MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010480	A	6	6	28084	28089	100 %	0 %	0 %	0 %	170079584
502	NC_010480	ACC	2	6	28114	28119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
503	NC_010480	CCA	2	6	28141	28146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
504	NC_010480	CCA	2	6	28164	28169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
505	NC_010480	GTTG	2	8	28184	28191	0 %	50 %	50 %	0 %	170079584
506	NC_010480	CAAA	2	8	28233	28240	75 %	0 %	0 %	25 %	170079584
507	NC_010480	CTC	2	6	28255	28260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079584
508	NC_010480	GAA	2	6	28261	28266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
509	NC_010480	CCA	2	6	28337	28342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
510	NC_010480	CGG	2	6	28365	28370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079584
511	NC_010480	GAA	2	6	28444	28449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
512	NC_010480	AC	3	6	28541	28546	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
513	NC_010480	AGA	2	6	28638	28643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
514	NC_010480	CA	3	6	28704	28709	50 %	0 %	0 %	50 %	170079584
515	NC_010480	C	6	6	28718	28723	0 %	0 %	0 %	100 %	170079584
516	NC_010480	G	6	6	28729	28734	0 %	0 %	100 %	0 %	170079584
517	NC_010480	AGG	2	6	28737	28742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079584
518	NC_010480	ATC	2	6	28746	28751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
519	NC_010480	G	6	6	28795	28800	0 %	0 %	100 %	0 %	170079584
520	NC_010480	AAG	2	6	28802	28807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
521	NC_010480	ATC	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
522	NC_010480	A	6	6	28834	28839	100 %	0 %	0 %	0 %	170079584
523	NC_010480	CCGA	2	8	28852	28859	25 %	0 %	25 %	50 %	170079584
524	NC_010480	GTT	2	6	28865	28870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079584
525	NC_010480	CGT	2	6	28935	28940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079584
526	NC_010480	AACT	2	8	29144	29151	50 %	25 %	0 %	25 %	170079584
527	NC_010480	CGC	2	6	29233	29238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079584
528	NC_010480	GAA	2	6	29251	29256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
529	NC_010480	CGC	2	6	29262	29267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079584
530	NC_010480	ATT	2	6	29287	29292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079584
531	NC_010480	CGCC	2	8	29307	29314	0 %	0 %	25 %	75 %	170079584
532	NC_010480	CAA	2	6	29368	29373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079584
533	NC_010480	A	6	6	29381	29386	100 %	0 %	0 %	0 %	170079584
534	NC_010480	TCT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079584
535	NC_010480	GCA	2	6	29556	29561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079584
536	NC_010480	CGG	2	6	29567	29572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079584
537	NC_010480	TCAA	2	8	29621	29628	50 %	25 %	0 %	25 %	170079584
538	NC_010480	CCT	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079584
539	NC_010480	GAT	2	6	29656	29661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079584
540	NC_010480	CCA	2	6	29681	29686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
541	NC_010480	C	6	6	29756	29761	0 %	0 %	0 %	100 %	170079584
542	NC_010480	AGA	2	6	29768	29773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
543	NC_010480	CTC	2	6	29821	29826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079584
544	NC_010480	CCA	2	6	29879	29884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
545	NC_010480	GTGA	2	8	29908	29915	25 %	25 %	50 %	0 %	170079584
546	NC_010480	GCC	2	6	30038	30043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079584
547	NC_010480	GAT	3	9	30082	30090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079584
548	NC_010480	GAT	2	6	30112	30117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079584
549	NC_010480	CAT	2	6	30120	30125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
550	NC_010480	GGA	2	6	30147	30152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079584
551	NC_010480	GAA	2	6	30181	30186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
552	NC_010480	CTG	2	6	30187	30192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079584
553	NC_010480	TCC	2	6	30245	30250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079584
554	NC_010480	CAT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
555	NC_010480	GCG	2	6	30506	30511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079584
556	NC_010480	TCA	2	6	30602	30607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
557	NC_010480	ACG	2	6	30623	30628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079584
558	NC_010480	GTT	2	6	30688	30693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079584
559	NC_010480	AAG	2	6	30764	30769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
560	NC_010480	CCA	2	6	30811	30816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
561	NC_010480	GATG	2	8	30846	30853	25 %	25 %	50 %	0 %	170079584
562	NC_010480	TCA	2	6	30876	30881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079584
563	NC_010480	ACC	2	6	30888	30893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079584
564	NC_010480	CAAA	2	8	30971	30978	75 %	0 %	0 %	25 %	170079584
565	NC_010480	CTCC	2	8	30983	30990	0 %	25 %	0 %	75 %	170079584
566	NC_010480	GAA	2	6	31072	31077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079584
567	NC_010480	A	7	7	31154	31160	100 %	0 %	0 %	0 %	170079584
568	NC_010480	TAT	2	6	31199	31204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_010480	TAG	2	6	31241	31246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_010480	TGC	2	6	31302	31307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_010480	CTA	2	6	31348	31353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079585
572	NC_010480	CGC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079585
573	NC_010480	TC	3	6	31452	31457	0 %	50 %	0 %	50 %	170079585
574	NC_010480	TCTG	2	8	31544	31551	0 %	50 %	25 %	25 %	170079585
575	NC_010480	GCC	2	6	31642	31647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079585
576	NC_010480	AGA	2	6	31769	31774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079585
577	NC_010480	GA	4	8	31815	31822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_010480	ATT	2	6	31834	31839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_010480	TC	4	8	31844	31851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_010480	CCT	2	6	31852	31857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_010480	TGC	3	9	31868	31876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_010480	C	6	6	31876	31881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
583	NC_010480	AAC	2	6	31903	31908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_010480	CTT	2	6	31937	31942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079586
585	NC_010480	CCA	3	9	31945	31953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079586
586	NC_010480	CCA	3	9	31963	31971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079586
587	NC_010480	TAA	2	6	32106	32111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079586
588	NC_010480	ATT	2	6	32123	32128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079586
589	NC_010480	CGC	2	6	32152	32157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079586
590	NC_010480	AAT	2	6	32210	32215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079586
591	NC_010480	TGG	2	6	32513	32518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079586
592	NC_010480	CTG	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079586
593	NC_010480	T	6	6	32652	32657	0 %	100 %	0 %	0 %	170079586
594	NC_010480	CTG	2	6	32700	32705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079586
595	NC_010480	GAT	2	6	32706	32711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079586
596	NC_010480	TG	3	6	32712	32717	0 %	50 %	50 %	0 %	170079586
597	NC_010480	CAA	2	6	32893	32898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079587
598	NC_010480	CTC	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079587
599	NC_010480	ATC	2	6	33117	33122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079587
600	NC_010480	AGG	2	6	33132	33137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079587
601	NC_010480	TTC	2	6	33143	33148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079587
602	NC_010480	CATA	2	8	33178	33185	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
603	NC_010480	T	8	8	33246	33253	0 %	100 %	0 %	0 %	170079587
604	NC_010480	TCA	2	6	33273	33278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079587
605	NC_010480	AATC	2	8	33331	33338	50 %	25 %	0 %	25 %	170079587
606	NC_010480	CTG	2	6	33349	33354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079587
607	NC_010480	TGA	2	6	33400	33405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079587
608	NC_010480	CCA	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
609	NC_010480	A	7	7	33692	33698	100 %	0 %	0 %	0 %	170079588
610	NC_010480	TC	3	6	33741	33746	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
611	NC_010480	AATCAA	2	12	33921	33932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170079588
612	NC_010480	TTGA	2	8	33946	33953	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
613	NC_010480	CAG	2	6	34036	34041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079588
614	NC_010480	TCA	2	6	34055	34060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
615	NC_010480	GCC	2	6	34075	34080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079588
616	NC_010480	TTA	2	6	34160	34165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079588
617	NC_010480	CCA	2	6	34186	34191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
618	NC_010480	TCGAT	2	10	34217	34226	20 %	40 %	20 %	20 %	170079588
619	NC_010480	AGCC	2	8	34360	34367	25 %	0 %	25 %	50 %	170079588
620	NC_010480	CTC	2	6	34384	34389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079588
621	NC_010480	ATA	2	6	34398	34403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079588
622	NC_010480	CT	3	6	34415	34420	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
623	NC_010480	CTG	2	6	34677	34682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079588
624	NC_010480	TG	3	6	34681	34686	0 %	50 %	50 %	0 %	170079588
625	NC_010480	TCA	2	6	34725	34730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
626	NC_010480	A	7	7	34759	34765	100 %	0 %	0 %	0 %	170079588
627	NC_010480	TC	3	6	34782	34787	0 %	50 %	0 %	50 %	170079588
628	NC_010480	ATC	2	6	34843	34848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079588
629	NC_010480	GCA	2	6	34859	34864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079588
630	NC_010480	TTGA	2	8	34891	34898	25 %	50 %	25 %	0 %	170079588
631	NC_010480	CAC	2	6	34926	34931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079588
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644	NC_010480	TTG	2	6	35687	35692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_010480	A	6	6	35733	35738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_010480	ATCT	2	8	35761	35768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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701	NC_010480	TTA	2	6	38979	38984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079592
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706	NC_010480	TAA	2	6	39134	39139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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754	NC_010480	T	6	6	41770	41775	0 %	100 %	0 %	0 %	170079595
755	NC_010480	GAC	2	6	41799	41804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079595
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