MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21003	NC_010334	GAC	2	6	1161434	1161439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622883
21004	NC_010334	CCGC	2	8	1161531	1161538	0 %	0 %	25 %	75 %	167622883
21005	NC_010334	GAA	2	6	1161578	1161583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622883
21006	NC_010334	ATA	2	6	1161612	1161617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622883
21007	NC_010334	AAT	3	9	1161710	1161718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622883
21008	NC_010334	GCT	2	6	1161886	1161891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622883
21009	NC_010334	ATT	2	6	1161963	1161968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_010334	TATT	2	8	1161971	1161978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21011	NC_010334	T	8	8	1161986	1161993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21012	NC_010334	GCA	2	6	1162058	1162063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21013	NC_010334	TGC	2	6	1162154	1162159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21014	NC_010334	AGGG	2	8	1162189	1162196	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21015	NC_010334	CAA	2	6	1162222	1162227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21016	NC_010334	A	7	7	1162236	1162242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21017	NC_010334	TGT	2	6	1162252	1162257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_010334	AGTG	2	8	1162285	1162292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21019	NC_010334	GGC	2	6	1162379	1162384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622884
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21022	NC_010334	CAA	2	6	1162942	1162947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622884
21023	NC_010334	GAC	2	6	1162975	1162980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622884
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21032	NC_010334	ATG	2	6	1163537	1163542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622885
21033	NC_010334	GAT	2	6	1163563	1163568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21034	NC_010334	GCTT	2	8	1163584	1163591	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21035	NC_010334	TAA	2	6	1163595	1163600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_010334	A	8	8	1163599	1163606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_010334	TAA	2	6	1163614	1163619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21051	NC_010334	GAT	2	6	1164583	1164588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21053	NC_010334	G	7	7	1164730	1164736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_010334	GCAG	2	8	1164828	1164835	25 %	0 %	50 %	25 %	167622887
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21057	NC_010334	GGT	2	6	1164893	1164898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622887
21058	NC_010334	GAT	3	9	1164910	1164918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622887
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21062	NC_010334	GCCTT	2	10	1165055	1165064	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21063	NC_010334	CTG	2	6	1165112	1165117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622888
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21091	NC_010334	TGA	2	6	1166488	1166493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21102	NC_010334	GTG	2	6	1167482	1167487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622890
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21105	NC_010334	CGGT	2	8	1167570	1167577	0 %	25 %	50 %	25 %	167622890
21106	NC_010334	GCC	2	6	1167618	1167623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622890
21107	NC_010334	A	7	7	1167719	1167725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21108	NC_010334	TTA	2	6	1167763	1167768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_010334	GCT	2	6	1167810	1167815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21110	NC_010334	CAG	2	6	1167835	1167840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622891
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21112	NC_010334	CCA	2	6	1168002	1168007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622891
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21115	NC_010334	CCA	2	6	1168191	1168196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622891
21116	NC_010334	GCA	2	6	1168203	1168208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21117	NC_010334	TCA	3	9	1168304	1168312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622891
21118	NC_010334	AAG	2	6	1168329	1168334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622891
21119	NC_010334	GTA	2	6	1168372	1168377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622891
21120	NC_010334	GTTG	2	8	1168387	1168394	0 %	50 %	50 %	0 %	167622891
21121	NC_010334	CAT	2	6	1168497	1168502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622891
21122	NC_010334	AGC	2	6	1168515	1168520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21123	NC_010334	CAG	2	6	1168651	1168656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21124	NC_010334	ATG	2	6	1168682	1168687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622891
21125	NC_010334	TCT	2	6	1168698	1168703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622891
21126	NC_010334	GCTC	2	8	1168788	1168795	0 %	25 %	25 %	50 %	167622891
21127	NC_010334	TGC	2	6	1168810	1168815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21128	NC_010334	CCAT	2	8	1168838	1168845	25 %	25 %	0 %	50 %	167622891
21129	NC_010334	GCTAAA	2	12	1168879	1168890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	167622891
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21131	NC_010334	GT	3	6	1169055	1169060	0 %	50 %	50 %	0 %	167622891
21132	NC_010334	CTG	2	6	1169087	1169092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622891
21133	NC_010334	GTTAA	2	10	1169165	1169174	40 %	40 %	20 %	0 %	167622891
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21139	NC_010334	AGT	2	6	1169634	1169639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622891
21140	NC_010334	AGAT	2	8	1169729	1169736	50 %	25 %	25 %	0 %	167622891
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21154	NC_010334	TGA	2	6	1170255	1170260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622891
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21162	NC_010334	T	7	7	1170759	1170765	0 %	100 %	0 %	0 %	167622891
21163	NC_010334	TAA	2	6	1170838	1170843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21164	NC_010334	TTG	2	6	1170861	1170866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21167	NC_010334	AAT	2	6	1170979	1170984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21168	NC_010334	AAT	2	6	1171006	1171011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21169	NC_010334	TGC	2	6	1171060	1171065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21171	NC_010334	TGG	2	6	1171136	1171141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21172	NC_010334	TCA	2	6	1171204	1171209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622892
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21193	NC_010334	AACT	2	8	1172404	1172411	50 %	25 %	0 %	25 %	167622892
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21202	NC_010334	CTA	2	6	1172863	1172868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622892
21203	NC_010334	T	6	6	1172975	1172980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21204	NC_010334	CAGCT	2	10	1173032	1173041	20 %	20 %	20 %	40 %	167622893
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21209	NC_010334	CAT	2	6	1173295	1173300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
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21211	NC_010334	GGC	2	6	1173536	1173541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622893
21212	NC_010334	CAT	2	6	1173614	1173619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21213	NC_010334	TTAG	2	8	1173714	1173721	25 %	50 %	25 %	0 %	167622893
21214	NC_010334	CAA	2	6	1173892	1173897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622893
21215	NC_010334	TCG	2	6	1173933	1173938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622893
21216	NC_010334	CAT	2	6	1174172	1174177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21217	NC_010334	CTTAGA	2	12	1174253	1174264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622893
21218	NC_010334	TCA	2	6	1174281	1174286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21219	NC_010334	TGA	2	6	1174348	1174353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622893
21220	NC_010334	TCA	2	6	1174363	1174368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21221	NC_010334	AGA	3	9	1174387	1174395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622893
21222	NC_010334	CAG	2	6	1174447	1174452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622893
21223	NC_010334	GCAC	2	8	1174563	1174570	25 %	0 %	25 %	50 %	167622893
21224	NC_010334	TCA	2	6	1174578	1174583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21225	NC_010334	TCG	2	6	1174608	1174613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622893
21226	NC_010334	CCA	2	6	1174637	1174642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622893
21227	NC_010334	CTG	2	6	1174706	1174711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622893
21228	NC_010334	TAC	2	6	1174811	1174816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622893
21229	NC_010334	CAA	2	6	1174894	1174899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622893
21230	NC_010334	TAT	2	6	1174951	1174956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622893
21231	NC_010334	GTT	2	6	1174964	1174969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622893
21232	NC_010334	TGT	2	6	1175032	1175037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622893
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21234	NC_010334	TGC	2	6	1175341	1175346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622893
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21254	NC_010334	ATTT	2	8	1176537	1176544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21345	NC_010334	ATA	2	6	1181512	1181517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21346	NC_010334	TAG	2	6	1181531	1181536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21347	NC_010334	GGGA	2	8	1181561	1181568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21348	NC_010334	T	6	6	1181622	1181627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21349	NC_010334	TACT	2	8	1181632	1181639	25 %	50 %	0 %	25 %	167622900
21350	NC_010334	G	6	6	1181645	1181650	0 %	0 %	100 %	0 %	167622900
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21352	NC_010334	A	7	7	1181688	1181694	100 %	0 %	0 %	0 %	167622900
21353	NC_010334	CAA	3	9	1181741	1181749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622900
21354	NC_010334	TCA	2	6	1181807	1181812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622900
21355	NC_010334	GCCA	2	8	1181857	1181864	25 %	0 %	25 %	50 %	167622900
21356	NC_010334	GT	3	6	1181872	1181877	0 %	50 %	50 %	0 %	167622900
21357	NC_010334	TCA	2	6	1181994	1181999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21358	NC_010334	A	6	6	1182021	1182026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21359	NC_010334	TTA	2	6	1182049	1182054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21360	NC_010334	TGGT	2	8	1182104	1182111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21361	NC_010334	ACC	2	6	1182146	1182151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21362	NC_010334	AAT	2	6	1182159	1182164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21363	NC_010334	CTT	2	6	1182220	1182225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622901
21364	NC_010334	GTT	2	6	1182264	1182269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622901
21365	NC_010334	T	8	8	1182268	1182275	0 %	100 %	0 %	0 %	167622901
21366	NC_010334	GCG	2	6	1182296	1182301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622901
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21371	NC_010334	TGT	2	6	1182528	1182533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622901
21372	NC_010334	TTAT	2	8	1182554	1182561	25 %	75 %	0 %	0 %	167622901
21373	NC_010334	TTG	2	6	1182627	1182632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622901
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21384	NC_010334	TTAA	2	8	1183025	1183032	50 %	50 %	0 %	0 %	167622901
21385	NC_010334	A	6	6	1183058	1183063	100 %	0 %	0 %	0 %	167622901
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21392	NC_010334	AGTC	2	8	1183575	1183582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21393	NC_010334	AT	3	6	1183611	1183616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21394	NC_010334	T	6	6	1183645	1183650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21395	NC_010334	TCATC	2	10	1183681	1183690	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21396	NC_010334	AAAC	2	8	1183707	1183714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21397	NC_010334	A	6	6	1183775	1183780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21398	NC_010334	GATT	2	8	1183858	1183865	25 %	50 %	25 %	0 %	167622902
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21428	NC_010334	TTA	2	6	1185377	1185382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21459	NC_010334	ATG	2	6	1186810	1186815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
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21462	NC_010334	ATG	2	6	1187017	1187022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21463	NC_010334	GTGG	2	8	1187031	1187038	0 %	25 %	75 %	0 %	167622904
21464	NC_010334	AT	3	6	1187081	1187086	50 %	50 %	0 %	0 %	167622904
21465	NC_010334	TGG	2	6	1187088	1187093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622904
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21468	NC_010334	TGA	2	6	1187205	1187210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21469	NC_010334	ATG	2	6	1187279	1187284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21470	NC_010334	AGA	2	6	1187287	1187292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622904
21471	NC_010334	TGA	2	6	1187304	1187309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21472	NC_010334	GGT	2	6	1187313	1187318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622904
21473	NC_010334	AACC	2	8	1187322	1187329	50 %	0 %	0 %	50 %	167622904
21474	NC_010334	TCG	2	6	1187350	1187355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622904
21475	NC_010334	GTG	2	6	1187377	1187382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622904
21476	NC_010334	ATT	2	6	1187423	1187428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622904
21477	NC_010334	AAT	2	6	1187446	1187451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622904
21478	NC_010334	GCT	2	6	1187490	1187495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622904
21479	NC_010334	ATG	2	6	1187518	1187523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21480	NC_010334	TTA	2	6	1187669	1187674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622904
21481	NC_010334	GC	3	6	1187708	1187713	0 %	0 %	50 %	50 %	167622904
21482	NC_010334	TTA	2	6	1187720	1187725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622904
21483	NC_010334	AGT	2	6	1187729	1187734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622904
21484	NC_010334	A	6	6	1187794	1187799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21485	NC_010334	T	6	6	1187828	1187833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21486	NC_010334	CTT	2	6	1187918	1187923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622905
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21490	NC_010334	C	7	7	1188114	1188120	0 %	0 %	0 %	100 %	167622905
21491	NC_010334	CA	4	8	1188150	1188157	50 %	0 %	0 %	50 %	167622905
21492	NC_010334	TA	3	6	1188185	1188190	50 %	50 %	0 %	0 %	167622905
21493	NC_010334	GAA	2	6	1188317	1188322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622905
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21496	NC_010334	AAG	2	6	1188398	1188403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622905
21497	NC_010334	TCA	2	6	1188407	1188412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622905
21498	NC_010334	TTA	2	6	1188423	1188428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21499	NC_010334	GTA	2	6	1188495	1188500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622906
21500	NC_010334	CAG	2	6	1188551	1188556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622906

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