MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ7

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010474	TGA	2	6	51911	51916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076521
1002	NC_010474	TGCCA	2	10	52005	52014	20 %	20 %	20 %	40 %	170076521
1003	NC_010474	AT	3	6	52019	52024	50 %	50 %	0 %	0 %	170076521
1004	NC_010474	CTC	2	6	52044	52049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076521
1005	NC_010474	GA	3	6	52080	52085	50 %	0 %	50 %	0 %	170076521
1006	NC_010474	ATC	2	6	52086	52091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076521
1007	NC_010474	GGCCAT	2	12	52109	52120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076521
1008	NC_010474	TGA	2	6	52226	52231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076521
1009	NC_010474	CAG	2	6	52346	52351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076521
1010	NC_010474	GCA	2	6	52369	52374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076521
1011	NC_010474	GTC	2	6	52401	52406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076521
1012	NC_010474	AC	3	6	52470	52475	50 %	0 %	0 %	50 %	170076521
1013	NC_010474	GAT	2	6	52569	52574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076521
1014	NC_010474	ATT	2	6	52585	52590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076521
1015	NC_010474	A	7	7	52645	52651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010474	GGA	2	6	52703	52708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010474	ACA	2	6	52738	52743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_010474	ACC	2	6	52806	52811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076522
1019	NC_010474	GAA	2	6	52851	52856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076522
1020	NC_010474	CCTA	2	8	52859	52866	25 %	25 %	0 %	50 %	170076522
1021	NC_010474	AAG	2	6	52937	52942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076522
1022	NC_010474	A	6	6	52950	52955	100 %	0 %	0 %	0 %	170076522
1023	NC_010474	TACC	2	8	52959	52966	25 %	25 %	0 %	50 %	170076522
1024	NC_010474	CCA	2	6	53218	53223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_010474	CGA	2	6	53283	53288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010474	AGA	2	6	53304	53309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_010474	CTTG	2	8	53334	53341	0 %	50 %	25 %	25 %	170076523
1028	NC_010474	GCC	2	6	53368	53373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076523
1029	NC_010474	AG	3	6	53414	53419	50 %	0 %	50 %	0 %	170076523
1030	NC_010474	CAG	2	6	53486	53491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076523
1031	NC_010474	GAT	2	6	53560	53565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076523
1032	NC_010474	ACC	2	6	53600	53605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076523
1033	NC_010474	CTG	2	6	53666	53671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076523
1034	NC_010474	TCTATT	2	12	53757	53768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1035	NC_010474	T	7	7	53767	53773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010474	AAT	2	6	53823	53828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010474	A	7	7	53878	53884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010474	TCT	2	6	53924	53929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010474	T	7	7	53933	53939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010474	A	7	7	54044	54050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010474	G	6	6	54061	54066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010474	GCTTT	2	10	54097	54106	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_010474	TCT	2	6	54117	54122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010474	TGCT	2	8	54158	54165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_010474	AGTT	2	8	54188	54195	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010474	ATT	2	6	54204	54209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076524
1047	NC_010474	GCT	2	6	54251	54256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076524
1048	NC_010474	AAT	3	9	54274	54282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076524
1049	NC_010474	CGA	2	6	54295	54300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076524
1050	NC_010474	ACAA	2	8	54484	54491	75 %	0 %	0 %	25 %	170076524
1051	NC_010474	ATAC	2	8	54562	54569	50 %	25 %	0 %	25 %	170076524
1052	NC_010474	TTC	3	9	54621	54629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076524
1053	NC_010474	AATTA	2	10	54672	54681	60 %	40 %	0 %	0 %	170076524
1054	NC_010474	ACG	2	6	54684	54689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076524
1055	NC_010474	A	7	7	54690	54696	100 %	0 %	0 %	0 %	170076524
1056	NC_010474	T	6	6	54716	54721	0 %	100 %	0 %	0 %	170076524
1057	NC_010474	TCCT	2	8	54738	54745	0 %	50 %	0 %	50 %	170076524
1058	NC_010474	ACA	2	6	54784	54789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076524
1059	NC_010474	TCA	2	6	54793	54798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076524
1060	NC_010474	CAT	2	6	54800	54805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076524
1061	NC_010474	TCGG	2	8	54813	54820	0 %	25 %	50 %	25 %	170076524
1062	NC_010474	TAC	2	6	54834	54839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076524
1063	NC_010474	T	6	6	54929	54934	0 %	100 %	0 %	0 %	170076524
1064	NC_010474	GTT	2	6	55114	55119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076524
1065	NC_010474	TCC	2	6	55120	55125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076524
1066	NC_010474	TAA	2	6	55140	55145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076524
1067	NC_010474	CTT	2	6	55187	55192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076524
1068	NC_010474	TAGT	2	8	55273	55280	25 %	50 %	25 %	0 %	170076524
1069	NC_010474	GCG	2	6	55282	55287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076524
1070	NC_010474	CAG	2	6	55410	55415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076525
1071	NC_010474	TCA	2	6	55475	55480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076525
1072	NC_010474	GCG	2	6	55496	55501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076525
1073	NC_010474	TAG	2	6	55530	55535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076525
1074	NC_010474	GCCAGA	2	12	55555	55566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076525
1075	NC_010474	CAG	2	6	55581	55586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076525
1076	NC_010474	TCG	2	6	55668	55673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076525
1077	NC_010474	GGC	2	6	55693	55698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076525
1078	NC_010474	CTA	2	6	55754	55759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076525
1079	NC_010474	TTGGA	2	10	55828	55837	20 %	40 %	40 %	0 %	170076525
1080	NC_010474	AGTA	2	8	55885	55892	50 %	25 %	25 %	0 %	170076525
1081	NC_010474	AAAG	2	8	55896	55903	75 %	0 %	25 %	0 %	170076525
1082	NC_010474	GTA	2	6	55907	55912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076525
1083	NC_010474	AAAG	2	8	55967	55974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010474	CAG	2	6	55990	55995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076526
1085	NC_010474	T	7	7	56004	56010	0 %	100 %	0 %	0 %	170076526
1086	NC_010474	ATTC	2	8	56072	56079	25 %	50 %	0 %	25 %	170076526
1087	NC_010474	GGC	2	6	56170	56175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076527
1088	NC_010474	ACC	2	6	56186	56191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076527
1089	NC_010474	GCG	2	6	56314	56319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076527
1090	NC_010474	GTA	2	6	56322	56327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076527
1091	NC_010474	TCA	2	6	56379	56384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076527
1092	NC_010474	GTG	2	6	56412	56417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010474	GTG	2	6	56470	56475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076528
1094	NC_010474	GC	3	6	56476	56481	0 %	0 %	50 %	50 %	170076528
1095	NC_010474	CAG	2	6	56495	56500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076528
1096	NC_010474	T	7	7	56662	56668	0 %	100 %	0 %	0 %	170076528
1097	NC_010474	CAG	3	9	56726	56734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076528
1098	NC_010474	ACG	2	6	56758	56763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076528
1099	NC_010474	ATGA	2	8	56814	56821	50 %	25 %	25 %	0 %	170076528
1100	NC_010474	ATC	2	6	56881	56886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076528
1101	NC_010474	AGT	2	6	56914	56919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076528
1102	NC_010474	TTG	2	6	56943	56948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076528
1103	NC_010474	TGT	2	6	56989	56994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076528
1104	NC_010474	AGC	2	6	57006	57011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076528
1105	NC_010474	GAA	2	6	57212	57217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076528
1106	NC_010474	A	6	6	57216	57221	100 %	0 %	0 %	0 %	170076528
1107	NC_010474	ATG	2	6	57226	57231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076528
1108	NC_010474	CAA	3	9	57261	57269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076529
1109	NC_010474	AGT	2	6	57341	57346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076529
1110	NC_010474	AAT	2	6	57406	57411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076529
1111	NC_010474	CAGA	2	8	57432	57439	50 %	0 %	25 %	25 %	170076529
1112	NC_010474	CGC	2	6	57490	57495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076529
1113	NC_010474	CGCGC	2	10	57562	57571	0 %	0 %	40 %	60 %	170076529
1114	NC_010474	TGG	2	6	57615	57620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076529
1115	NC_010474	CTT	2	6	57651	57656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076529
1116	NC_010474	AGC	2	6	57658	57663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076529
1117	NC_010474	CAA	2	6	57810	57815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076529
1118	NC_010474	TGA	2	6	57936	57941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076529
1119	NC_010474	TCA	2	6	57971	57976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076529
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1121	NC_010474	ACC	2	6	58054	58059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076529
1122	NC_010474	CCA	2	6	58112	58117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076529
1123	NC_010474	CCG	2	6	58170	58175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076529
1124	NC_010474	TGC	3	9	58205	58213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076529
1125	NC_010474	GTG	2	6	58244	58249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076529
1126	NC_010474	CAGC	2	8	58263	58270	25 %	0 %	25 %	50 %	170076529
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1128	NC_010474	AGT	2	6	58469	58474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076529
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