MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_010658	TCT	2	6	608803	608808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731768
12503	NC_010658	CAG	2	6	608861	608866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12504	NC_010658	GC	3	6	608925	608930	0 %	0 %	50 %	50 %	187731768
12505	NC_010658	ACG	2	6	608999	609004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12506	NC_010658	TTC	2	6	609038	609043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731768
12507	NC_010658	CAC	2	6	609070	609075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731768
12508	NC_010658	CTG	2	6	609106	609111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12509	NC_010658	CAT	2	6	609266	609271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731768
12510	NC_010658	GA	3	6	609294	609299	50 %	0 %	50 %	0 %	187731768
12511	NC_010658	CAG	2	6	609374	609379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12512	NC_010658	CGC	2	6	609440	609445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731768
12513	NC_010658	GC	3	6	609448	609453	0 %	0 %	50 %	50 %	187731768
12514	NC_010658	CA	3	6	609463	609468	50 %	0 %	0 %	50 %	187731768
12515	NC_010658	CAG	2	6	609599	609604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12516	NC_010658	GATC	2	8	609646	609653	25 %	25 %	25 %	25 %	187731768
12517	NC_010658	GCA	2	6	609667	609672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731768
12518	NC_010658	TCA	2	6	609681	609686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731768
12519	NC_010658	TGAAG	2	10	609725	609734	40 %	20 %	40 %	0 %	187731768
12520	NC_010658	AC	3	6	609751	609756	50 %	0 %	0 %	50 %	187731768
12521	NC_010658	CGC	2	6	609965	609970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12522	NC_010658	TGA	2	6	610032	610037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_010658	ATT	2	6	610073	610078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_010658	TAA	2	6	610094	610099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_010658	GAAT	2	8	610107	610114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_010658	AAC	2	6	610211	610216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_010658	TTG	2	6	610218	610223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_010658	GAT	2	6	610240	610245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_010658	TAAA	2	8	610253	610260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_010658	TGT	2	6	610261	610266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_010658	GCC	2	6	610352	610357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_010658	GGA	2	6	610484	610489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_010658	AAT	2	6	610550	610555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_010658	A	6	6	610595	610600	100 %	0 %	0 %	0 %	187730828
12535	NC_010658	TTG	2	6	610692	610697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730828
12536	NC_010658	CTG	2	6	610709	610714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730828
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12538	NC_010658	CTT	2	6	610780	610785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730828
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12542	NC_010658	TTA	2	6	610923	610928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730828
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12547	NC_010658	CTG	2	6	611146	611151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733765
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12554	NC_010658	CT	3	6	611415	611420	0 %	50 %	0 %	50 %	187734213
12555	NC_010658	GGC	2	6	611460	611465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
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12557	NC_010658	TGA	2	6	611636	611641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734213
12558	NC_010658	TATC	2	8	611648	611655	25 %	50 %	0 %	25 %	187734213
12559	NC_010658	CGG	2	6	611687	611692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
12560	NC_010658	GGC	2	6	611699	611704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734213
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12562	NC_010658	CAG	2	6	611760	611765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734213
12563	NC_010658	ACCAC	2	10	611776	611785	40 %	0 %	0 %	60 %	187734213
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12569	NC_010658	AACA	2	8	612105	612112	75 %	0 %	0 %	25 %	187734213
12570	NC_010658	TGG	2	6	612172	612177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734213
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12603	NC_010658	TGT	2	6	613786	613791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732898
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12605	NC_010658	AGCGC	2	10	613913	613922	20 %	0 %	40 %	40 %	187732322
12606	NC_010658	GCAC	2	8	614039	614046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12607	NC_010658	GTA	2	6	614060	614065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_010658	A	6	6	614085	614090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_010658	CTT	2	6	614143	614148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731274
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12611	NC_010658	CTT	2	6	614195	614200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731274
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12619	NC_010658	CTT	2	6	614714	614719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731274
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12622	NC_010658	GTC	2	6	614893	614898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731274
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12663	NC_010658	CCTG	2	8	616954	616961	0 %	25 %	25 %	50 %	187730708
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12725	NC_010658	TAA	2	6	620461	620466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12727	NC_010658	ATG	2	6	620538	620543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12731	NC_010658	CGAT	2	8	620756	620763	25 %	25 %	25 %	25 %	187733166
12732	NC_010658	TCT	2	6	620769	620774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733166
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12983	NC_010658	GCC	2	6	631986	631991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732995
12984	NC_010658	GAT	2	6	632001	632006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732995
12985	NC_010658	G	6	6	632048	632053	0 %	0 %	100 %	0 %	187732995
12986	NC_010658	AAGT	2	8	632165	632172	50 %	25 %	25 %	0 %	187732995
12987	NC_010658	GCA	2	6	632295	632300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732995
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