MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_010334	CAT	2	6	1188591	1188596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622906
21503	NC_010334	AAT	2	6	1188857	1188862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622907
21504	NC_010334	AG	3	6	1188886	1188891	50 %	0 %	50 %	0 %	167622907
21505	NC_010334	ATG	2	6	1188903	1188908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622907
21506	NC_010334	TCAA	2	8	1188922	1188929	50 %	25 %	0 %	25 %	167622907
21507	NC_010334	TGC	2	6	1188939	1188944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622907
21508	NC_010334	AG	3	6	1188998	1189003	50 %	0 %	50 %	0 %	167622907
21509	NC_010334	GA	3	6	1189038	1189043	50 %	0 %	50 %	0 %	167622907
21510	NC_010334	CGG	2	6	1189044	1189049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622907
21511	NC_010334	TGAGG	2	10	1189123	1189132	20 %	20 %	60 %	0 %	167622907
21512	NC_010334	GCA	2	6	1189148	1189153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622907
21513	NC_010334	TG	3	6	1189208	1189213	0 %	50 %	50 %	0 %	167622907
21514	NC_010334	TTA	2	6	1189271	1189276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21515	NC_010334	AG	3	6	1189288	1189293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21516	NC_010334	T	6	6	1189347	1189352	0 %	100 %	0 %	0 %	167622908
21517	NC_010334	TTGA	2	8	1189382	1189389	25 %	50 %	25 %	0 %	167622908
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21520	NC_010334	CGA	2	6	1189659	1189664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622908
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21522	NC_010334	GGT	2	6	1190061	1190066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622908
21523	NC_010334	AACG	2	8	1190069	1190076	50 %	0 %	25 %	25 %	167622908
21524	NC_010334	CT	3	6	1190182	1190187	0 %	50 %	0 %	50 %	167622908
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21533	NC_010334	GCCGC	2	10	1190665	1190674	0 %	0 %	40 %	60 %	167622908
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21537	NC_010334	CAGCT	2	10	1190896	1190905	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21538	NC_010334	CTG	2	6	1190954	1190959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21539	NC_010334	AGCC	2	8	1190962	1190969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21540	NC_010334	AAAT	2	8	1190982	1190989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21541	NC_010334	ATTT	2	8	1191048	1191055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21542	NC_010334	TAT	2	6	1191122	1191127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21543	NC_010334	GT	3	6	1191157	1191162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21544	NC_010334	TAA	2	6	1191163	1191168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21545	NC_010334	T	7	7	1191215	1191221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21546	NC_010334	A	6	6	1191249	1191254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21547	NC_010334	AATA	2	8	1191306	1191313	75 %	25 %	0 %	0 %	167622909
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21554	NC_010334	ATCA	2	8	1191644	1191651	50 %	25 %	0 %	25 %	167622909
21555	NC_010334	TAGA	2	8	1191716	1191723	50 %	25 %	25 %	0 %	167622909
21556	NC_010334	TTTG	2	8	1191736	1191743	0 %	75 %	25 %	0 %	167622909
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21568	NC_010334	ATG	2	6	1192142	1192147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622909
21569	NC_010334	AAG	2	6	1192204	1192209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622909
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21591	NC_010334	TG	3	6	1193209	1193214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21592	NC_010334	CTT	2	6	1193331	1193336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622910
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21611	NC_010334	AAT	2	6	1194077	1194082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21614	NC_010334	T	6	6	1194135	1194140	0 %	100 %	0 %	0 %	167622911
21615	NC_010334	GCT	2	6	1194205	1194210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622911
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21973	NC_010334	AAG	2	6	1217640	1217645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21974	NC_010334	TGA	2	6	1217804	1217809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622928
21975	NC_010334	GCTG	2	8	1217843	1217850	0 %	25 %	50 %	25 %	167622928
21976	NC_010334	CAT	2	6	1217888	1217893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622928
21977	NC_010334	ATTT	2	8	1217897	1217904	25 %	75 %	0 %	0 %	167622928
21978	NC_010334	ACT	3	9	1218028	1218036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622928
21979	NC_010334	AGC	2	6	1218052	1218057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622928
21980	NC_010334	TGT	2	6	1218068	1218073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622928
21981	NC_010334	GGCT	2	8	1218105	1218112	0 %	25 %	50 %	25 %	167622928
21982	NC_010334	CTG	2	6	1218127	1218132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622928
21983	NC_010334	GCT	3	9	1218157	1218165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622928
21984	NC_010334	GT	3	6	1218166	1218171	0 %	50 %	50 %	0 %	167622928
21985	NC_010334	TAA	2	6	1218179	1218184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622928
21986	NC_010334	T	7	7	1218204	1218210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21987	NC_010334	TAA	2	6	1218223	1218228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21988	NC_010334	CTAC	2	8	1218252	1218259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21989	NC_010334	ATT	2	6	1218276	1218281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21990	NC_010334	GCT	2	6	1218282	1218287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21991	NC_010334	AGTC	3	12	1218307	1218318	25 %	25 %	25 %	25 %	167622929
21992	NC_010334	ATA	2	6	1218453	1218458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622929
21993	NC_010334	CAG	2	6	1218491	1218496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622929
21994	NC_010334	GT	3	6	1218653	1218658	0 %	50 %	50 %	0 %	167622929
21995	NC_010334	CAT	2	6	1218754	1218759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622929
21996	NC_010334	GAT	2	6	1218764	1218769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622929
21997	NC_010334	GAGCT	2	10	1218792	1218801	20 %	20 %	40 %	20 %	167622929
21998	NC_010334	AGC	2	6	1218837	1218842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622929
21999	NC_010334	GTA	2	6	1218861	1218866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622929
22000	NC_010334	AAG	2	6	1218870	1218875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622929

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