MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90003	NC_010658	TCG	2	6	4429478	4429483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732712
90004	NC_010658	TAA	2	6	4429484	4429489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732712
90005	NC_010658	TGA	2	6	4429518	4429523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732712
90006	NC_010658	AGC	2	6	4429570	4429575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732712
90007	NC_010658	AGC	2	6	4429585	4429590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732712
90008	NC_010658	CGG	2	6	4429599	4429604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732712
90009	NC_010658	CGC	2	6	4429623	4429628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732712
90010	NC_010658	ATG	2	6	4429643	4429648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732712
90011	NC_010658	AAT	2	6	4429669	4429674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732712
90012	NC_010658	GAA	2	6	4429744	4429749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732712
90013	NC_010658	GC	3	6	4429752	4429757	0 %	0 %	50 %	50 %	187732712
90014	NC_010658	TCGAGG	2	12	4429796	4429807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187732712
90015	NC_010658	T	6	6	4429819	4429824	0 %	100 %	0 %	0 %	187732712
90016	NC_010658	GCC	2	6	4429860	4429865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732712
90017	NC_010658	AGAT	2	8	4429906	4429913	50 %	25 %	25 %	0 %	187732712
90018	NC_010658	CAG	2	6	4429923	4429928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732712
90019	NC_010658	TTG	2	6	4429966	4429971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732712
90020	NC_010658	TG	3	6	4429970	4429975	0 %	50 %	50 %	0 %	187732712
90021	NC_010658	CAG	2	6	4430020	4430025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732712
90022	NC_010658	CT	3	6	4430126	4430131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90023	NC_010658	T	6	6	4430131	4430136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90024	NC_010658	TGA	2	6	4430154	4430159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90025	NC_010658	GGA	2	6	4430173	4430178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90026	NC_010658	GTTG	2	8	4430198	4430205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90027	NC_010658	TGA	2	6	4430240	4430245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90028	NC_010658	T	6	6	4430264	4430269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90029	NC_010658	AAATC	2	10	4430279	4430288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90030	NC_010658	CAC	2	6	4430302	4430307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90031	NC_010658	GCT	2	6	4430371	4430376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730486
90032	NC_010658	ATA	2	6	4430430	4430435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730486
90033	NC_010658	GTA	2	6	4430454	4430459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730486
90034	NC_010658	ATC	2	6	4430472	4430477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730486
90035	NC_010658	TAA	2	6	4430485	4430490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730486
90036	NC_010658	ATTT	2	8	4430496	4430503	25 %	75 %	0 %	0 %	187730486
90037	NC_010658	AAAAG	2	10	4430542	4430551	80 %	0 %	20 %	0 %	187730486
90038	NC_010658	TCT	2	6	4430569	4430574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730486
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90043	NC_010658	ATT	2	6	4430832	4430837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730486
90044	NC_010658	TATCA	2	10	4430867	4430876	40 %	40 %	0 %	20 %	187730486
90045	NC_010658	C	6	6	4430886	4430891	0 %	0 %	0 %	100 %	187730486
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90051	NC_010658	CTGG	2	8	4431281	4431288	0 %	25 %	50 %	25 %	187731906
90052	NC_010658	TTC	2	6	4431369	4431374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731906
90053	NC_010658	CGG	2	6	4431378	4431383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731906
90054	NC_010658	ATC	2	6	4431444	4431449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731906
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90060	NC_010658	GGTT	2	8	4431570	4431577	0 %	50 %	50 %	0 %	187731906
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90063	NC_010658	TAT	2	6	4431683	4431688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90072	NC_010658	TCG	2	6	4432033	4432038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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90237	NC_010658	TTAA	2	8	4440228	4440235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90238	NC_010658	ACCG	2	8	4440365	4440372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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90240	NC_010658	TAA	2	6	4440576	4440581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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