MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18006	NC_010334	GCA	2	6	995690	995695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622740
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18010	NC_010334	GCG	2	6	995925	995930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622740
18011	NC_010334	TGC	2	6	995934	995939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622740
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18017	NC_010334	GC	3	6	996395	996400	0 %	0 %	50 %	50 %	167622740
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18053	NC_010334	GTA	2	6	997874	997879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622742
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18061	NC_010334	TTGCT	2	10	998437	998446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18062	NC_010334	TA	3	6	998485	998490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18110	NC_010334	ATT	2	6	1001064	1001069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18111	NC_010334	TCT	2	6	1001129	1001134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622745
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18115	NC_010334	AATCC	2	10	1001361	1001370	40 %	20 %	0 %	40 %	167622745
18116	NC_010334	A	6	6	1001597	1001602	100 %	0 %	0 %	0 %	167622745
18117	NC_010334	TG	3	6	1001673	1001678	0 %	50 %	50 %	0 %	167622745
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18121	NC_010334	GCA	2	6	1001787	1001792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622745
18122	NC_010334	CTG	2	6	1001823	1001828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622745
18123	NC_010334	ATG	2	6	1001845	1001850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622745
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18355	NC_010334	TGA	2	6	1015001	1015006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622751
18356	NC_010334	CAAA	2	8	1015022	1015029	75 %	0 %	0 %	25 %	167622751
18357	NC_010334	ATG	2	6	1015077	1015082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622751
18358	NC_010334	A	6	6	1015188	1015193	100 %	0 %	0 %	0 %	167622751
18359	NC_010334	CCCAAG	2	12	1015333	1015344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	167622751
18360	NC_010334	CTT	2	6	1015349	1015354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622751
18361	NC_010334	GAC	2	6	1015440	1015445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622751
18362	NC_010334	GTT	2	6	1015470	1015475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18363	NC_010334	GCG	2	6	1015621	1015626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622752
18364	NC_010334	TCTT	2	8	1015631	1015638	0 %	75 %	0 %	25 %	167622752
18365	NC_010334	TTGG	2	8	1015681	1015688	0 %	50 %	50 %	0 %	167622752
18366	NC_010334	T	6	6	1015711	1015716	0 %	100 %	0 %	0 %	167622752
18367	NC_010334	TAC	2	6	1015883	1015888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622752
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18372	NC_010334	TTAA	2	8	1016149	1016156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18405	NC_010334	GC	3	6	1018563	1018568	0 %	0 %	50 %	50 %	167622756
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18407	NC_010334	A	6	6	1018616	1018621	100 %	0 %	0 %	0 %	167622756
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18472	NC_010334	CTGG	2	8	1022734	1022741	0 %	25 %	50 %	25 %	167622759
18473	NC_010334	TGCGC	2	10	1022762	1022771	0 %	20 %	40 %	40 %	167622759
18474	NC_010334	ATG	2	6	1022791	1022796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622759
18475	NC_010334	ATA	2	6	1022797	1022802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622759
18476	NC_010334	TGC	2	6	1022845	1022850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622759
18477	NC_010334	CGT	2	6	1022877	1022882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622759
18478	NC_010334	GA	3	6	1022921	1022926	50 %	0 %	50 %	0 %	167622759
18479	NC_010334	ATAAAA	2	12	1022952	1022963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18480	NC_010334	GCT	2	6	1023126	1023131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622760
18481	NC_010334	TGG	2	6	1023138	1023143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622760
18482	NC_010334	ATG	2	6	1023149	1023154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622760
18483	NC_010334	GTG	2	6	1023366	1023371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622760
18484	NC_010334	TGA	2	6	1023567	1023572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622760
18485	NC_010334	GAA	2	6	1023652	1023657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622760
18486	NC_010334	GCA	2	6	1023737	1023742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622760
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18492	NC_010334	ACTT	2	8	1024097	1024104	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18493	NC_010334	CAG	2	6	1024162	1024167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18494	NC_010334	CAT	2	6	1024218	1024223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622761
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18497	NC_010334	TCT	2	6	1024413	1024418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622761
18498	NC_010334	CCAA	2	8	1024442	1024449	50 %	0 %	0 %	50 %	167622761
18499	NC_010334	GCC	2	6	1024465	1024470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622761
18500	NC_010334	CTCA	2	8	1024528	1024535	25 %	25 %	0 %	50 %	167622761

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