MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_010658	GTG	2	6	559414	559419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733108
11502	NC_010658	CCGT	2	8	559430	559437	0 %	25 %	25 %	50 %	187733108
11503	NC_010658	GCGT	2	8	559480	559487	0 %	25 %	50 %	25 %	187733108
11504	NC_010658	GTG	2	6	559525	559530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733108
11505	NC_010658	ACG	2	6	559537	559542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733108
11506	NC_010658	CTG	2	6	559566	559571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733108
11507	NC_010658	TGC	2	6	559580	559585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733108
11508	NC_010658	GATC	2	8	559595	559602	25 %	25 %	25 %	25 %	187733108
11509	NC_010658	ACC	2	6	559614	559619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733108
11510	NC_010658	CGA	2	6	559640	559645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733108
11511	NC_010658	ATC	2	6	559647	559652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733108
11512	NC_010658	ATC	2	6	559770	559775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733108
11513	NC_010658	TGCG	2	8	559783	559790	0 %	25 %	50 %	25 %	187733108
11514	NC_010658	ACC	2	6	559845	559850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733108
11515	NC_010658	TCT	2	6	559915	559920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733108
11516	NC_010658	GCC	2	6	559941	559946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733108
11517	NC_010658	TGA	2	6	559955	559960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733108
11518	NC_010658	GAA	2	6	559968	559973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733108
11519	NC_010658	GAA	2	6	559976	559981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733108
11520	NC_010658	ATCA	2	8	560010	560017	50 %	25 %	0 %	25 %	187733108
11521	NC_010658	GCC	2	6	560035	560040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733108
11522	NC_010658	CAC	2	6	560051	560056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733108
11523	NC_010658	CAT	2	6	560093	560098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733108
11524	NC_010658	TCG	2	6	560170	560175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733108
11525	NC_010658	CT	3	6	560204	560209	0 %	50 %	0 %	50 %	187733108
11526	NC_010658	GTG	2	6	560220	560225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733108
11527	NC_010658	TTA	2	6	560315	560320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733108
11528	NC_010658	CCG	2	6	560340	560345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11529	NC_010658	T	6	6	560361	560366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_010658	CT	3	6	560367	560372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_010658	AAT	2	6	560420	560425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_010658	CGG	2	6	560456	560461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_010658	CAG	2	6	560517	560522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732299
11534	NC_010658	CG	3	6	560527	560532	0 %	0 %	50 %	50 %	187732299
11535	NC_010658	TGA	2	6	560557	560562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732299
11536	NC_010658	AGC	2	6	560571	560576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732299
11537	NC_010658	CGC	2	6	560606	560611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732299
11538	NC_010658	AAG	2	6	560751	560756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732299
11539	NC_010658	CGG	2	6	560910	560915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732299
11540	NC_010658	ACCT	2	8	560927	560934	25 %	25 %	0 %	50 %	187732299
11541	NC_010658	CTG	2	6	560987	560992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732299
11542	NC_010658	CGG	2	6	561000	561005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732299
11543	NC_010658	CCTG	2	8	561031	561038	0 %	25 %	25 %	50 %	187732299
11544	NC_010658	ACG	2	6	561081	561086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732299
11545	NC_010658	CGC	2	6	561153	561158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732299
11546	NC_010658	ACG	2	6	561186	561191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732299
11547	NC_010658	ACC	2	6	561221	561226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732299
11548	NC_010658	CA	3	6	561295	561300	50 %	0 %	0 %	50 %	187732299
11549	NC_010658	CTT	2	6	561382	561387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732299
11550	NC_010658	TGG	2	6	561417	561422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732299
11551	NC_010658	GAA	2	6	561452	561457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732299
11552	NC_010658	GCG	2	6	561476	561481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732299
11553	NC_010658	GGC	2	6	561484	561489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732299
11554	NC_010658	GAA	2	6	561503	561508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732299
11555	NC_010658	AG	3	6	561579	561584	50 %	0 %	50 %	0 %	187730605
11556	NC_010658	GAA	2	6	561628	561633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730605
11557	NC_010658	CCG	2	6	561662	561667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730605
11558	NC_010658	GCC	2	6	561741	561746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730605
11559	NC_010658	GGT	2	6	561792	561797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730605
11560	NC_010658	GAAG	2	8	561801	561808	50 %	0 %	50 %	0 %	187730605
11561	NC_010658	TGG	2	6	561851	561856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730605
11562	NC_010658	AGA	2	6	561909	561914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730605
11563	NC_010658	TGCT	2	8	561941	561948	0 %	50 %	25 %	25 %	187730605
11564	NC_010658	AAT	2	6	561983	561988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730605
11565	NC_010658	CCG	2	6	562017	562022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_010658	ACG	2	6	562033	562038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_010658	TAAC	2	8	562049	562056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_010658	ACG	2	6	562069	562074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_010658	CGA	2	6	562082	562087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730106
11570	NC_010658	CA	3	6	562093	562098	50 %	0 %	0 %	50 %	187730106
11571	NC_010658	CAA	2	6	562115	562120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730106
11572	NC_010658	CTG	2	6	562185	562190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730106
11573	NC_010658	CGA	2	6	562226	562231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730106
11574	NC_010658	CG	3	6	562237	562242	0 %	0 %	50 %	50 %	187730106
11575	NC_010658	CAT	2	6	562289	562294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730106
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11577	NC_010658	TCA	2	6	562357	562362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730106
11578	NC_010658	TGC	2	6	562441	562446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730106
11579	NC_010658	TTG	2	6	562639	562644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730106
11580	NC_010658	GAA	2	6	562668	562673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730106
11581	NC_010658	GAT	2	6	562674	562679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730106
11582	NC_010658	GTC	2	6	562699	562704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730106
11583	NC_010658	GC	3	6	562718	562723	0 %	0 %	50 %	50 %	187730106
11584	NC_010658	GAA	2	6	562776	562781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730106
11585	NC_010658	GGT	2	6	562794	562799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730106
11586	NC_010658	ATCGAC	2	12	562845	562856	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187730106
11587	NC_010658	TAT	2	6	562895	562900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730106
11588	NC_010658	GATA	2	8	562967	562974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_010658	CTG	3	9	563019	563027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11590	NC_010658	TTA	2	6	563031	563036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731819
11591	NC_010658	TC	3	6	563062	563067	0 %	50 %	0 %	50 %	187731819
11592	NC_010658	ACG	2	6	563071	563076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11593	NC_010658	GCG	2	6	563085	563090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731819
11594	NC_010658	ATT	2	6	563091	563096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731819
11595	NC_010658	CCG	2	6	563129	563134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731819
11596	NC_010658	TGG	3	9	563257	563265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731819
11597	NC_010658	GGC	2	6	563270	563275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731819
11598	NC_010658	ACC	2	6	563334	563339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731819
11599	NC_010658	GCC	2	6	563358	563363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731819
11600	NC_010658	CT	3	6	563368	563373	0 %	50 %	0 %	50 %	187731819
11601	NC_010658	CTG	2	6	563502	563507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11602	NC_010658	ATG	2	6	563508	563513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731819
11603	NC_010658	CTG	2	6	563523	563528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11604	NC_010658	TGG	3	9	563563	563571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731819
11605	NC_010658	CGT	2	6	563573	563578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11606	NC_010658	CTT	2	6	563703	563708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731819
11607	NC_010658	TAC	2	6	563724	563729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731819
11608	NC_010658	ATC	2	6	563756	563761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731819
11609	NC_010658	CG	3	6	563882	563887	0 %	0 %	50 %	50 %	187731819
11610	NC_010658	ACA	2	6	563917	563922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731819
11611	NC_010658	CAT	2	6	563924	563929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731819
11612	NC_010658	GTC	2	6	564065	564070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11613	NC_010658	AT	3	6	564086	564091	50 %	50 %	0 %	0 %	187731819
11614	NC_010658	GCC	2	6	564095	564100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731819
11615	NC_010658	CTG	2	6	564198	564203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731819
11616	NC_010658	TGCG	2	8	564271	564278	0 %	25 %	50 %	25 %	187731819
11617	NC_010658	GC	3	6	564288	564293	0 %	0 %	50 %	50 %	187731819
11618	NC_010658	GCA	2	6	564304	564309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731819
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11620	NC_010658	CGG	2	6	564325	564330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731819
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11993	NC_010658	TGC	2	6	583143	583148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732387
11994	NC_010658	TGC	2	6	583182	583187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732387
11995	NC_010658	CGA	2	6	583200	583205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732387
11996	NC_010658	CCA	2	6	583256	583261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732387
11997	NC_010658	TGA	2	6	583273	583278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732387
11998	NC_010658	AAC	2	6	583294	583299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730370
11999	NC_010658	CG	3	6	583302	583307	0 %	0 %	50 %	50 %	187730370
12000	NC_010658	GC	3	6	583325	583330	0 %	0 %	50 %	50 %	187730370

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