MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_010658	CGCA	2	8	3843332	3843339	25 %	0 %	25 %	50 %	187730906
78003	NC_010658	CGC	2	6	3843434	3843439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78004	NC_010658	GGC	2	6	3843458	3843463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78005	NC_010658	CAC	2	6	3843491	3843496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733692
78006	NC_010658	CA	3	6	3843604	3843609	50 %	0 %	0 %	50 %	187733692
78007	NC_010658	AAT	2	6	3843610	3843615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733692
78008	NC_010658	CTG	2	6	3843743	3843748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733692
78009	NC_010658	CAA	2	6	3843853	3843858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733692
78010	NC_010658	TGA	2	6	3843882	3843887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733692
78011	NC_010658	TCA	2	6	3843940	3843945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733692
78012	NC_010658	CCA	2	6	3843991	3843996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733692
78013	NC_010658	TCA	2	6	3844095	3844100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733692
78014	NC_010658	ACC	2	6	3844113	3844118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733692
78015	NC_010658	A	6	6	3844155	3844160	100 %	0 %	0 %	0 %	187733692
78016	NC_010658	TGC	2	6	3844179	3844184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733692
78017	NC_010658	GC	3	6	3844183	3844188	0 %	0 %	50 %	50 %	187733692
78018	NC_010658	ATG	2	6	3844226	3844231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733692
78019	NC_010658	GCA	2	6	3844237	3844242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733692
78020	NC_010658	ATTG	2	8	3844300	3844307	25 %	50 %	25 %	0 %	187733692
78021	NC_010658	CAA	2	6	3844339	3844344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733692
78022	NC_010658	ATC	2	6	3844379	3844384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733692
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78024	NC_010658	A	6	6	3844467	3844472	100 %	0 %	0 %	0 %	187733692
78025	NC_010658	CGC	2	6	3844495	3844500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733692
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78027	NC_010658	GCA	2	6	3844711	3844716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733692
78028	NC_010658	TTA	2	6	3844784	3844789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78029	NC_010658	AGGG	2	8	3844806	3844813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78030	NC_010658	A	6	6	3844834	3844839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78031	NC_010658	CCG	2	6	3844842	3844847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78032	NC_010658	GA	3	6	3844872	3844877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78033	NC_010658	GTG	2	6	3844982	3844987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78034	NC_010658	G	8	8	3844991	3844998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78035	NC_010658	TAA	2	6	3845084	3845089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78036	NC_010658	CCA	2	6	3845162	3845167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78037	NC_010658	TAC	2	6	3845191	3845196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78038	NC_010658	GC	3	6	3845226	3845231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78039	NC_010658	ATA	2	6	3845322	3845327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78040	NC_010658	C	8	8	3845335	3845342	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78041	NC_010658	TAAA	2	8	3845360	3845367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78042	NC_010658	TGC	2	6	3845397	3845402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78055	NC_010658	TGC	2	6	3845990	3845995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733374
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78062	NC_010658	ACCGC	2	10	3846356	3846365	20 %	0 %	20 %	60 %	187733374
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78130	NC_010658	GCA	2	6	3849549	3849554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732674
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78225	NC_010658	CAGC	2	8	3854209	3854216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78226	NC_010658	CAC	2	6	3854308	3854313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78227	NC_010658	TTC	2	6	3854338	3854343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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78229	NC_010658	ACC	2	6	3854395	3854400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78230	NC_010658	GGT	2	6	3854428	3854433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78231	NC_010658	GC	3	6	3854448	3854453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78232	NC_010658	TGC	2	6	3854489	3854494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78233	NC_010658	ATC	2	6	3854540	3854545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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78235	NC_010658	GCT	2	6	3854653	3854658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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78354	NC_010658	TTGGTC	2	12	3860033	3860044	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187732455
78355	NC_010658	TTA	2	6	3860054	3860059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732455
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78425	NC_010658	GAAT	2	8	3863359	3863366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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78498	NC_010658	G	6	6	3867021	3867026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78499	NC_010658	AG	3	6	3867101	3867106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78500	NC_010658	TTA	2	6	3867174	3867179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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