	661030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734075
13568	NC_010658	GTC	2	6	661034	661039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
13569	NC_010658	TGA	2	6	661044	661049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734075
13570	NC_010658	TCG	2	6	661107	661112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
13571	NC_010658	GCT	2	6	661122	661127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
13572	NC_010658	CTG	2	6	661223	661228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
13573	NC_010658	GAAA	2	8	661269	661276	75 %	0 %	25 %	0 %	187734075
13574	NC_010658	CTG	2	6	661311	661316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
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13576	NC_010658	CTG	2	6	661356	661361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
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13580	NC_010658	CGT	2	6	661469	661474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734075
13581	NC_010658	AGTGG	2	10	661479	661488	20 %	20 %	60 %	0 %	187734075
13582	NC_010658	GAA	2	6	661560	661565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734075
13583	NC_010658	CGG	2	6	661568	661573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734075
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13585	NC_010658	GCA	2	6	661669	661674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734075
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13588	NC_010658	TGC	2	6	661851	661856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_010658	ATG	2	6	661876	661881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_010658	TTCCAT	2	12	661906	661917	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187733470
13591	NC_010658	TCCT	2	8	661924	661931	0 %	50 %	0 %	50 %	187733470
13592	NC_010658	GTG	2	6	661949	661954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733470
13593	NC_010658	A	6	6	662152	662157	100 %	0 %	0 %	0 %	187731929
13594	NC_010658	GTGAT	2	10	662198	662207	20 %	40 %	40 %	0 %	187731929
13595	NC_010658	GCTG	2	8	662264	662271	0 %	25 %	50 %	25 %	187731929
13596	NC_010658	GGA	2	6	662294	662299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731929
13597	NC_010658	TCT	2	6	662349	662354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731929
13598	NC_010658	CTG	2	6	662359	662364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731929
13599	NC_010658	TGGC	2	8	662397	662404	0 %	25 %	50 %	25 %	187731929
13600	NC_010658	AATCTG	2	12	662479	662490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187731929
13601	NC_010658	ACA	2	6	662493	662498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731929
13602	NC_010658	TA	3	6	662632	662637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_010658	T	7	7	662658	662664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_010658	GCA	2	6	662765	662770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13606	NC_010658	CTC	2	6	662952	662957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730545
13607	NC_010658	CCGAA	2	10	662964	662973	40 %	0 %	20 %	40 %	187730545
13608	NC_010658	CAGCC	2	10	663042	663051	20 %	0 %	20 %	60 %	187730545
13609	NC_010658	ATC	2	6	663052	663057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730545
13610	NC_010658	CAGC	2	8	663151	663158	25 %	0 %	25 %	50 %	187730545
13611	NC_010658	CAG	2	6	663172	663177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730545
13612	NC_010658	GCT	2	6	663210	663215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730545
13613	NC_010658	CCG	2	6	663216	663221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730545
13614	NC_010658	TCC	2	6	663278	663283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730545
13615	NC_010658	CGG	2	6	663326	663331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730545
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13617	NC_010658	GGAT	2	8	663443	663450	25 %	25 %	50 %	0 %	187730545
13618	NC_010658	CCG	2	6	663483	663488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730545
13619	NC_010658	GTC	2	6	663514	663519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730545
13620	NC_010658	TCA	2	6	663590	663595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730545
13621	NC_010658	GTCA	2	8	663610	663617	25 %	25 %	25 %	25 %	187730545
13622	NC_010658	CTT	2	6	663636	663641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730545
13623	NC_010658	GCA	2	6	663661	663666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730545
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13625	NC_010658	GGC	2	6	663714	663719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730545
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13998	NC_010658	ATT	2	6	683440	683445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_010658	AAT	2	6	683491	683496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14000	NC_010658	GT	3	6	683502	683507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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