MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010658	CGG	2	6	633038	633043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733089
13002	NC_010658	GCA	2	6	633280	633285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733089
13003	NC_010658	ACCGA	2	10	633387	633396	40 %	0 %	20 %	40 %	187733089
13004	NC_010658	GTC	2	6	633445	633450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733089
13005	NC_010658	CGG	2	6	633476	633481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733089
13006	NC_010658	CAG	2	6	633533	633538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733089
13007	NC_010658	TGG	2	6	633572	633577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733089
13008	NC_010658	GCA	3	9	633578	633586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733089
13009	NC_010658	GTC	2	6	633629	633634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733089
13010	NC_010658	GGGAT	2	10	633702	633711	20 %	20 %	60 %	0 %	187733089
13011	NC_010658	CCTG	2	8	633786	633793	0 %	25 %	25 %	50 %	187733089
13012	NC_010658	ATA	2	6	633809	633814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733089
13013	NC_010658	TGA	2	6	633872	633877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731438
13014	NC_010658	TTC	2	6	633909	633914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731438
13015	NC_010658	CAA	2	6	633915	633920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731438
13016	NC_010658	CGG	2	6	633981	633986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731438
13017	NC_010658	GCA	2	6	634038	634043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731438
13018	NC_010658	AAC	2	6	634045	634050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731438
13019	NC_010658	ACA	2	6	634193	634198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731438
13020	NC_010658	CGT	2	6	634213	634218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731438
13021	NC_010658	CGT	2	6	634342	634347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731438
13022	NC_010658	TGGT	2	8	634418	634425	0 %	50 %	50 %	0 %	187731125
13023	NC_010658	AGT	2	6	634465	634470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731125
13024	NC_010658	CAGC	2	8	634530	634537	25 %	0 %	25 %	50 %	187731125
13025	NC_010658	CAA	2	6	634555	634560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731125
13026	NC_010658	AATC	2	8	634570	634577	50 %	25 %	0 %	25 %	187731125
13027	NC_010658	CAG	2	6	634677	634682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731125
13028	NC_010658	GGT	2	6	634684	634689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731125
13029	NC_010658	GCG	2	6	634693	634698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731125
13030	NC_010658	CAG	2	6	634707	634712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731125
13031	NC_010658	GCG	2	6	634726	634731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731125
13032	NC_010658	ACG	2	6	634738	634743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731125
13033	NC_010658	GC	3	6	634775	634780	0 %	0 %	50 %	50 %	187731125
13034	NC_010658	GCG	2	6	634790	634795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731125
13035	NC_010658	TGG	2	6	634862	634867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731125
13036	NC_010658	TCA	2	6	634880	634885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731125
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13038	NC_010658	ACA	2	6	634946	634951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731125
13039	NC_010658	A	6	6	634957	634962	100 %	0 %	0 %	0 %	187731125
13040	NC_010658	GAT	2	6	634963	634968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731125
13041	NC_010658	GCG	2	6	634969	634974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731125
13042	NC_010658	GCT	2	6	635020	635025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731125
13043	NC_010658	TCA	2	6	635048	635053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731125
13044	NC_010658	CAG	2	6	635095	635100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731125
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13046	NC_010658	ATT	2	6	635192	635197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_010658	GTCGT	2	10	635202	635211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13048	NC_010658	TTG	2	6	635250	635255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_010658	AT	3	6	635277	635282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_010658	GCC	2	6	635283	635288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_010658	CAAA	2	8	635304	635311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_010658	CAC	2	6	635402	635407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_010658	TAGT	2	8	635413	635420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_010658	GTA	2	6	635422	635427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_010658	GTA	2	6	635434	635439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_010658	AGG	2	6	635479	635484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_010658	CGG	2	6	635489	635494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_010658	TCA	2	6	635505	635510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_010658	CCA	2	6	635512	635517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_010658	CCA	2	6	635590	635595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_010658	GCGA	2	8	635660	635667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13062	NC_010658	AGT	2	6	635717	635722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_010658	GTA	2	6	635725	635730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_010658	AGG	2	6	635782	635787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_010658	CGG	2	6	635792	635797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_010658	TCA	2	6	635808	635813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13068	NC_010658	CCA	2	6	635894	635899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13069	NC_010658	AAGCG	2	10	635966	635975	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13070	NC_010658	AC	3	6	635990	635995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_010658	CCA	2	6	636116	636121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13072	NC_010658	A	6	6	636126	636131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_010658	T	6	6	636147	636152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_010658	TGA	2	6	636188	636193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_010658	GCAA	2	8	636213	636220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13076	NC_010658	CCA	2	6	636263	636268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_010658	C	6	6	636411	636416	0 %	0 %	0 %	100 %	187730511
13078	NC_010658	TGA	2	6	636438	636443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730511
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13082	NC_010658	AGA	2	6	636543	636548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730511
13083	NC_010658	GC	3	6	636583	636588	0 %	0 %	50 %	50 %	187730511
13084	NC_010658	A	6	6	636671	636676	100 %	0 %	0 %	0 %	187730511
13085	NC_010658	GAA	2	6	636733	636738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730511
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13087	NC_010658	CTG	2	6	636797	636802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730511
13088	NC_010658	GC	3	6	636813	636818	0 %	0 %	50 %	50 %	187730511
13089	NC_010658	GGT	2	6	636825	636830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730511
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13091	NC_010658	A	6	6	636881	636886	100 %	0 %	0 %	0 %	187730511
13092	NC_010658	ATG	2	6	636977	636982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730511
13093	NC_010658	AAG	2	6	637013	637018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730511
13094	NC_010658	TGC	2	6	637029	637034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730511
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13096	NC_010658	CGGT	2	8	637085	637092	0 %	25 %	50 %	25 %	187730511
13097	NC_010658	CCA	2	6	637094	637099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730511
13098	NC_010658	GCT	2	6	637111	637116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730511
13099	NC_010658	GCA	2	6	637179	637184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730511
13100	NC_010658	GC	3	6	637250	637255	0 %	0 %	50 %	50 %	187730511
13101	NC_010658	AGGA	2	8	637310	637317	50 %	0 %	50 %	0 %	187730511
13102	NC_010658	TGA	2	6	637338	637343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730511
13103	NC_010658	GA	3	6	637352	637357	50 %	0 %	50 %	0 %	187730511
13104	NC_010658	AAT	2	6	637416	637421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_010658	T	7	7	637456	637462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_010658	TC	3	6	637513	637518	0 %	50 %	0 %	50 %	187731340
13107	NC_010658	ACT	2	6	637590	637595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731340
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13111	NC_010658	CATG	2	8	637941	637948	25 %	25 %	25 %	25 %	187731340
13112	NC_010658	TATC	2	8	637956	637963	25 %	50 %	0 %	25 %	187731340
13113	NC_010658	TGA	2	6	637977	637982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731340
13114	NC_010658	TGT	2	6	638007	638012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731340
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13118	NC_010658	GC	3	6	638154	638159	0 %	0 %	50 %	50 %	187731340
13119	NC_010658	TGA	2	6	638174	638179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732863
13120	NC_010658	TTCA	2	8	638200	638207	25 %	50 %	0 %	25 %	187732863
13121	NC_010658	TGG	2	6	638250	638255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732863
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13123	NC_010658	ATCGTG	2	12	638311	638322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732863
13124	NC_010658	TCA	2	6	638349	638354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732863
13125	NC_010658	CCAT	2	8	638370	638377	25 %	25 %	0 %	50 %	187732863
13126	NC_010658	ACG	2	6	638425	638430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732863
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13128	NC_010658	ATTC	2	8	638475	638482	25 %	50 %	0 %	25 %	187732863
13129	NC_010658	GA	3	6	638540	638545	50 %	0 %	50 %	0 %	187732863
13130	NC_010658	CAG	2	6	638553	638558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732863
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13151	NC_010658	ATT	2	6	639201	639206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13152	NC_010658	CAT	2	6	639254	639259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730032
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13229	NC_010658	GCTG	2	8	643543	643550	0 %	25 %	50 %	25 %	187732980
13230	NC_010658	GAA	2	6	643554	643559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732980
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13234	NC_010658	CAA	2	6	643766	643771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732980
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13239	NC_010658	TGT	2	6	643940	643945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732980
13240	NC_010658	CAC	2	6	643965	643970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732980
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13364	NC_010658	GAT	2	6	650772	650777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733339
13365	NC_010658	TGGC	2	8	650797	650804	0 %	25 %	50 %	25 %	187733339
13366	NC_010658	CGGG	2	8	650821	650828	0 %	0 %	75 %	25 %	187733339
13367	NC_010658	GGA	2	6	650995	651000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732888
13368	NC_010658	ATG	2	6	651025	651030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732888
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13370	NC_010658	GGGC	2	8	651255	651262	0 %	0 %	75 %	25 %	187732888
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13472	NC_010658	T	6	6	656103	656108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13473	NC_010658	TAA	2	6	656121	656126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13474	NC_010658	T	6	6	656153	656158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13475	NC_010658	A	7	7	656164	656170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13476	NC_010658	TCAT	2	8	656224	656231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13477	NC_010658	CAA	2	6	656320	656325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734064
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13480	NC_010658	GGT	2	6	656518	656523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13481	NC_010658	TGG	2	6	656599	656604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13482	NC_010658	TG	3	6	656638	656643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_010658	GGC	2	6	656655	656660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13484	NC_010658	GCTG	2	8	656673	656680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13485	NC_010658	TGGG	2	8	656773	656780	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_010658	TGA	2	6	656855	656860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_010658	T	7	7	656995	657001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13488	NC_010658	CAC	2	6	657104	657109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13489	NC_010658	CTG	2	6	657127	657132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13490	NC_010658	TTAA	2	8	657138	657145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13491	NC_010658	CTA	2	6	657172	657177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13492	NC_010658	ACT	2	6	657222	657227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13493	NC_010658	T	6	6	657246	657251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_010658	AGC	2	6	657256	657261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_010658	TGT	2	6	657269	657274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13496	NC_010658	A	6	6	657277	657282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_010658	A	6	6	657420	657425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_010658	GCC	2	6	657426	657431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13499	NC_010658	CTG	2	6	657502	657507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13500	NC_010658	GAT	2	6	657512	657517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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