MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010474	TGA	2	6	79697	79702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076540
1502	NC_010474	A	9	9	79729	79737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010474	A	6	6	79794	79799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010474	GAAAA	2	10	79878	79887	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010474	A	7	7	79884	79890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010474	AG	3	6	79960	79965	50 %	0 %	50 %	0 %	170076541
1507	NC_010474	GCC	2	6	80103	80108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076541
1508	NC_010474	CCT	2	6	80232	80237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_010474	CGA	2	6	80349	80354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_010474	GTG	2	6	80388	80393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010474	GAC	2	6	80470	80475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076542
1512	NC_010474	TCCACC	2	12	80476	80487	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	170076542
1513	NC_010474	GCA	2	6	80497	80502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076542
1514	NC_010474	TC	3	6	80620	80625	0 %	50 %	0 %	50 %	170076542
1515	NC_010474	TACTGT	2	12	80684	80695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170076542
1516	NC_010474	CTT	2	6	80700	80705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076542
1517	NC_010474	TCA	2	6	80849	80854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_010474	GTCAA	2	10	80883	80892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_010474	TTC	2	6	80930	80935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_010474	TGC	2	6	80936	80941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_010474	GGC	2	6	81064	81069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_010474	TTGA	2	8	81098	81105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010474	CT	4	8	81129	81136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_010474	GTA	2	6	81200	81205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010474	A	6	6	81229	81234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_010474	GATT	2	8	81276	81283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010474	ATG	2	6	81287	81292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076544
1528	NC_010474	TCA	2	6	81305	81310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076544
1529	NC_010474	ATTT	2	8	81326	81333	25 %	75 %	0 %	0 %	170076544
1530	NC_010474	TGC	2	6	81385	81390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076544
1531	NC_010474	AGA	2	6	81448	81453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076544
1532	NC_010474	CGA	2	6	81529	81534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076544
1533	NC_010474	TTA	2	6	81545	81550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076544
1534	NC_010474	GGA	2	6	81581	81586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076544
1535	NC_010474	G	6	6	81609	81614	0 %	0 %	100 %	0 %	170076544
1536	NC_010474	ATT	2	6	81617	81622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076544
1537	NC_010474	TTA	2	6	81653	81658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076544
1538	NC_010474	ATT	2	6	81706	81711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076544
1539	NC_010474	AGG	2	6	81789	81794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076544
1540	NC_010474	TGGAGA	2	12	81861	81872	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	170076544
1541	NC_010474	TGG	3	9	82041	82049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076544
1542	NC_010474	GGA	2	6	82084	82089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076544
1543	NC_010474	CGG	2	6	82249	82254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076544
1544	NC_010474	TGGCCG	2	12	82266	82277	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170076544
1545	NC_010474	GCG	2	6	82322	82327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076544
1546	NC_010474	TAA	2	6	82342	82347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076544
1547	NC_010474	GTT	3	9	82351	82359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076544
1548	NC_010474	GCA	2	6	82430	82435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076544
1549	NC_010474	GCG	2	6	82466	82471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076544
1550	NC_010474	GGT	2	6	82498	82503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076544
1551	NC_010474	CGTT	2	8	82550	82557	0 %	50 %	25 %	25 %	170076544
1552	NC_010474	GGA	2	6	82594	82599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076544
1553	NC_010474	GAA	2	6	82808	82813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076544
1554	NC_010474	ATTA	2	8	82898	82905	50 %	50 %	0 %	0 %	170076544
1555	NC_010474	AAT	2	6	82912	82917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076543
1556	NC_010474	CAC	2	6	82918	82923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076543
1557	NC_010474	T	6	6	82935	82940	0 %	100 %	0 %	0 %	170076543
1558	NC_010474	ACCGA	2	10	82958	82967	40 %	0 %	20 %	40 %	170076543
1559	NC_010474	ATT	2	6	82975	82980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076543
1560	NC_010474	CGG	2	6	83108	83113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076543
1561	NC_010474	TGT	2	6	83117	83122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076543
1562	NC_010474	ACG	2	6	83191	83196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076543
1563	NC_010474	AGG	2	6	83258	83263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076543
1564	NC_010474	GCG	2	6	83269	83274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076543
1565	NC_010474	TGG	2	6	83289	83294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076543
1566	NC_010474	GAG	2	6	83314	83319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076543
1567	NC_010474	AG	3	6	83374	83379	50 %	0 %	50 %	0 %	170076543
1568	NC_010474	GCA	2	6	83478	83483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076543
1569	NC_010474	A	7	7	83483	83489	100 %	0 %	0 %	0 %	170076543
1570	NC_010474	CCAGT	2	10	83501	83510	20 %	20 %	20 %	40 %	170076543
1571	NC_010474	GA	3	6	83525	83530	50 %	0 %	50 %	0 %	170076543
1572	NC_010474	C	7	7	83548	83554	0 %	0 %	0 %	100 %	170076543
1573	NC_010474	AAT	2	6	83644	83649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076543
1574	NC_010474	A	6	6	83723	83728	100 %	0 %	0 %	0 %	170076543
1575	NC_010474	GCG	2	6	83807	83812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076543
1576	NC_010474	GCA	2	6	83934	83939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076543
1577	NC_010474	GACTGA	2	12	83949	83960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170076543
1578	NC_010474	CCG	2	6	83963	83968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076543
1579	NC_010474	CAG	3	9	84010	84018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076543
1580	NC_010474	T	6	6	84085	84090	0 %	100 %	0 %	0 %	170076543
1581	NC_010474	GCA	2	6	84117	84122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076543
1582	NC_010474	CCG	2	6	84138	84143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076543
1583	NC_010474	CA	3	6	84160	84165	50 %	0 %	0 %	50 %	170076543
1584	NC_010474	CAA	2	6	84169	84174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076543
1585	NC_010474	A	6	6	84251	84256	100 %	0 %	0 %	0 %	170076543
1586	NC_010474	TCA	2	6	84321	84326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076543
1587	NC_010474	ATCACC	2	12	84329	84340	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	170076543
1588	NC_010474	GCG	2	6	84359	84364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076543
1589	NC_010474	CAA	2	6	84420	84425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076543
1590	NC_010474	C	6	6	84472	84477	0 %	0 %	0 %	100 %	170076543
1591	NC_010474	A	7	7	84478	84484	100 %	0 %	0 %	0 %	170076543
1592	NC_010474	ATA	2	6	84503	84508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076543
1593	NC_010474	GGT	2	6	84539	84544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010474	CAC	2	6	84608	84613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_010474	ACTG	2	8	84713	84720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_010474	CTG	2	6	84738	84743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_010474	TTG	2	6	84777	84782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010474	CCGT	2	8	84834	84841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_010474	CGT	2	6	84844	84849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_010474	TGTC	2	8	84853	84860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_010474	GA	3	6	84903	84908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010474	AC	3	6	84943	84948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_010474	TTGGC	2	10	84957	84966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1604	NC_010474	C	6	6	84978	84983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1605	NC_010474	TCC	2	6	85046	85051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_010474	TTG	2	6	85070	85075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076545
1607	NC_010474	TGG	2	6	85092	85097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076545
1608	NC_010474	CTT	2	6	85187	85192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076545
1609	NC_010474	GCA	2	6	85293	85298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076545
1610	NC_010474	TTGG	2	8	85324	85331	0 %	50 %	50 %	0 %	170076545
1611	NC_010474	TGACTA	2	12	85350	85361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170076545
1612	NC_010474	CAGT	2	8	85435	85442	25 %	25 %	25 %	25 %	170076545
1613	NC_010474	CCA	2	6	85452	85457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076545
1614	NC_010474	GGC	2	6	85521	85526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076545
1615	NC_010474	GTT	2	6	85538	85543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076545
1616	NC_010474	GTT	2	6	85566	85571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076545
1617	NC_010474	CGT	2	6	85817	85822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076545
1618	NC_010474	T	6	6	85836	85841	0 %	100 %	0 %	0 %	170076545
1619	NC_010474	GCG	2	6	85927	85932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076545
1620	NC_010474	TTG	2	6	85940	85945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076545
1621	NC_010474	GCC	3	9	86023	86031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076545
1622	NC_010474	CGC	2	6	86088	86093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076545
1623	NC_010474	CGC	2	6	86176	86181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076545
1624	NC_010474	GGTG	2	8	86201	86208	0 %	25 %	75 %	0 %	170076545
1625	NC_010474	TCC	2	6	86328	86333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076545
1626	NC_010474	ATA	2	6	86390	86395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010474	TTA	2	6	86415	86420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010474	A	6	6	86432	86437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010474	AAT	2	6	86467	86472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010474	TAA	2	6	86496	86501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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