MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22004	NC_010334	GCA	2	6	1219140	1219145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622930
22005	NC_010334	GGT	2	6	1219146	1219151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622930
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22007	NC_010334	TGA	2	6	1219196	1219201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622930
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22009	NC_010334	GCC	2	6	1219333	1219338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622930
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22017	NC_010334	TAT	2	6	1219699	1219704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22120	NC_010334	AAACC	2	10	1226377	1226386	60 %	0 %	0 %	40 %	167622936
22121	NC_010334	CGTT	2	8	1226425	1226432	0 %	50 %	25 %	25 %	167622936
22122	NC_010334	TTG	3	9	1226449	1226457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622936
22123	NC_010334	A	6	6	1226485	1226490	100 %	0 %	0 %	0 %	167622936
22124	NC_010334	GGT	2	6	1226514	1226519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622936
22125	NC_010334	GGC	2	6	1226589	1226594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622936
22126	NC_010334	ATGA	2	8	1226608	1226615	50 %	25 %	25 %	0 %	167622936
22127	NC_010334	TAC	2	6	1226938	1226943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622936
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22134	NC_010334	GAA	2	6	1227257	1227262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622937
22135	NC_010334	TAC	2	6	1227320	1227325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622937
22136	NC_010334	CCA	2	6	1227354	1227359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622937
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22138	NC_010334	TGC	2	6	1227456	1227461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622937
22139	NC_010334	TAA	2	6	1227529	1227534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622937
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22142	NC_010334	CAT	2	6	1227607	1227612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622937
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22144	NC_010334	GCG	2	6	1227753	1227758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622937
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22146	NC_010334	TGG	2	6	1227823	1227828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622937
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22149	NC_010334	GCT	2	6	1227925	1227930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622937
22150	NC_010334	GAA	2	6	1227990	1227995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622937
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22154	NC_010334	GTCT	2	8	1228325	1228332	0 %	50 %	25 %	25 %	167622938
22155	NC_010334	TAC	2	6	1228334	1228339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622938
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22162	NC_010334	CGT	2	6	1228765	1228770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622938
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22195	NC_010334	TGAT	2	8	1230378	1230385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22196	NC_010334	TAC	2	6	1230455	1230460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622940
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22211	NC_010334	GTC	2	6	1231054	1231059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622940
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22216	NC_010334	GAT	2	6	1231263	1231268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622940
22217	NC_010334	GAT	2	6	1231465	1231470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622940
22218	NC_010334	TTTG	2	8	1231491	1231498	0 %	75 %	25 %	0 %	167622940
22219	NC_010334	TGG	2	6	1231500	1231505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622940
22220	NC_010334	CTT	2	6	1231530	1231535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622940
22221	NC_010334	GAT	2	6	1231633	1231638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622940
22222	NC_010334	AGC	2	6	1231674	1231679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622940
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22224	NC_010334	ATC	2	6	1231800	1231805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622940
22225	NC_010334	TCA	2	6	1231898	1231903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22226	NC_010334	GCC	2	6	1231957	1231962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622941
22227	NC_010334	GCG	2	6	1231965	1231970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622941
22228	NC_010334	CTAT	2	8	1231999	1232006	25 %	50 %	0 %	25 %	167622941
22229	NC_010334	GC	3	6	1232012	1232017	0 %	0 %	50 %	50 %	167622941
22230	NC_010334	TGG	2	6	1232069	1232074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622941
22231	NC_010334	GT	3	6	1232193	1232198	0 %	50 %	50 %	0 %	167622941
22232	NC_010334	GGC	2	6	1232357	1232362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622941
22233	NC_010334	CATCG	2	10	1232477	1232486	20 %	20 %	20 %	40 %	167622941
22234	NC_010334	ATG	2	6	1232506	1232511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622941
22235	NC_010334	GAT	2	6	1232520	1232525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622941
22236	NC_010334	GCA	2	6	1232529	1232534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622941
22237	NC_010334	ATT	2	6	1232535	1232540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622941
22238	NC_010334	GAGG	2	8	1232559	1232566	25 %	0 %	75 %	0 %	167622941
22239	NC_010334	TAT	2	6	1232627	1232632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622941
22240	NC_010334	CTT	2	6	1232678	1232683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622941
22241	NC_010334	CAC	2	6	1232717	1232722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622941
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22253	NC_010334	T	6	6	1233284	1233289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22254	NC_010334	ACT	2	6	1233303	1233308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622942
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22261	NC_010334	TAT	2	6	1233904	1233909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22263	NC_010334	CAA	2	6	1233975	1233980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22264	NC_010334	AGA	2	6	1234036	1234041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22265	NC_010334	TTA	2	6	1234161	1234166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22270	NC_010334	AT	3	6	1234344	1234349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22271	NC_010334	TGG	2	6	1234401	1234406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22273	NC_010334	AATC	2	8	1234593	1234600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22274	NC_010334	A	9	9	1234627	1234635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22347	NC_010334	CTA	2	6	1238357	1238362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622944
22348	NC_010334	GTT	2	6	1238398	1238403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22349	NC_010334	GCC	2	6	1238408	1238413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22350	NC_010334	AAAT	2	8	1238458	1238465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22351	NC_010334	ACAA	2	8	1238481	1238488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22352	NC_010334	TCAT	2	8	1238507	1238514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22353	NC_010334	GCC	2	6	1238564	1238569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622945
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22355	NC_010334	CAAC	2	8	1238664	1238671	50 %	0 %	0 %	50 %	167622945
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22473	NC_010334	GAT	2	6	1245781	1245786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622954
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