MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_010658	GCC	2	6	4013683	4013688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81502	NC_010658	GAA	2	6	4013731	4013736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81503	NC_010658	A	6	6	4013796	4013801	100 %	0 %	0 %	0 %	187734249
81504	NC_010658	AG	3	6	4013807	4013812	50 %	0 %	50 %	0 %	187734249
81505	NC_010658	GAA	2	6	4013838	4013843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734249
81506	NC_010658	CTG	2	6	4013844	4013849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81507	NC_010658	CAA	2	6	4013886	4013891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734249
81508	NC_010658	AAGC	2	8	4013892	4013899	50 %	0 %	25 %	25 %	187734249
81509	NC_010658	CTG	2	6	4013910	4013915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81510	NC_010658	ACC	2	6	4013952	4013957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734249
81511	NC_010658	CTG	3	9	4013961	4013969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81512	NC_010658	TCA	2	6	4013987	4013992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734249
81513	NC_010658	GCG	2	6	4014066	4014071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734249
81514	NC_010658	GCT	2	6	4014164	4014169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81515	NC_010658	GGA	2	6	4014170	4014175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734249
81516	NC_010658	GGCGCT	2	12	4014185	4014196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187734249
81517	NC_010658	TGC	2	6	4014217	4014222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81518	NC_010658	TGGCTG	2	12	4014237	4014248	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187734249
81519	NC_010658	CTG	2	6	4014285	4014290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81520	NC_010658	TGA	2	6	4014362	4014367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734249
81521	NC_010658	ACG	2	6	4014424	4014429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81522	NC_010658	CTG	3	9	4014450	4014458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81523	NC_010658	GCCT	2	8	4014574	4014581	0 %	25 %	25 %	50 %	187734249
81524	NC_010658	GCT	2	6	4014590	4014595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81525	NC_010658	GC	3	6	4014629	4014634	0 %	0 %	50 %	50 %	187734249
81526	NC_010658	TGC	2	6	4014712	4014717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81527	NC_010658	CTG	2	6	4014810	4014815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81528	NC_010658	GTG	2	6	4014832	4014837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734249
81529	NC_010658	CGT	2	6	4014879	4014884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81530	NC_010658	CGG	2	6	4014907	4014912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734249
81531	NC_010658	GGC	2	6	4014926	4014931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734249
81532	NC_010658	CAGC	2	8	4014947	4014954	25 %	0 %	25 %	50 %	187734249
81533	NC_010658	GTGC	2	8	4014972	4014979	0 %	25 %	50 %	25 %	187734249
81534	NC_010658	ACC	2	6	4015020	4015025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734249
81535	NC_010658	TTCC	2	8	4015034	4015041	0 %	50 %	0 %	50 %	187734249
81536	NC_010658	CAA	2	6	4015100	4015105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734249
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81538	NC_010658	TGG	2	6	4015207	4015212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734249
81539	NC_010658	CTGA	2	8	4015365	4015372	25 %	25 %	25 %	25 %	187734249
81540	NC_010658	CTG	2	6	4015415	4015420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81541	NC_010658	CAAA	2	8	4015460	4015467	75 %	0 %	0 %	25 %	187734249
81542	NC_010658	GCGCTG	2	12	4015470	4015481	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187734249
81543	NC_010658	TGA	2	6	4015484	4015489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734249
81544	NC_010658	CAT	2	6	4015520	4015525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734249
81545	NC_010658	TGA	2	6	4015532	4015537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734249
81546	NC_010658	CGT	2	6	4015566	4015571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734249
81547	NC_010658	CGC	2	6	4015622	4015627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734249
81548	NC_010658	AC	3	6	4015642	4015647	50 %	0 %	0 %	50 %	187734249
81549	NC_010658	CAT	2	6	4015685	4015690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734249
81550	NC_010658	TCA	2	6	4015720	4015725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734249
81551	NC_010658	GAA	2	6	4015862	4015867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734249
81552	NC_010658	CG	3	6	4015927	4015932	0 %	0 %	50 %	50 %	187734249
81553	NC_010658	CG	3	6	4015947	4015952	0 %	0 %	50 %	50 %	187734249
81554	NC_010658	GGC	2	6	4015973	4015978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734249
81555	NC_010658	GAT	2	6	4015996	4016001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734249
81556	NC_010658	TTG	2	6	4016102	4016107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81557	NC_010658	CGC	2	6	4016125	4016130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733140
81558	NC_010658	AAC	2	6	4016141	4016146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733140
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81560	NC_010658	TTAT	2	8	4016285	4016292	25 %	75 %	0 %	0 %	187731367
81561	NC_010658	AAT	2	6	4016366	4016371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731367
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81563	NC_010658	TCCAGT	2	12	4016464	4016475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187731367
81564	NC_010658	TTTCAG	2	12	4016512	4016523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187731367
81565	NC_010658	TGG	2	6	4016545	4016550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81566	NC_010658	TCT	2	6	4016584	4016589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81567	NC_010658	CCAA	2	8	4016655	4016662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81568	NC_010658	TGC	2	6	4016825	4016830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733847
81569	NC_010658	GCCA	2	8	4016919	4016926	25 %	0 %	25 %	50 %	187733847
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81572	NC_010658	CAGC	2	8	4017052	4017059	25 %	0 %	25 %	50 %	187733847
81573	NC_010658	T	6	6	4017166	4017171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81574	NC_010658	AAT	2	6	4017252	4017257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81575	NC_010658	CAC	2	6	4017369	4017374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81576	NC_010658	AGG	2	6	4017392	4017397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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81578	NC_010658	GCA	2	6	4017467	4017472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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81580	NC_010658	ATC	2	6	4017540	4017545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81581	NC_010658	CAA	2	6	4017589	4017594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81582	NC_010658	GTC	2	6	4017630	4017635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81583	NC_010658	ACC	2	6	4017650	4017655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81584	NC_010658	CTC	2	6	4017691	4017696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81585	NC_010658	CAG	2	6	4017817	4017822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81586	NC_010658	C	6	6	4017831	4017836	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
81587	NC_010658	CTG	2	6	4017844	4017849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81588	NC_010658	GCC	2	6	4017884	4017889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81589	NC_010658	AGC	2	6	4017890	4017895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81590	NC_010658	TA	3	6	4018039	4018044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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81592	NC_010658	CA	3	6	4018235	4018240	50 %	0 %	0 %	50 %	187730062
81593	NC_010658	CAG	2	6	4018260	4018265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81594	NC_010658	AGC	2	6	4018316	4018321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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81596	NC_010658	CTG	2	6	4018369	4018374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81597	NC_010658	GCC	2	6	4018377	4018382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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81599	NC_010658	TGC	2	6	4018412	4018417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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81601	NC_010658	AAG	2	6	4018486	4018491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81602	NC_010658	A	6	6	4018511	4018516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81603	NC_010658	TGGA	2	8	4018628	4018635	25 %	25 %	50 %	0 %	187730664
81604	NC_010658	GCC	2	6	4018638	4018643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730664
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81606	NC_010658	TGA	2	6	4018657	4018662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730664
81607	NC_010658	TCG	2	6	4018720	4018725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730664
81608	NC_010658	GCT	2	6	4018735	4018740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730664
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81610	NC_010658	GAAA	2	8	4018882	4018889	75 %	0 %	25 %	0 %	187730664
81611	NC_010658	CTG	2	6	4018924	4018929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730664
81612	NC_010658	GA	4	8	4018938	4018945	50 %	0 %	50 %	0 %	187730664
81613	NC_010658	CTG	2	6	4018969	4018974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730664
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