MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010658	TGC	2	6	535121	535126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730233
11002	NC_010658	CAA	2	6	535128	535133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730233
11003	NC_010658	CCCG	2	8	535255	535262	0 %	0 %	25 %	75 %	187730233
11004	NC_010658	GCCT	2	8	535332	535339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_010658	ATTA	2	8	535343	535350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_010658	TAA	3	9	535357	535365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_010658	ACA	2	6	535385	535390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11008	NC_010658	CA	3	6	535389	535394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_010658	TCA	2	6	535435	535440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_010658	TAAA	2	8	535442	535449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_010658	T	6	6	535463	535468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_010658	TTCA	2	8	535520	535527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11013	NC_010658	TAAAT	2	10	535540	535549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010658	CTT	2	6	535634	535639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_010658	T	7	7	535696	535702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_010658	AGC	2	6	535704	535709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_010658	TGA	2	6	535714	535719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730945
11018	NC_010658	GAC	2	6	535766	535771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730945
11019	NC_010658	TGC	2	6	535811	535816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730945
11020	NC_010658	ATG	2	6	535836	535841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731386
11021	NC_010658	TTCCAT	2	12	535866	535877	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187731386
11022	NC_010658	TCCT	2	8	535884	535891	0 %	50 %	0 %	50 %	187731386
11023	NC_010658	GTG	2	6	535909	535914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731386
11024	NC_010658	A	6	6	536112	536117	100 %	0 %	0 %	0 %	187730407
11025	NC_010658	GTGAT	2	10	536158	536167	20 %	40 %	40 %	0 %	187730407
11026	NC_010658	GCTG	2	8	536224	536231	0 %	25 %	50 %	25 %	187730407
11027	NC_010658	GGA	2	6	536254	536259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730407
11028	NC_010658	TCT	2	6	536309	536314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730407
11029	NC_010658	CTG	2	6	536319	536324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730407
11030	NC_010658	TGGC	2	8	536357	536364	0 %	25 %	50 %	25 %	187730407
11031	NC_010658	AATCTG	2	12	536439	536450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187730407
11032	NC_010658	ACA	2	6	536453	536458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730407
11033	NC_010658	TTA	2	6	536608	536613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_010658	CAGAC	2	10	536712	536721	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11035	NC_010658	GTG	2	6	536775	536780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_010658	TG	3	6	536929	536934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_010658	CAG	2	6	536997	537002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_010658	GGTTCG	2	12	537026	537037	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11039	NC_010658	GAT	2	6	537117	537122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_010658	GCC	2	6	537149	537154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_010658	TCA	2	6	537214	537219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_010658	TCTG	2	8	537228	537235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11043	NC_010658	TAA	2	6	537259	537264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_010658	TTG	2	6	537312	537317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_010658	T	7	7	537377	537383	0 %	100 %	0 %	0 %	187732641
11046	NC_010658	AT	3	6	537385	537390	50 %	50 %	0 %	0 %	187732641
11047	NC_010658	GGC	2	6	537491	537496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732641
11048	NC_010658	T	6	6	537621	537626	0 %	100 %	0 %	0 %	187732641
11049	NC_010658	ATT	2	6	537633	537638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732641
11050	NC_010658	AGGA	2	8	537665	537672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_010658	TGT	2	6	537833	537838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732997
11052	NC_010658	TCAGAT	2	12	537840	537851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187732997
11053	NC_010658	GCCA	2	8	537927	537934	25 %	0 %	25 %	50 %	187732997
11054	NC_010658	CAG	2	6	537967	537972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732997
11055	NC_010658	AGA	2	6	537977	537982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732997
11056	NC_010658	TCC	2	6	538032	538037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187732997
11057	NC_010658	CAGC	2	8	538060	538067	25 %	0 %	25 %	50 %	187732997
11058	NC_010658	ATCAC	2	10	538124	538133	40 %	20 %	0 %	40 %	187732997
11059	NC_010658	T	6	6	538174	538179	0 %	100 %	0 %	0 %	187732997
11060	NC_010658	CAC	2	6	538377	538382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731229
11061	NC_010658	AGGA	2	8	538400	538407	50 %	0 %	50 %	0 %	187731229
11062	NC_010658	ATGGAA	2	12	538414	538425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187731229
11063	NC_010658	CAT	2	6	538450	538455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731229
11064	NC_010658	GCA	2	6	538475	538480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731229
11065	NC_010658	TGA	2	6	538486	538491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731229
11066	NC_010658	CAG	2	6	538516	538521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731229
11067	NC_010658	GAC	2	6	538549	538554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_010658	TTG	2	6	538600	538605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_010658	GTT	2	6	538617	538622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_010658	GCG	2	6	538633	538638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_010658	AT	3	6	538677	538682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_010658	A	6	6	538745	538750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_010658	CTT	2	6	538828	538833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731424
11074	NC_010658	TTC	2	6	538853	538858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731424
11075	NC_010658	GACG	2	8	538905	538912	25 %	0 %	50 %	25 %	187731424
11076	NC_010658	CG	3	6	538911	538916	0 %	0 %	50 %	50 %	187731424
11077	NC_010658	GTCA	2	8	538931	538938	25 %	25 %	25 %	25 %	187731424
11078	NC_010658	CCG	2	6	538950	538955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731424
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11080	NC_010658	GC	3	6	538988	538993	0 %	0 %	50 %	50 %	187731424
11081	NC_010658	CTGC	2	8	539080	539087	0 %	25 %	25 %	50 %	187731424
11082	NC_010658	CCG	2	6	539173	539178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731424
11083	NC_010658	CAG	2	6	539180	539185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731424
11084	NC_010658	ATG	3	9	539190	539198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731424
11085	NC_010658	AGGA	2	8	539238	539245	50 %	0 %	50 %	0 %	187731424
11086	NC_010658	CT	3	6	539256	539261	0 %	50 %	0 %	50 %	187731424
11087	NC_010658	CGC	2	6	539263	539268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731424
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11089	NC_010658	ATC	2	6	539367	539372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731424
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11091	NC_010658	TCA	2	6	539473	539478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731424
11092	NC_010658	CAG	2	6	539558	539563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731424
11093	NC_010658	GGA	2	6	539582	539587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731424
11094	NC_010658	AGGTTG	2	12	539667	539678	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187731424
11095	NC_010658	CGC	2	6	539762	539767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731424
11096	NC_010658	TCG	2	6	539847	539852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731424
11097	NC_010658	CAG	2	6	539888	539893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731424
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11102	NC_010658	ACC	2	6	540026	540031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731424
11103	NC_010658	T	6	6	540032	540037	0 %	100 %	0 %	0 %	187731424
11104	NC_010658	TTC	2	6	540218	540223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731424
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11106	NC_010658	ATA	2	6	540350	540355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731424
11107	NC_010658	AATCA	2	10	540380	540389	60 %	20 %	0 %	20 %	187731424
11108	NC_010658	TGT	2	6	540393	540398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731424
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11110	NC_010658	CCG	2	6	540488	540493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734127
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11112	NC_010658	TGC	2	6	540527	540532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734127
11113	NC_010658	GGTGTT	2	12	540543	540554	0 %	50 %	50 %	0 %	187734127
11114	NC_010658	CAG	2	6	540615	540620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734127
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11117	NC_010658	CGCT	2	8	540741	540748	0 %	25 %	25 %	50 %	187734127
11118	NC_010658	GCTTC	2	10	540821	540830	0 %	40 %	20 %	40 %	187734127
11119	NC_010658	AGC	2	6	540873	540878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734127
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11121	NC_010658	TGGC	2	8	540952	540959	0 %	25 %	50 %	25 %	187734127
11122	NC_010658	TCA	3	9	540976	540984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734127
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11124	NC_010658	TTG	2	6	541115	541120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11247	NC_010658	GTC	2	6	547563	547568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732427
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11251	NC_010658	GAT	2	6	547719	547724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732427
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11256	NC_010658	GAT	2	6	547876	547881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11260	NC_010658	TTG	2	6	547925	547930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11351	NC_010658	GGCG	2	8	551801	551808	0 %	0 %	75 %	25 %	187733720
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