MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
86501	NC_010658	TGA	2	6	4260140	4260145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730242
86502	NC_010658	GCG	2	6	4260163	4260168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730242
86503	NC_010658	AG	3	6	4260275	4260280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86504	NC_010658	GCG	2	6	4260292	4260297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86505	NC_010658	TGTGT	2	10	4260347	4260356	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86506	NC_010658	AGA	2	6	4260389	4260394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86507	NC_010658	GAT	2	6	4260401	4260406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86508	NC_010658	T	6	6	4260415	4260420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86509	NC_010658	CAT	2	6	4260422	4260427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733486
86510	NC_010658	TTA	2	6	4260482	4260487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733486
86511	NC_010658	AAAC	2	8	4260546	4260553	75 %	0 %	0 %	25 %	187733486
86512	NC_010658	GC	3	6	4260555	4260560	0 %	0 %	50 %	50 %	187733486
86513	NC_010658	CCA	2	6	4260564	4260569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733486
86514	NC_010658	GAT	2	6	4260613	4260618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733486
86515	NC_010658	AAT	2	6	4260655	4260660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733486
86516	NC_010658	CAT	3	9	4260714	4260722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733486
86517	NC_010658	ACTC	2	8	4260810	4260817	25 %	25 %	0 %	50 %	187733486
86518	NC_010658	CGC	2	6	4260853	4260858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733486
86519	NC_010658	CAC	2	6	4260865	4260870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733486
86520	NC_010658	ACGCCA	2	12	4260912	4260923	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187733486
86521	NC_010658	ACA	2	6	4260936	4260941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733486
86522	NC_010658	GC	5	10	4261005	4261014	0 %	0 %	50 %	50 %	187733486
86523	NC_010658	CGC	2	6	4261032	4261037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733486
86524	NC_010658	CAC	2	6	4261102	4261107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733486
86525	NC_010658	GC	3	6	4261118	4261123	0 %	0 %	50 %	50 %	187733486
86526	NC_010658	CCAC	2	8	4261185	4261192	25 %	0 %	0 %	75 %	187733486
86527	NC_010658	AGC	2	6	4261214	4261219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733486
86528	NC_010658	CAG	2	6	4261267	4261272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733486
86529	NC_010658	ACTCC	2	10	4261288	4261297	20 %	20 %	0 %	60 %	187733486
86530	NC_010658	T	7	7	4261301	4261307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86531	NC_010658	AAC	2	6	4261349	4261354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730868
86532	NC_010658	GAT	2	6	4261442	4261447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730868
86533	NC_010658	ACG	2	6	4261526	4261531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730868
86534	NC_010658	GCA	2	6	4261605	4261610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730868
86535	NC_010658	TTC	2	6	4261618	4261623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730868
86536	NC_010658	ATC	2	6	4261658	4261663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730868
86537	NC_010658	CTG	2	6	4261684	4261689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730868
86538	NC_010658	TCC	2	6	4261712	4261717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730868
86539	NC_010658	CAGGG	2	10	4261747	4261756	20 %	0 %	60 %	20 %	187730868
86540	NC_010658	AGCGC	2	10	4261770	4261779	20 %	0 %	40 %	40 %	187730868
86541	NC_010658	CAA	2	6	4261898	4261903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86542	NC_010658	CAA	2	6	4261909	4261914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86543	NC_010658	CCA	2	6	4262336	4262341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733071
86544	NC_010658	AAC	2	6	4262356	4262361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733071
86545	NC_010658	TCG	2	6	4262562	4262567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733071
86546	NC_010658	A	6	6	4262620	4262625	100 %	0 %	0 %	0 %	187733071
86547	NC_010658	CTG	2	6	4262699	4262704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733071
86548	NC_010658	GGGCAT	2	12	4262750	4262761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187733071
86549	NC_010658	GAT	2	6	4262770	4262775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733071
86550	NC_010658	TCT	2	6	4262808	4262813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733071
86551	NC_010658	CGT	2	6	4262926	4262931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733071
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86554	NC_010658	AGG	2	6	4262981	4262986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733071
86555	NC_010658	GTA	2	6	4263013	4263018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733071
86556	NC_010658	TTA	2	6	4263050	4263055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733071
86557	NC_010658	GCA	2	6	4263176	4263181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733071
86558	NC_010658	A	6	6	4263272	4263277	100 %	0 %	0 %	0 %	187733071
86559	NC_010658	CCCCG	2	10	4263292	4263301	0 %	0 %	20 %	80 %	187733071
86560	NC_010658	TTG	2	6	4263389	4263394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733071
86561	NC_010658	TGTC	2	8	4263446	4263453	0 %	50 %	25 %	25 %	187733071
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86563	NC_010658	A	6	6	4263479	4263484	100 %	0 %	0 %	0 %	187733071
86564	NC_010658	CGG	2	6	4263553	4263558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86565	NC_010658	ACC	2	6	4263760	4263765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732626
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86568	NC_010658	TTA	2	6	4263826	4263831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732626
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86572	NC_010658	A	7	7	4263975	4263981	100 %	0 %	0 %	0 %	187732626
86573	NC_010658	ATCA	2	8	4263993	4264000	50 %	25 %	0 %	25 %	187732626
86574	NC_010658	TAA	2	6	4264025	4264030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732626
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86582	NC_010658	T	6	6	4264571	4264576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86583	NC_010658	AAT	2	6	4264657	4264662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86584	NC_010658	CAC	2	6	4264774	4264779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86585	NC_010658	AGG	2	6	4264797	4264802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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86587	NC_010658	GCA	2	6	4264872	4264877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86588	NC_010658	TA	3	6	4264923	4264928	50 %	50 %	0 %	0 %	187732554
86589	NC_010658	TTC	2	6	4264948	4264953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732554
86590	NC_010658	TTA	2	6	4264972	4264977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732554
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86592	NC_010658	AT	3	6	4265111	4265116	50 %	50 %	0 %	0 %	187732554
86593	NC_010658	AAT	2	6	4265120	4265125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732554
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86596	NC_010658	CTCTG	2	10	4265250	4265259	0 %	40 %	20 %	40 %	187732554
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86603	NC_010658	GTT	2	6	4265737	4265742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86604	NC_010658	AT	3	6	4265755	4265760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86605	NC_010658	ATAA	2	8	4265768	4265775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86606	NC_010658	GTA	2	6	4265815	4265820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86607	NC_010658	CTA	2	6	4265830	4265835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86608	NC_010658	TAT	2	6	4265836	4265841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86609	NC_010658	CAT	2	6	4265854	4265859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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86611	NC_010658	CCA	2	6	4265880	4265885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86612	NC_010658	AAATA	2	10	4265927	4265936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86613	NC_010658	GAA	3	9	4266025	4266033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86614	NC_010658	A	6	6	4266046	4266051	100 %	0 %	0 %	0 %	187731176
86615	NC_010658	ATG	2	6	4266083	4266088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731176
86616	NC_010658	TTCCAT	2	12	4266113	4266124	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187731176
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