MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_010334	GCA	2	6	1024683	1024688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622761
18503	NC_010334	TGT	2	6	1024695	1024700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622761
18504	NC_010334	CTG	2	6	1024768	1024773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622761
18505	NC_010334	TTG	2	6	1024777	1024782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622761
18506	NC_010334	AGC	2	6	1024796	1024801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622761
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18508	NC_010334	CGGCT	2	10	1024899	1024908	0 %	20 %	40 %	40 %	167622761
18509	NC_010334	TGA	2	6	1024929	1024934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622761
18510	NC_010334	GA	3	6	1025003	1025008	50 %	0 %	50 %	0 %	167622761
18511	NC_010334	GCAG	2	8	1025020	1025027	25 %	0 %	50 %	25 %	167622761
18512	NC_010334	AG	3	6	1025062	1025067	50 %	0 %	50 %	0 %	167622761
18513	NC_010334	AGC	2	6	1025083	1025088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622761
18514	NC_010334	TTA	2	6	1025096	1025101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622761
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18516	NC_010334	ATA	2	6	1025196	1025201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_010334	TAAT	2	8	1025212	1025219	50 %	50 %	0 %	0 %	167622762
18518	NC_010334	GCA	2	6	1025234	1025239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622762
18519	NC_010334	AAT	2	6	1025256	1025261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622762
18520	NC_010334	GC	3	6	1025426	1025431	0 %	0 %	50 %	50 %	167622762
18521	NC_010334	TA	3	6	1025469	1025474	50 %	50 %	0 %	0 %	167622762
18522	NC_010334	GATT	2	8	1025570	1025577	25 %	50 %	25 %	0 %	167622762
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18525	NC_010334	TTC	2	6	1025805	1025810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18528	NC_010334	TAA	2	6	1025884	1025889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18530	NC_010334	ATTAG	2	10	1025908	1025917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_010334	TGGTG	2	10	1025980	1025989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_010334	TGA	2	6	1026117	1026122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_010334	TTA	2	6	1026135	1026140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18536	NC_010334	CAT	2	6	1026498	1026503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622763
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18551	NC_010334	CATT	2	8	1027223	1027230	25 %	50 %	0 %	25 %	167622763
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18588	NC_010334	TGTC	2	8	1029203	1029210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18589	NC_010334	GAG	2	6	1029224	1029229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18599	NC_010334	GA	3	6	1029494	1029499	50 %	0 %	50 %	0 %	167622765
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18602	NC_010334	AAGCTT	2	12	1029720	1029731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18603	NC_010334	T	7	7	1029740	1029746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_010334	A	6	6	1029846	1029851	100 %	0 %	0 %	0 %	167622766
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18607	NC_010334	TGA	2	6	1030076	1030081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622766
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18610	NC_010334	TC	3	6	1030257	1030262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18614	NC_010334	GTTCT	2	10	1030545	1030554	0 %	60 %	20 %	20 %	167622767
18615	NC_010334	AAGC	2	8	1030735	1030742	50 %	0 %	25 %	25 %	167622767
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18618	NC_010334	TGC	2	6	1030791	1030796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622767
18619	NC_010334	TGA	2	6	1030940	1030945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622767
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18634	NC_010334	T	7	7	1031707	1031713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18635	NC_010334	ATGG	2	8	1031742	1031749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18638	NC_010334	TGAC	2	8	1031981	1031988	25 %	25 %	25 %	25 %	167622768
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18646	NC_010334	AT	3	6	1032259	1032264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18647	NC_010334	A	7	7	1032302	1032308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18977	NC_010334	ATG	2	6	1050431	1050436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622784
18978	NC_010334	CCAG	2	8	1050547	1050554	25 %	0 %	25 %	50 %	167622784
18979	NC_010334	GAA	2	6	1050637	1050642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622784
18980	NC_010334	CAT	2	6	1050669	1050674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622784
18981	NC_010334	ACCT	2	8	1050693	1050700	25 %	25 %	0 %	50 %	167622784
18982	NC_010334	GGT	2	6	1050743	1050748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622784
18983	NC_010334	CTG	2	6	1050828	1050833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622784
18984	NC_010334	GTA	2	6	1050866	1050871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622784
18985	NC_010334	CAAG	2	8	1050898	1050905	50 %	0 %	25 %	25 %	167622784
18986	NC_010334	GGC	2	6	1051004	1051009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622784
18987	NC_010334	GGC	2	6	1051049	1051054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622784
18988	NC_010334	CTG	2	6	1051058	1051063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622784
18989	NC_010334	TTC	2	6	1051261	1051266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622785
18990	NC_010334	ACC	2	6	1051365	1051370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785
18991	NC_010334	ATT	2	6	1051416	1051421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622785
18992	NC_010334	TGA	2	6	1051424	1051429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622785
18993	NC_010334	CTG	2	6	1051440	1051445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622785
18994	NC_010334	GATATC	2	12	1051485	1051496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622785
18995	NC_010334	TTA	2	6	1051573	1051578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622785
18996	NC_010334	CATC	2	8	1051581	1051588	25 %	25 %	0 %	50 %	167622785
18997	NC_010334	ATG	2	6	1051594	1051599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622785
18998	NC_010334	CCA	2	6	1051606	1051611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785
18999	NC_010334	TTA	2	6	1051635	1051640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622785
19000	NC_010334	CAC	2	6	1051676	1051681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622785

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