MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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84502	NC_010658	GGT	2	6	4159806	4159811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730050
84503	NC_010658	GCC	2	6	4159836	4159841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730050
84504	NC_010658	AAT	2	6	4159875	4159880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730050
84505	NC_010658	GC	3	6	4159888	4159893	0 %	0 %	50 %	50 %	187730050
84506	NC_010658	CGA	2	6	4159970	4159975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730050
84507	NC_010658	GCT	2	6	4160042	4160047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730050
84508	NC_010658	GCAG	2	8	4160342	4160349	25 %	0 %	50 %	25 %	187730050
84509	NC_010658	T	6	6	4160361	4160366	0 %	100 %	0 %	0 %	187730050
84510	NC_010658	TCT	2	6	4160411	4160416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730050
84511	NC_010658	GA	4	8	4160467	4160474	50 %	0 %	50 %	0 %	187730050
84512	NC_010658	CAG	2	6	4160502	4160507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730050
84513	NC_010658	GTG	2	6	4160616	4160621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730050
84514	NC_010658	GAT	2	6	4160681	4160686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730050
84515	NC_010658	CAA	2	6	4160777	4160782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730050
84516	NC_010658	AGCG	2	8	4160783	4160790	25 %	0 %	50 %	25 %	187730050
84517	NC_010658	TTG	2	6	4160847	4160852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730050
84518	NC_010658	AGA	2	6	4160892	4160897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730050
84519	NC_010658	TTGA	2	8	4160934	4160941	25 %	50 %	25 %	0 %	187730050
84520	NC_010658	CCG	2	6	4161007	4161012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730050
84521	NC_010658	CG	3	6	4161044	4161049	0 %	0 %	50 %	50 %	187730050
84522	NC_010658	CGC	2	6	4161083	4161088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730050
84523	NC_010658	ATCGTA	2	12	4161114	4161125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187730050
84524	NC_010658	CTTTG	2	10	4161243	4161252	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84525	NC_010658	CGA	2	6	4161295	4161300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84526	NC_010658	TTCA	2	8	4161376	4161383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84527	NC_010658	CAG	2	6	4161427	4161432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84528	NC_010658	CAA	2	6	4161476	4161481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733100
84529	NC_010658	A	6	6	4161486	4161491	100 %	0 %	0 %	0 %	187733100
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84531	NC_010658	TGG	2	6	4161504	4161509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733100
84532	NC_010658	TGA	2	6	4161649	4161654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733100
84533	NC_010658	TAA	2	6	4161760	4161765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733100
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84538	NC_010658	TTA	2	6	4162042	4162047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733100
84539	NC_010658	ATT	2	6	4162079	4162084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733100
84540	NC_010658	GCT	3	9	4162137	4162145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733704
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84542	NC_010658	CTGC	2	8	4162251	4162258	0 %	25 %	25 %	50 %	187733704
84543	NC_010658	CTG	2	6	4162333	4162338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733704
84544	NC_010658	CTT	2	6	4162383	4162388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733704
84545	NC_010658	TAT	2	6	4162472	4162477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84546	NC_010658	CGC	2	6	4162527	4162532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731935
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84551	NC_010658	GCA	3	9	4162865	4162873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731935
84552	NC_010658	GC	3	6	4162918	4162923	0 %	0 %	50 %	50 %	187731935
84553	NC_010658	CGC	2	6	4163026	4163031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731935
84554	NC_010658	ATC	2	6	4163069	4163074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731935
84555	NC_010658	TCG	2	6	4163099	4163104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731935
84556	NC_010658	GC	4	8	4163172	4163179	0 %	0 %	50 %	50 %	187731935
84557	NC_010658	TCA	2	6	4163216	4163221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731935
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84561	NC_010658	AATC	2	8	4163280	4163287	50 %	25 %	0 %	25 %	187731935
84562	NC_010658	AAC	2	6	4163291	4163296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731935
84563	NC_010658	ATT	2	6	4163314	4163319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731935
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84570	NC_010658	TGAC	2	8	4163480	4163487	25 %	25 %	25 %	25 %	187731935
84571	NC_010658	GCGA	2	8	4163490	4163497	25 %	0 %	50 %	25 %	187731935
84572	NC_010658	CAT	2	6	4163530	4163535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731935
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84577	NC_010658	GAT	2	6	4163806	4163811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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84580	NC_010658	TGA	2	6	4163921	4163926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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84582	NC_010658	A	6	6	4163971	4163976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84583	NC_010658	GCT	2	6	4163982	4163987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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84586	NC_010658	ACCA	2	8	4164096	4164103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84587	NC_010658	ATG	2	6	4164152	4164157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84588	NC_010658	TGC	2	6	4164158	4164163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84589	NC_010658	CGG	2	6	4164195	4164200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84590	NC_010658	TGCG	2	8	4164327	4164334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84591	NC_010658	AT	3	6	4164352	4164357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84592	NC_010658	GTG	2	6	4164404	4164409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84593	NC_010658	ATC	2	6	4164413	4164418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84594	NC_010658	ACG	2	6	4164419	4164424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84595	NC_010658	CG	3	6	4164423	4164428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84596	NC_010658	CGGAA	2	10	4164436	4164445	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84597	NC_010658	CAG	2	6	4164450	4164455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84598	NC_010658	ATG	2	6	4164483	4164488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84599	NC_010658	GCA	2	6	4164496	4164501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84600	NC_010658	ATG	2	6	4164561	4164566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84601	NC_010658	TTG	2	6	4164567	4164572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84602	NC_010658	CAGA	2	8	4164599	4164606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84603	NC_010658	T	6	6	4164616	4164621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84604	NC_010658	GC	3	6	4164639	4164644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84605	NC_010658	GGCTAT	2	12	4164686	4164697	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84606	NC_010658	TAT	2	6	4164722	4164727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84607	NC_010658	TCG	2	6	4164884	4164889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84608	NC_010658	GATGA	2	10	4164899	4164908	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84609	NC_010658	GTA	2	6	4164954	4164959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84610	NC_010658	ACG	2	6	4164992	4164997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84611	NC_010658	GGAT	2	8	4165018	4165025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84612	NC_010658	ATCT	2	8	4165046	4165053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84613	NC_010658	CAA	2	6	4165064	4165069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84614	NC_010658	GCA	2	6	4165094	4165099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84615	NC_010658	GTC	2	6	4165125	4165130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84616	NC_010658	ATG	2	6	4165365	4165370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84617	NC_010658	GC	3	6	4165484	4165489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84618	NC_010658	GTT	2	6	4165510	4165515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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84979	NC_010658	TTG	2	6	4185299	4185304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731358
84980	NC_010658	TTCG	2	8	4185312	4185319	0 %	50 %	25 %	25 %	187731358
84981	NC_010658	CTG	2	6	4185372	4185377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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84983	NC_010658	GCG	2	6	4185691	4185696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731809
84984	NC_010658	CTG	2	6	4185804	4185809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731809
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84990	NC_010658	CGTT	2	8	4186105	4186112	0 %	50 %	25 %	25 %	187731809
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84997	NC_010658	CAT	2	6	4186295	4186300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731809
84998	NC_010658	CGTA	2	8	4186301	4186308	25 %	25 %	25 %	25 %	187731809
84999	NC_010658	TGC	2	6	4186321	4186326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731809
85000	NC_010658	CTG	2	6	4186344	4186349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731809

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