MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_010475	CAT	2	6	2842225	2842230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079306
53002	NC_010475	TGG	2	6	2842270	2842275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079306
53003	NC_010475	CTT	2	6	2842327	2842332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079306
53004	NC_010475	GAA	2	6	2842357	2842362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079306
53005	NC_010475	CAC	2	6	2842505	2842510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079307
53006	NC_010475	GC	3	6	2842515	2842520	0 %	0 %	50 %	50 %	170079307
53007	NC_010475	T	6	6	2842525	2842530	0 %	100 %	0 %	0 %	170079307
53008	NC_010475	CTGG	2	8	2842544	2842551	0 %	25 %	50 %	25 %	170079307
53009	NC_010475	CTG	2	6	2842610	2842615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079307
53010	NC_010475	ACC	2	6	2842632	2842637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079307
53011	NC_010475	CAG	2	6	2842676	2842681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079307
53012	NC_010475	TCG	2	6	2842788	2842793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079307
53013	NC_010475	GGAG	2	8	2842895	2842902	25 %	0 %	75 %	0 %	170079307
53014	NC_010475	C	6	6	2843001	2843006	0 %	0 %	0 %	100 %	170079307
53015	NC_010475	GCC	2	6	2843118	2843123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53016	NC_010475	CGA	2	6	2843138	2843143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53017	NC_010475	GAT	2	6	2843199	2843204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53018	NC_010475	GTT	2	6	2843213	2843218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53019	NC_010475	GT	3	6	2843222	2843227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53020	NC_010475	TCTT	2	8	2843250	2843257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53021	NC_010475	ATTTTC	2	12	2843329	2843340	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53022	NC_010475	TTC	2	6	2843435	2843440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079308
53023	NC_010475	CGA	2	6	2843489	2843494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079308
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53025	NC_010475	GCAC	2	8	2843582	2843589	25 %	0 %	25 %	50 %	170079308
53026	NC_010475	TCC	2	6	2843605	2843610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079308
53027	NC_010475	ATTAAG	2	12	2843676	2843687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	170079308
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53029	NC_010475	T	7	7	2843748	2843754	0 %	100 %	0 %	0 %	170079308
53030	NC_010475	GTT	2	6	2843778	2843783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079308
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53032	NC_010475	GACCAA	2	12	2843888	2843899	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	170079308
53033	NC_010475	CAT	2	6	2843924	2843929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079308
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53035	NC_010475	TTG	2	6	2843983	2843988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079308
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53038	NC_010475	AT	3	6	2844249	2844254	50 %	50 %	0 %	0 %	170079308
53039	NC_010475	TCT	3	9	2844292	2844300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079308
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53041	NC_010475	ACAA	2	8	2844439	2844446	75 %	0 %	0 %	25 %	170079308
53042	NC_010475	GC	3	6	2844506	2844511	0 %	0 %	50 %	50 %	170079308
53043	NC_010475	TCA	3	9	2844550	2844558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079308
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53046	NC_010475	CGC	2	6	2844789	2844794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079309
53047	NC_010475	A	7	7	2844820	2844826	100 %	0 %	0 %	0 %	170079309
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53052	NC_010475	GC	3	6	2844997	2845002	0 %	0 %	50 %	50 %	170079309
53053	NC_010475	ATC	2	6	2845003	2845008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079309
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53055	NC_010475	TCT	2	6	2845088	2845093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53056	NC_010475	AAT	2	6	2845182	2845187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53057	NC_010475	CAA	2	6	2845273	2845278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53058	NC_010475	CAC	2	6	2845355	2845360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079310
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53060	NC_010475	CGC	2	6	2845446	2845451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079310
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53062	NC_010475	AG	3	6	2845479	2845484	50 %	0 %	50 %	0 %	170079310
53063	NC_010475	CAA	2	6	2845550	2845555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079310
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53069	NC_010475	CAG	2	6	2845967	2845972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079310
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53074	NC_010475	CGG	3	9	2846171	2846179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53075	NC_010475	CGG	2	6	2846204	2846209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079311
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53089	NC_010475	A	7	7	2847209	2847215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53090	NC_010475	TCTG	2	8	2847269	2847276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53091	NC_010475	TGT	2	6	2847390	2847395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079312
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53094	NC_010475	T	6	6	2847544	2847549	0 %	100 %	0 %	0 %	170079312
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53105	NC_010475	GAGG	2	8	2848205	2848212	25 %	0 %	75 %	0 %	170079312
53106	NC_010475	TTGG	2	8	2848232	2848239	0 %	50 %	50 %	0 %	170079312
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53109	NC_010475	ACG	2	6	2848458	2848463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079312
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53113	NC_010475	GGA	2	6	2848577	2848582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53118	NC_010475	AAT	2	6	2848868	2848873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079313
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53120	NC_010475	AG	3	6	2848949	2848954	50 %	0 %	50 %	0 %	170079313
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53155	NC_010475	GGC	2	6	2850594	2850599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53157	NC_010475	TGGG	2	8	2850658	2850665	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53158	NC_010475	TCA	2	6	2850676	2850681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53177	NC_010475	AGCCA	2	10	2851653	2851662	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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53223	NC_010475	GAA	2	6	2854403	2854408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53225	NC_010475	AGTAA	2	10	2854515	2854524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53226	NC_010475	AGTT	2	8	2854525	2854532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53227	NC_010475	TCG	2	6	2854570	2854575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53231	NC_010475	AG	3	6	2854694	2854699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53232	NC_010475	GGT	2	6	2854744	2854749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53235	NC_010475	T	6	6	2855059	2855064	0 %	100 %	0 %	0 %	170079321
53236	NC_010475	CGC	2	6	2855081	2855086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079321
53237	NC_010475	ACC	2	6	2855114	2855119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079321
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53354	NC_010475	T	6	6	2861297	2861302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53355	NC_010475	AGC	2	6	2861377	2861382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079328
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