MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_010475	GACT	2	8	2628721	2628728	25 %	25 %	25 %	25 %	170079114
49002	NC_010475	TTGG	2	8	2628773	2628780	0 %	50 %	50 %	0 %	170079114
49003	NC_010475	GCT	2	6	2628814	2628819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079114
49004	NC_010475	TGC	2	6	2628854	2628859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079114
49005	NC_010475	T	7	7	2628914	2628920	0 %	100 %	0 %	0 %	170079114
49006	NC_010475	TAA	2	6	2628929	2628934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079114
49007	NC_010475	GAG	2	6	2629064	2629069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079114
49008	NC_010475	GA	3	6	2629121	2629126	50 %	0 %	50 %	0 %	170079114
49009	NC_010475	CCT	2	6	2629180	2629185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079114
49010	NC_010475	GCC	2	6	2629201	2629206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079114
49011	NC_010475	AAACCC	2	12	2629299	2629310	50 %	0 %	0 %	50 %	170079114
49012	NC_010475	CGC	2	6	2629319	2629324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079114
49013	NC_010475	AGC	2	6	2629348	2629353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079114
49014	NC_010475	CAT	2	6	2629447	2629452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079114
49015	NC_010475	CCG	2	6	2629502	2629507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079114
49016	NC_010475	CCAT	2	8	2629523	2629530	25 %	25 %	0 %	50 %	170079114
49017	NC_010475	GGC	2	6	2629534	2629539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079114
49018	NC_010475	AGAC	2	8	2629600	2629607	50 %	0 %	25 %	25 %	170079114
49019	NC_010475	CTG	2	6	2629644	2629649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079114
49020	NC_010475	TTG	2	6	2629700	2629705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49021	NC_010475	TTTCTT	2	12	2629714	2629725	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49022	NC_010475	AAC	2	6	2629760	2629765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49023	NC_010475	CCCT	2	8	2629771	2629778	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49024	NC_010475	CAC	2	6	2629799	2629804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49025	NC_010475	AAAAAT	2	12	2629840	2629851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49026	NC_010475	GTT	2	6	2629866	2629871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49027	NC_010475	GCC	4	12	2630121	2630132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079115
49028	NC_010475	ATG	2	6	2630139	2630144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079115
49029	NC_010475	T	6	6	2630153	2630158	0 %	100 %	0 %	0 %	170079115
49030	NC_010475	AAC	2	6	2630163	2630168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079115
49031	NC_010475	TTG	3	9	2630181	2630189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079115
49032	NC_010475	C	6	6	2630226	2630231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49033	NC_010475	CCA	2	6	2630345	2630350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079116
49034	NC_010475	TTG	2	6	2630371	2630376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079116
49035	NC_010475	CAG	2	6	2630399	2630404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079116
49036	NC_010475	GCG	2	6	2630410	2630415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079116
49037	NC_010475	CA	3	6	2630453	2630458	50 %	0 %	0 %	50 %	170079116
49038	NC_010475	CG	3	6	2630475	2630480	0 %	0 %	50 %	50 %	170079116
49039	NC_010475	GGTG	2	8	2630505	2630512	0 %	25 %	75 %	0 %	170079116
49040	NC_010475	TGG	2	6	2630546	2630551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079116
49041	NC_010475	C	6	6	2630565	2630570	0 %	0 %	0 %	100 %	170079116
49042	NC_010475	ATA	2	6	2630581	2630586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079116
49043	NC_010475	GTT	2	6	2630606	2630611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079116
49044	NC_010475	CTT	2	6	2630714	2630719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079116
49045	NC_010475	AC	3	6	2630828	2630833	50 %	0 %	0 %	50 %	170079116
49046	NC_010475	CTT	2	6	2630852	2630857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079116
49047	NC_010475	CGG	2	6	2630882	2630887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079116
49048	NC_010475	TTCC	2	8	2631080	2631087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49049	NC_010475	CGC	2	6	2631090	2631095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49050	NC_010475	A	6	6	2631295	2631300	100 %	0 %	0 %	0 %	170079117
49051	NC_010475	TGG	2	6	2631401	2631406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079117
49052	NC_010475	ATT	2	6	2631460	2631465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079117
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49054	NC_010475	TGTGA	2	10	2631802	2631811	20 %	40 %	40 %	0 %	170079118
49055	NC_010475	ATGG	2	8	2631823	2631830	25 %	25 %	50 %	0 %	170079118
49056	NC_010475	AGA	2	6	2631975	2631980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079118
49057	NC_010475	GTC	2	6	2631999	2632004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079118
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49059	NC_010475	TGT	2	6	2632393	2632398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49060	NC_010475	CAAA	2	8	2632423	2632430	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49061	NC_010475	GGC	2	6	2632469	2632474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079119
49062	NC_010475	CAATAG	2	12	2632520	2632531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	170079119
49063	NC_010475	ATT	2	6	2632573	2632578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079119
49064	NC_010475	TGG	2	6	2632588	2632593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079119
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49068	NC_010475	CGC	2	6	2632712	2632717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079119
49069	NC_010475	CAC	2	6	2632766	2632771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079119
49070	NC_010475	CAA	2	6	2632805	2632810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079119
49071	NC_010475	CTG	2	6	2632960	2632965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079119
49072	NC_010475	ATG	2	6	2633016	2633021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079119
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49074	NC_010475	A	6	6	2633166	2633171	100 %	0 %	0 %	0 %	170079119
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49076	NC_010475	GGATT	2	10	2633211	2633220	20 %	40 %	40 %	0 %	170079119
49077	NC_010475	TAC	2	6	2633266	2633271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079119
49078	NC_010475	GGC	3	9	2633313	2633321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079119
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49082	NC_010475	CAA	2	6	2633469	2633474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079119
49083	NC_010475	GGCATT	2	12	2633514	2633525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170079119
49084	NC_010475	TGA	2	6	2633549	2633554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079119
49085	NC_010475	TACC	2	8	2633621	2633628	25 %	25 %	0 %	50 %	170079119
49086	NC_010475	AGACCG	2	12	2633639	2633650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079119
49087	NC_010475	CTAA	2	8	2633773	2633780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49088	NC_010475	C	6	6	2633795	2633800	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49089	NC_010475	AT	3	6	2633822	2633827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49090	NC_010475	AAC	2	6	2633835	2633840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49091	NC_010475	ATG	2	6	2633862	2633867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49092	NC_010475	GTC	2	6	2633903	2633908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49093	NC_010475	AG	3	6	2633948	2633953	50 %	0 %	50 %	0 %	170079120
49094	NC_010475	GGGC	2	8	2633955	2633962	0 %	0 %	75 %	25 %	170079120
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49097	NC_010475	TTA	2	6	2634082	2634087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49098	NC_010475	CAC	2	6	2634106	2634111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49099	NC_010475	TTG	2	6	2634159	2634164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079121
49100	NC_010475	CGCC	2	8	2634215	2634222	0 %	0 %	25 %	75 %	170079121
49101	NC_010475	AGG	2	6	2634229	2634234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079121
49102	NC_010475	CGG	2	6	2634343	2634348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079121
49103	NC_010475	GCG	2	6	2634387	2634392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079121
49104	NC_010475	TTGG	2	8	2634600	2634607	0 %	50 %	50 %	0 %	170079122
49105	NC_010475	TTG	2	6	2634686	2634691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079122
49106	NC_010475	CTT	2	6	2634709	2634714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079122
49107	NC_010475	AAC	2	6	2634779	2634784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079122
49108	NC_010475	TGG	2	6	2634805	2634810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079122
49109	NC_010475	G	6	6	2634842	2634847	0 %	0 %	100 %	0 %	170079122
49110	NC_010475	CCT	2	6	2634933	2634938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079122
49111	NC_010475	ACCAA	2	10	2635016	2635025	60 %	0 %	0 %	40 %	170079122
49112	NC_010475	ATG	2	6	2635043	2635048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079122
49113	NC_010475	TGAA	2	8	2635115	2635122	50 %	25 %	25 %	0 %	170079122
49114	NC_010475	GTT	2	6	2635234	2635239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079123
49115	NC_010475	ATCA	2	8	2635313	2635320	50 %	25 %	0 %	25 %	170079123
49116	NC_010475	TTTG	2	8	2635457	2635464	0 %	75 %	25 %	0 %	170079123
49117	NC_010475	CCG	2	6	2635490	2635495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079123
49118	NC_010475	TAT	2	6	2635518	2635523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079123
49119	NC_010475	AGCCAG	2	12	2635547	2635558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079123
49120	NC_010475	ATC	2	6	2635610	2635615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079123
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49232	NC_010475	G	6	6	2641219	2641224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49233	NC_010475	T	7	7	2641313	2641319	0 %	100 %	0 %	0 %	170079130
49234	NC_010475	A	6	6	2641335	2641340	100 %	0 %	0 %	0 %	170079130
49235	NC_010475	GGC	2	6	2641392	2641397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079130
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49351	NC_010475	CT	3	6	2647397	2647402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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