MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010658	CG	3	6	487019	487024	0 %	0 %	50 %	50 %	187734184
10002	NC_010658	GTT	2	6	487030	487035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734184
10003	NC_010658	A	6	6	487044	487049	100 %	0 %	0 %	0 %	187734184
10004	NC_010658	CTT	2	6	487068	487073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734184
10005	NC_010658	AGT	2	6	487084	487089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734184
10006	NC_010658	CGA	2	6	487099	487104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734184
10007	NC_010658	TGT	2	6	487129	487134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734184
10008	NC_010658	TTTA	2	8	487149	487156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_010658	CAC	2	6	487285	487290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_010658	GC	3	6	487308	487313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10011	NC_010658	GCA	2	6	487318	487323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_010658	ACC	2	6	487672	487677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_010658	ATT	2	6	487700	487705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_010658	AGCG	2	8	487707	487714	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10015	NC_010658	GCA	2	6	487766	487771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_010658	CGC	2	6	487781	487786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_010658	TTC	2	6	487919	487924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_010658	TGG	2	6	488194	488199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_010658	GAT	2	6	488223	488228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_010658	GGC	2	6	488267	488272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_010658	AAG	2	6	488337	488342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_010658	GCA	2	6	488358	488363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_010658	AAC	2	6	488428	488433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730141
10024	NC_010658	GCA	2	6	488462	488467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730141
10025	NC_010658	TCG	2	6	488470	488475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730141
10026	NC_010658	TAT	2	6	488504	488509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730141
10027	NC_010658	TCCCA	2	10	488512	488521	20 %	20 %	0 %	60 %	187730141
10028	NC_010658	ATG	3	9	488669	488677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730141
10029	NC_010658	TGC	2	6	488688	488693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730141
10030	NC_010658	ATG	2	6	488713	488718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_010658	CCT	2	6	488763	488768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_010658	GTG	2	6	488786	488791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_010658	ATT	2	6	488903	488908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_010658	A	6	6	488989	488994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_010658	GCTG	2	8	489101	489108	0 %	25 %	50 %	25 %	187732781
10036	NC_010658	GTT	2	6	489139	489144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732781
10037	NC_010658	GTG	2	6	489214	489219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732781
10038	NC_010658	TGGC	2	8	489234	489241	0 %	25 %	50 %	25 %	187732781
10039	NC_010658	GCA	2	6	489330	489335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732781
10040	NC_010658	TG	3	6	489517	489522	0 %	50 %	50 %	0 %	187733791
10041	NC_010658	TGGGT	2	10	489530	489539	0 %	40 %	60 %	0 %	187733791
10042	NC_010658	GCA	2	6	489566	489571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733791
10043	NC_010658	T	8	8	489573	489580	0 %	100 %	0 %	0 %	187733791
10044	NC_010658	GTG	2	6	489584	489589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733791
10045	NC_010658	GTT	2	6	489594	489599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733791
10046	NC_010658	ATC	2	6	489723	489728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733791
10047	NC_010658	GTT	2	6	489773	489778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733791
10048	NC_010658	CGTT	2	8	489816	489823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_010658	TTC	2	6	489837	489842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_010658	CCG	2	6	489908	489913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_010658	AGG	2	6	489916	489921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_010658	T	6	6	489974	489979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_010658	AAAT	2	8	489993	490000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_010658	T	7	7	490030	490036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_010658	AGC	2	6	490051	490056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_010658	AAT	2	6	490057	490062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_010658	GCC	2	6	490143	490148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_010658	AGC	2	6	490179	490184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_010658	GCCT	2	8	490278	490285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_010658	TGA	2	6	490321	490326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_010658	TCG	2	6	490423	490428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_010658	GTT	2	6	490436	490441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_010658	TGGCGA	2	12	490451	490462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10064	NC_010658	ATC	2	6	490498	490503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_010658	GCC	2	6	490507	490512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_010658	CTGG	2	8	490571	490578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_010658	CGT	2	6	490692	490697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_010658	T	7	7	490817	490823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_010658	GCC	2	6	490878	490883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_010658	CT	3	6	490998	491003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_010658	AATA	2	8	491093	491100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_010658	TAG	2	6	491112	491117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_010658	CTGT	2	8	491118	491125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10074	NC_010658	TA	3	6	491129	491134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_010658	ATT	2	6	491180	491185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_010658	AGA	2	6	491189	491194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_010658	TAT	2	6	491197	491202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_010658	ATTA	2	8	491330	491337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_010658	GAAAT	2	10	491359	491368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10082	NC_010658	TTA	2	6	491499	491504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_010658	TGT	2	6	491633	491638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730184
10084	NC_010658	TCAGAT	2	12	491640	491651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187730184
10085	NC_010658	GCCA	2	8	491727	491734	25 %	0 %	25 %	50 %	187730184
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10087	NC_010658	AGA	2	6	491777	491782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730184
10088	NC_010658	TCC	2	6	491832	491837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_010658	CAGC	2	8	491860	491867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_010658	GCA	2	6	491914	491919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_010658	GATCC	2	10	492110	492119	20 %	20 %	20 %	40 %	187733556
10094	NC_010658	GAA	2	6	492120	492125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733556
10095	NC_010658	CAGCC	2	10	492191	492200	20 %	0 %	20 %	60 %	187733556
10096	NC_010658	ATC	2	6	492201	492206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733556
10097	NC_010658	CAGC	2	8	492300	492307	25 %	0 %	25 %	50 %	187733556
10098	NC_010658	CAG	2	6	492321	492326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
10099	NC_010658	GCT	2	6	492359	492364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733556
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10104	NC_010658	GGAT	2	8	492592	492599	25 %	25 %	50 %	0 %	187733556
10105	NC_010658	CCG	2	6	492632	492637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733556
10106	NC_010658	GTC	2	6	492663	492668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733556
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10108	NC_010658	GTCA	2	8	492759	492766	25 %	25 %	25 %	25 %	187733556
10109	NC_010658	CTT	2	6	492785	492790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733556
10110	NC_010658	GCA	2	6	492810	492815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
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10112	NC_010658	GGC	2	6	492863	492868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733556
10113	NC_010658	CAG	2	6	492933	492938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
10114	NC_010658	CGG	2	6	493076	493081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733556
10115	NC_010658	GCA	2	6	493122	493127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
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10117	NC_010658	TGCGGG	2	12	493184	493195	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187733556
10118	NC_010658	GTC	2	6	493224	493229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733556
10119	NC_010658	CTTT	2	8	493252	493259	0 %	75 %	0 %	25 %	187733556
10120	NC_010658	ACG	2	6	493296	493301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
10121	NC_010658	CAG	2	6	493401	493406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733556
10122	NC_010658	CCT	2	6	493421	493426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733556
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10249	NC_010658	ATC	3	9	499496	499504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731325
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10251	NC_010658	AAG	3	9	499572	499580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731325
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10254	NC_010658	GGC	2	6	499671	499676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10265	NC_010658	GACT	2	8	500308	500315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10270	NC_010658	GGT	2	6	500585	500590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10274	NC_010658	GCGCT	2	10	500677	500686	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10275	NC_010658	A	6	6	500691	500696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10280	NC_010658	A	6	6	500879	500884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10281	NC_010658	CAA	2	6	500895	500900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10282	NC_010658	TTG	2	6	500940	500945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10283	NC_010658	TGT	2	6	500987	500992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10497	NC_010658	TGA	2	6	512112	512117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10498	NC_010658	TGG	2	6	512132	512137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_010658	TGA	2	6	512190	512195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10500	NC_010658	GCT	2	6	512454	512459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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