MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010474	A	7	7	4	10	100 %	0 %	0 %	0 %	170076471
2	NC_010474	TGG	2	6	71	76	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
3	NC_010474	CGC	2	6	136	141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
4	NC_010474	GAT	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076471
5	NC_010474	CCG	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076471
6	NC_010474	ACCCA	2	10	232	241	40 %	0 %	0 %	60 %	170076471
7	NC_010474	TG	3	6	286	291	0 %	50 %	50 %	0 %	170076471
8	NC_010474	GTG	3	9	289	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076471
9	NC_010474	AACTCG	2	12	311	322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170076471
10	NC_010474	GCCCAA	2	12	358	369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170076471
11	NC_010474	T	6	6	374	379	0 %	100 %	0 %	0 %	170076471
12	NC_010474	CTA	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076471
13	NC_010474	AGC	2	6	534	539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076471
14	NC_010474	ATT	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076471
15	NC_010474	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
16	NC_010474	CAAC	2	8	626	633	50 %	0 %	0 %	50 %	170076472
17	NC_010474	CCG	2	6	652	657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076472
18	NC_010474	TGT	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076472
19	NC_010474	G	6	6	728	733	0 %	0 %	100 %	0 %	170076472
20	NC_010474	TCGAT	2	10	775	784	20 %	40 %	20 %	20 %	170076472
21	NC_010474	GTG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076472
22	NC_010474	CGG	3	9	949	957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
23	NC_010474	GAA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076472
24	NC_010474	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076472
25	NC_010474	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
26	NC_010474	CTG	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076472
27	NC_010474	ACCT	2	8	1193	1200	25 %	25 %	0 %	50 %	170076472
28	NC_010474	AAC	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076472
29	NC_010474	CTC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076472
30	NC_010474	ACC	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076472
31	NC_010474	A	6	6	1342	1347	100 %	0 %	0 %	0 %	170076472
32	NC_010474	AGGT	2	8	1361	1368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010474	ACCT	2	8	1373	1380	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010474	T	6	6	1380	1385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010474	A	6	6	1431	1436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010474	TAT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
37	NC_010474	A	6	6	1532	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	170076474
38	NC_010474	TGG	2	6	1547	1552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
39	NC_010474	ATT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076474
40	NC_010474	A	6	6	1577	1582	100 %	0 %	0 %	0 %	170076474
41	NC_010474	TTCT	2	8	1672	1679	0 %	75 %	0 %	25 %	170076474
42	NC_010474	TGG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
43	NC_010474	CGATCG	2	12	1697	1708	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076474
44	NC_010474	TGCC	2	8	1751	1758	0 %	25 %	25 %	50 %	170076474
45	NC_010474	G	6	6	1800	1805	0 %	0 %	100 %	0 %	170076474
46	NC_010474	GGT	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076474
47	NC_010474	CGA	2	6	1875	1880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076474
48	NC_010474	CAT	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076474
49	NC_010474	GGC	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
50	NC_010474	GCA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076473
51	NC_010474	A	6	6	2124	2129	100 %	0 %	0 %	0 %	170076473
52	NC_010474	GTT	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076473
53	NC_010474	CG	3	6	2309	2314	0 %	0 %	50 %	50 %	170076473
54	NC_010474	GCG	2	6	2447	2452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
55	NC_010474	GCCA	2	8	2498	2505	25 %	0 %	25 %	50 %	170076473
56	NC_010474	CGG	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076473
57	NC_010474	A	6	6	2547	2552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010474	A	8	8	2600	2607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010474	ACT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
60	NC_010474	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
61	NC_010474	ATC	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076475
62	NC_010474	CAC	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076475
63	NC_010474	CAAA	2	8	2913	2920	75 %	0 %	0 %	25 %	170076475
64	NC_010474	CTT	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076475
65	NC_010474	AG	3	6	3175	3180	50 %	0 %	50 %	0 %	170076475
66	NC_010474	CTCC	2	8	3256	3263	0 %	25 %	0 %	75 %	170076475
67	NC_010474	T	6	6	3355	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	170076475
68	NC_010474	TAA	2	6	3499	3504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076475
69	NC_010474	GAC	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076475
70	NC_010474	TC	3	6	3571	3576	0 %	50 %	0 %	50 %	170076475
71	NC_010474	ACT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
72	NC_010474	CCA	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
73	NC_010474	TC	3	6	3900	3905	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
74	NC_010474	TCT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
75	NC_010474	TGAGC	2	10	4122	4131	20 %	20 %	40 %	20 %	170076476
76	NC_010474	A	6	6	4183	4188	100 %	0 %	0 %	0 %	170076476
77	NC_010474	TGAT	2	8	4228	4235	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
78	NC_010474	GGTT	2	8	4313	4320	0 %	50 %	50 %	0 %	170076476
79	NC_010474	CAAA	2	8	4413	4420	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
80	NC_010474	CAT	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
81	NC_010474	CCT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
82	NC_010474	GAA	2	6	4507	4512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
83	NC_010474	GATC	2	8	4536	4543	25 %	25 %	25 %	25 %	170076476
84	NC_010474	CCA	2	6	4563	4568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
85	NC_010474	GTT	2	6	4650	4655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
86	NC_010474	GGT	2	6	4726	4731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076476
87	NC_010474	C	6	6	4749	4754	0 %	0 %	0 %	100 %	170076476
88	NC_010474	ATA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
89	NC_010474	CCT	3	9	4982	4990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076476
90	NC_010474	GGGCTT	2	12	5019	5030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170076476
91	NC_010474	TGT	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
92	NC_010474	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
93	NC_010474	ACT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
94	NC_010474	AAT	2	6	5259	5264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
95	NC_010474	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076476
96	NC_010474	AGC	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076476
97	NC_010474	TC	3	6	5374	5379	0 %	50 %	0 %	50 %	170076476
98	NC_010474	TAA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
99	NC_010474	AG	3	6	5436	5441	50 %	0 %	50 %	0 %	170076476
100	NC_010474	TTGA	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	170076476
101	NC_010474	TAA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
102	NC_010474	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076476
103	NC_010474	ACC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076476
104	NC_010474	AAAC	2	8	5815	5822	75 %	0 %	0 %	25 %	170076476
105	NC_010474	AAT	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
106	NC_010474	CGT	3	9	6046	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076476
107	NC_010474	AAT	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076476
108	NC_010474	GGGC	2	8	6126	6133	0 %	0 %	75 %	25 %	170076476
109	NC_010474	CAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076476
110	NC_010474	TTG	2	6	6193	6198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076476
111	NC_010474	AAT	2	6	6230	6235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010474	T	6	6	6286	6291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010474	GTT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
114	NC_010474	TGT	2	6	6413	6418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076477
115	NC_010474	AATT	2	8	6465	6472	50 %	50 %	0 %	0 %	170076477
116	NC_010474	TAG	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
117	NC_010474	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076477
118	NC_010474	G	6	6	6670	6675	0 %	0 %	100 %	0 %	170076477
119	NC_010474	AAT	2	6	6721	6726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
120	NC_010474	CT	3	6	6739	6744	0 %	50 %	0 %	50 %	170076477
121	NC_010474	T	6	6	6851	6856	0 %	100 %	0 %	0 %	170076477
122	NC_010474	GATC	2	8	6857	6864	25 %	25 %	25 %	25 %	170076477
123	NC_010474	GCG	2	6	6875	6880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076477
124	NC_010474	GAAG	2	8	6917	6924	50 %	0 %	50 %	0 %	170076477
125	NC_010474	AAT	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076477
126	NC_010474	CCTGG	2	10	6962	6971	0 %	20 %	40 %	40 %	170076477
127	NC_010474	TCA	2	6	6976	6981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076477
128	NC_010474	ATTTG	2	10	7009	7018	20 %	60 %	20 %	0 %	170076477
129	NC_010474	GAT	2	6	7037	7042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076477
130	NC_010474	ATTG	2	8	7060	7067	25 %	50 %	25 %	0 %	170076477
131	NC_010474	TCG	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076477
132	NC_010474	TAG	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010474	ATT	2	6	7374	7379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010474	CAT	2	6	7382	7387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010474	AAAC	2	8	7435	7442	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010474	CAA	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010474	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010474	TTG	2	6	7526	7531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010474	GTT	2	6	7539	7544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010474	ACGG	2	8	7581	7588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010474	T	6	6	7595	7600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010474	TGAT	2	8	7625	7632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010474	GAC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076478
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145	NC_010474	AATT	2	8	7859	7866	50 %	50 %	0 %	0 %	170076478
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149	NC_010474	GCTA	2	8	8042	8049	25 %	25 %	25 %	25 %	170076478
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273	NC_010474	GTG	2	6	14367	14372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_010474	AT	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_010474	GAA	2	6	14447	14452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_010474	GA	3	6	14469	14474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010474	A	7	7	14604	14610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_010474	A	7	7	14638	14644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_010474	A	6	6	21822	21827	100 %	0 %	0 %	0 %	170076487
406	NC_010474	G	6	6	21891	21896	0 %	0 %	100 %	0 %	170076487
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439	NC_010474	ATT	2	6	23327	23332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_010474	AATT	2	8	23373	23380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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