MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ4

Total Repeats: 559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010478	ATT	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079483
2	NC_010478	TGC	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079483
3	NC_010478	ATTG	2	8	99	106	25 %	50 %	25 %	0 %	170079483
4	NC_010478	CGAAC	2	10	116	125	40 %	0 %	20 %	40 %	170079483
5	NC_010478	G	6	6	146	151	0 %	0 %	100 %	0 %	170079483
6	NC_010478	TGA	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079483
7	NC_010478	TGAT	2	8	218	225	25 %	50 %	25 %	0 %	170079483
8	NC_010478	CAA	2	6	293	298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079483
9	NC_010478	ATG	2	6	341	346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079483
10	NC_010478	C	6	6	385	390	0 %	0 %	0 %	100 %	170079483
11	NC_010478	AAGG	2	8	400	407	50 %	0 %	50 %	0 %	170079483
12	NC_010478	CCG	2	6	465	470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079483
13	NC_010478	AGC	2	6	597	602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079483
14	NC_010478	CAT	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079484
15	NC_010478	AAAC	2	8	630	637	75 %	0 %	0 %	25 %	170079484
16	NC_010478	A	6	6	694	699	100 %	0 %	0 %	0 %	170079484
17	NC_010478	TG	3	6	711	716	0 %	50 %	50 %	0 %	170079484
18	NC_010478	GGC	2	6	745	750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079484
19	NC_010478	GGAAT	2	10	762	771	40 %	20 %	40 %	0 %	170079484
20	NC_010478	TTC	2	6	843	848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010478	GAG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010478	TGA	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010478	TC	3	6	940	945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010478	TAC	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010478	TCG	2	6	1014	1019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010478	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010478	CCAT	2	8	1084	1091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010478	TGCC	2	8	1115	1122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010478	GAC	2	6	1147	1152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010478	TTGA	2	8	1195	1202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010478	CTA	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010478	GCAAAT	2	12	1287	1298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010478	GAT	2	6	1305	1310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010478	TTG	2	6	1352	1357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010478	TGGT	2	8	1436	1443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010478	TGG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079485
37	NC_010478	ATTT	2	8	1537	1544	25 %	75 %	0 %	0 %	170079485
38	NC_010478	CAG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079485
39	NC_010478	ATT	2	6	1626	1631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079485
40	NC_010478	CTG	2	6	1645	1650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079485
41	NC_010478	CGG	2	6	1701	1706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079485
42	NC_010478	GGC	2	6	1724	1729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079485
43	NC_010478	GGA	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079485
44	NC_010478	GCAC	2	8	1814	1821	25 %	0 %	25 %	50 %	170079485
45	NC_010478	TTGAT	2	10	1885	1894	20 %	60 %	20 %	0 %	170079485
46	NC_010478	CCAA	2	8	1923	1930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010478	A	6	6	1954	1959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010478	TGT	2	6	1996	2001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010478	A	6	6	2041	2046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010478	TTAG	2	8	2079	2086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010478	TGT	2	6	2122	2127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010478	ACGAA	2	10	2147	2156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010478	A	6	6	2226	2231	100 %	0 %	0 %	0 %	170079486
54	NC_010478	AAGTCA	2	12	2242	2253	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170079486
55	NC_010478	AAAC	2	8	2259	2266	75 %	0 %	0 %	25 %	170079486
56	NC_010478	TGA	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079486
57	NC_010478	CAG	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079486
58	NC_010478	CGA	2	6	2467	2472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079486
59	NC_010478	GTG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079486
60	NC_010478	GAC	2	6	2588	2593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079486
61	NC_010478	CTT	2	6	2877	2882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079486
62	NC_010478	GAC	2	6	2925	2930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079486
63	NC_010478	CTG	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079486
64	NC_010478	CCA	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079486
65	NC_010478	GGC	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079486
66	NC_010478	TTGA	2	8	3267	3274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010478	CCCTCT	2	12	3296	3307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010478	GAAC	2	8	3338	3345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010478	A	7	7	3432	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010478	TAG	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010478	A	8	8	3567	3574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010478	TC	4	8	3581	3588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010478	AAT	2	6	3616	3621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010478	GCA	2	6	3767	3772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079487
75	NC_010478	GTA	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079487
76	NC_010478	TGA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079487
77	NC_010478	CGC	2	6	3913	3918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079487
78	NC_010478	GGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079487
79	NC_010478	CAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079487
80	NC_010478	CGC	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079487
81	NC_010478	ACT	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079487
82	NC_010478	GTTG	2	8	4192	4199	0 %	50 %	50 %	0 %	170079487
83	NC_010478	GTG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079487
84	NC_010478	AGC	2	6	4237	4242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079487
85	NC_010478	TGCAG	2	10	4357	4366	20 %	20 %	40 %	20 %	170079488
86	NC_010478	CGCCA	2	10	4571	4580	20 %	0 %	20 %	60 %	170079488
87	NC_010478	T	6	6	4588	4593	0 %	100 %	0 %	0 %	170079488
88	NC_010478	GCG	2	6	4630	4635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079488
89	NC_010478	CTT	2	6	4639	4644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079488
90	NC_010478	CGC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079488
91	NC_010478	TC	3	6	4705	4710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010478	CGG	2	6	4716	4721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010478	CTC	2	6	4754	4759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010478	CAT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079489
95	NC_010478	G	6	6	4858	4863	0 %	0 %	100 %	0 %	170079489
96	NC_010478	CCA	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079489
97	NC_010478	CA	3	6	4906	4911	50 %	0 %	0 %	50 %	170079489
98	NC_010478	ATC	2	6	4926	4931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079489
99	NC_010478	AC	3	6	5058	5063	50 %	0 %	0 %	50 %	170079489
100	NC_010478	ATG	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079489
101	NC_010478	GT	3	6	5084	5089	0 %	50 %	50 %	0 %	170079489
102	NC_010478	GGC	2	6	5157	5162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079489
103	NC_010478	TGA	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079489
104	NC_010478	TCAA	2	8	5305	5312	50 %	25 %	0 %	25 %	170079489
105	NC_010478	GTA	2	6	5445	5450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079490
106	NC_010478	TCT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079490
107	NC_010478	AAGT	2	8	5554	5561	50 %	25 %	25 %	0 %	170079490
108	NC_010478	CAC	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079490
109	NC_010478	TGG	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079490
110	NC_010478	CTT	2	6	5717	5722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079490
111	NC_010478	GCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079490
112	NC_010478	GCC	3	9	5779	5787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079490
113	NC_010478	CAG	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079490
114	NC_010478	TTC	2	6	5829	5834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079490
115	NC_010478	A	7	7	5859	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	170079490
116	NC_010478	CCT	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079490
117	NC_010478	GTA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079490
118	NC_010478	AGT	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079490
119	NC_010478	GTG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079490
120	NC_010478	GAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079490
121	NC_010478	CAT	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079490
122	NC_010478	C	7	7	6129	6135	0 %	0 %	0 %	100 %	170079490
123	NC_010478	TCA	2	6	6152	6157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079490
124	NC_010478	ATT	2	6	6221	6226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079491
125	NC_010478	CGA	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079491
126	NC_010478	TTG	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079491
127	NC_010478	CAG	3	9	6344	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079491
128	NC_010478	CA	3	6	6477	6482	50 %	0 %	0 %	50 %	170079491
129	NC_010478	AAT	3	9	6543	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079491
130	NC_010478	TAA	2	6	6578	6583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079491
131	NC_010478	C	6	6	6598	6603	0 %	0 %	0 %	100 %	170079491
132	NC_010478	A	6	6	6609	6614	100 %	0 %	0 %	0 %	170079491
133	NC_010478	CCG	2	6	6685	6690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079491
134	NC_010478	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010478	G	6	6	6755	6760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010478	ACCGC	2	10	6782	6791	20 %	0 %	20 %	60 %	170079492
137	NC_010478	GAC	2	6	7016	7021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079492
138	NC_010478	TCG	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079492
139	NC_010478	TCG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079492
140	NC_010478	CACC	2	8	7126	7133	25 %	0 %	0 %	75 %	170079492
141	NC_010478	GCT	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079492
142	NC_010478	ACT	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079492
143	NC_010478	ACG	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079492
144	NC_010478	TAA	2	6	7358	7363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079492
145	NC_010478	A	6	6	7391	7396	100 %	0 %	0 %	0 %	170079492
146	NC_010478	CGT	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079492
147	NC_010478	AGT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079492
148	NC_010478	GCA	2	6	7514	7519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079492
149	NC_010478	TCA	2	6	7551	7556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079492
150	NC_010478	ATCA	2	8	7559	7566	50 %	25 %	0 %	25 %	170079492
151	NC_010478	TC	3	6	7588	7593	0 %	50 %	0 %	50 %	170079492
152	NC_010478	AGT	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079492
153	NC_010478	TCC	2	6	7726	7731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_010478	A	6	6	7777	7782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010478	TCA	2	6	7800	7805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010478	T	6	6	7848	7853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010478	AAGAT	2	10	7872	7881	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010478	GAC	2	6	7908	7913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_010478	A	7	7	7916	7922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010478	T	8	8	7944	7951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010478	AT	3	6	7958	7963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010478	GTT	2	6	8032	8037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010478	ATGGC	2	10	8058	8067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_010478	TC	3	6	8110	8115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_010478	TTTC	2	8	8178	8185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_010478	TCA	2	6	8207	8212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_010478	TAA	2	6	8246	8251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010478	TGA	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010478	AGA	2	6	8305	8310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010478	A	7	7	8347	8353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010478	CTG	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079493
172	NC_010478	CTT	2	6	8470	8475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079493
173	NC_010478	ATT	2	6	8522	8527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079493
174	NC_010478	TCTT	2	8	8548	8555	0 %	75 %	0 %	25 %	170079493
175	NC_010478	GTT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079493
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177	NC_010478	CCA	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_010478	A	7	7	8671	8677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010478	CAA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_010478	TTC	2	6	8755	8760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079494
183	NC_010478	ATAG	2	8	8950	8957	50 %	25 %	25 %	0 %	170079494
184	NC_010478	GCTTG	2	10	9007	9016	0 %	40 %	40 %	20 %	170079494
185	NC_010478	TTGA	2	8	9040	9047	25 %	50 %	25 %	0 %	170079494
186	NC_010478	TAG	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079494
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245	NC_010478	GCC	2	6	12364	12369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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254	NC_010478	AAG	2	6	13593	13598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_010478	CGC	2	6	13764	13769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_010478	CTG	2	6	13827	13832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_010478	TCA	3	9	13967	13975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_010478	CCA	2	6	14180	14185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
260	NC_010478	GGC	3	9	14237	14245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_010478	TA	4	8	14395	14402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_010478	TAC	2	6	14410	14415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_010478	GCA	2	6	14606	14611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_010478	ATG	2	6	14614	14619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010478	TTGGT	2	10	14678	14687	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010478	GTT	2	6	15132	15137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010478	ATG	2	6	15255	15260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079500
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270	NC_010478	GTC	2	6	15402	15407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079500
271	NC_010478	ATA	2	6	15454	15459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079500
272	NC_010478	AG	3	6	15529	15534	50 %	0 %	50 %	0 %	170079500
273	NC_010478	AAT	2	6	15544	15549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079501
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