MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_010658	TAAG	2	8	3699611	3699618	50 %	25 %	25 %	0 %	187731073
75003	NC_010658	GGC	2	6	3699620	3699625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75004	NC_010658	TGG	2	6	3699646	3699651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731977
75005	NC_010658	CCA	2	6	3699672	3699677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731977
75006	NC_010658	TGC	2	6	3699707	3699712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75007	NC_010658	TGC	2	6	3699770	3699775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75008	NC_010658	CGT	2	6	3699780	3699785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75009	NC_010658	GCT	2	6	3699971	3699976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75010	NC_010658	CTG	2	6	3700014	3700019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75011	NC_010658	CTG	3	9	3700122	3700130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75012	NC_010658	GAA	2	6	3700284	3700289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731977
75013	NC_010658	GAA	2	6	3700317	3700322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731977
75014	NC_010658	CTG	2	6	3700365	3700370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75015	NC_010658	GAA	2	6	3700371	3700376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731977
75016	NC_010658	TGG	2	6	3700387	3700392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731977
75017	NC_010658	CTG	2	6	3700515	3700520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75018	NC_010658	ATCGA	2	10	3700545	3700554	40 %	20 %	20 %	20 %	187731977
75019	NC_010658	GCA	2	6	3700562	3700567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75020	NC_010658	TCGT	2	8	3700591	3700598	0 %	50 %	25 %	25 %	187731977
75021	NC_010658	TTC	3	9	3700620	3700628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731977
75022	NC_010658	ACCG	2	8	3700632	3700639	25 %	0 %	25 %	50 %	187731977
75023	NC_010658	A	6	6	3700641	3700646	100 %	0 %	0 %	0 %	187731977
75024	NC_010658	GCTG	3	12	3700736	3700747	0 %	25 %	50 %	25 %	187731977
75025	NC_010658	CTG	2	6	3700797	3700802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
75026	NC_010658	TGA	2	6	3700816	3700821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731977
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75028	NC_010658	TGA	2	6	3700946	3700951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731977
75029	NC_010658	CGT	2	6	3701067	3701072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731977
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75033	NC_010658	TGA	2	6	3701189	3701194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731977
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75041	NC_010658	TTA	2	6	3701705	3701710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75042	NC_010658	T	7	7	3701733	3701739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75043	NC_010658	ATA	2	6	3701751	3701756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75044	NC_010658	TAA	2	6	3701767	3701772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75045	NC_010658	TCT	2	6	3701773	3701778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75046	NC_010658	AT	3	6	3701798	3701803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75047	NC_010658	TGT	2	6	3701937	3701942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733110
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75052	NC_010658	TCC	2	6	3702136	3702141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733110
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75054	NC_010658	ATCAC	2	10	3702228	3702237	40 %	20 %	0 %	40 %	187733110
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75065	NC_010658	TG	3	6	3702879	3702884	0 %	50 %	50 %	0 %	187731329
75066	NC_010658	GGC	2	6	3702916	3702921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731329
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75069	NC_010658	TTC	2	6	3703018	3703023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75070	NC_010658	ATA	3	9	3703030	3703038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75071	NC_010658	TAC	2	6	3703044	3703049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75072	NC_010658	CGAT	2	8	3703051	3703058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75073	NC_010658	TATT	2	8	3703059	3703066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75074	NC_010658	A	8	8	3703072	3703079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75075	NC_010658	A	7	7	3703081	3703087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75083	NC_010658	ATC	2	6	3703767	3703772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730124
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75087	NC_010658	GATTC	2	10	3704029	3704038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75088	NC_010658	AT	3	6	3704090	3704095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75089	NC_010658	A	6	6	3704166	3704171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75090	NC_010658	T	6	6	3704187	3704192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75091	NC_010658	ACA	2	6	3704202	3704207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75092	NC_010658	GT	3	6	3704310	3704315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75093	NC_010658	T	7	7	3704326	3704332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75094	NC_010658	GCG	2	6	3704394	3704399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730636
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75108	NC_010658	CA	3	6	3705133	3705138	50 %	0 %	0 %	50 %	187730024
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75473	NC_010658	ATC	2	6	3723546	3723551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732698
75474	NC_010658	AAT	2	6	3723569	3723574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732698
75475	NC_010658	ACC	3	9	3723585	3723593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732698
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75477	NC_010658	GA	4	8	3723747	3723754	50 %	0 %	50 %	0 %	187732698
75478	NC_010658	ATC	2	6	3723777	3723782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732698
75479	NC_010658	TTC	2	6	3723816	3723821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732698
75480	NC_010658	ATA	2	6	3723837	3723842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732698
75481	NC_010658	TAAA	2	8	3723884	3723891	75 %	25 %	0 %	0 %	187732698
75482	NC_010658	TAA	2	6	3723937	3723942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732698
75483	NC_010658	ATA	2	6	3724015	3724020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732698
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75487	NC_010658	A	6	6	3724183	3724188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75500	NC_010658	TC	4	8	3724795	3724802	0 %	50 %	0 %	50 %	187733318

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