MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_010334	GC	3	6	882397	882402	0 %	0 %	50 %	50 %	167622653
16002	NC_010334	GCC	2	6	882424	882429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622653
16003	NC_010334	TGT	2	6	882444	882449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622653
16004	NC_010334	AC	4	8	882600	882607	50 %	0 %	0 %	50 %	167622654
16005	NC_010334	GTG	2	6	882668	882673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622654
16006	NC_010334	AACA	2	8	882739	882746	75 %	0 %	0 %	25 %	167622654
16007	NC_010334	TTC	2	6	882777	882782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622654
16008	NC_010334	GTC	2	6	882815	882820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622654
16009	NC_010334	CA	3	6	882883	882888	50 %	0 %	0 %	50 %	167622654
16010	NC_010334	GA	3	6	883014	883019	50 %	0 %	50 %	0 %	167622654
16011	NC_010334	CCG	2	6	883090	883095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622654
16012	NC_010334	GGC	2	6	883156	883161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622654
16013	NC_010334	ACTT	2	8	883183	883190	25 %	50 %	0 %	25 %	167622654
16014	NC_010334	AAGTT	2	10	883244	883253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_010334	TCA	2	6	883276	883281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622655
16016	NC_010334	CTT	2	6	883295	883300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16017	NC_010334	GTCT	2	8	883304	883311	0 %	50 %	25 %	25 %	167622655
16018	NC_010334	TTG	2	6	883347	883352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622655
16019	NC_010334	GC	3	6	883361	883366	0 %	0 %	50 %	50 %	167622655
16020	NC_010334	GAA	2	6	883370	883375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622655
16021	NC_010334	GGC	2	6	883398	883403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16022	NC_010334	CTTCA	2	10	883433	883442	20 %	40 %	0 %	40 %	167622655
16023	NC_010334	TCT	2	6	883500	883505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16024	NC_010334	TTC	2	6	883622	883627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16025	NC_010334	CTG	2	6	883639	883644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16026	NC_010334	TTC	2	6	883856	883861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16027	NC_010334	TCG	2	6	883902	883907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16028	NC_010334	ACG	2	6	884126	884131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16029	NC_010334	CTT	2	6	884152	884157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16030	NC_010334	GCC	2	6	884193	884198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622655
16031	NC_010334	CTA	2	6	884449	884454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622655
16032	NC_010334	CAG	2	6	884461	884466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16033	NC_010334	TGT	2	6	884581	884586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622655
16034	NC_010334	TGT	2	6	884593	884598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622655
16035	NC_010334	TCA	2	6	884647	884652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622655
16036	NC_010334	TCG	2	6	884766	884771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16037	NC_010334	T	6	6	884813	884818	0 %	100 %	0 %	0 %	167622655
16038	NC_010334	GAT	2	6	884827	884832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622655
16039	NC_010334	GTA	2	6	884859	884864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622655
16040	NC_010334	ATG	2	6	884922	884927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622655
16041	NC_010334	CGGA	2	8	884966	884973	25 %	0 %	50 %	25 %	167622655
16042	NC_010334	ATA	2	6	885022	885027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622655
16043	NC_010334	GCT	2	6	885047	885052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16044	NC_010334	GGC	2	6	885055	885060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16045	NC_010334	CGG	2	6	885130	885135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16046	NC_010334	AAC	2	6	885151	885156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622655
16047	NC_010334	GGC	2	6	885272	885277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16048	NC_010334	CTT	2	6	885412	885417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622655
16049	NC_010334	GCG	2	6	885448	885453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16050	NC_010334	TGG	2	6	885547	885552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622655
16051	NC_010334	TGC	3	9	885695	885703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622655
16052	NC_010334	CGG	2	6	885706	885711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622655
16053	NC_010334	TCT	2	6	885766	885771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622656
16054	NC_010334	TGA	2	6	885784	885789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622656
16055	NC_010334	GCG	2	6	886201	886206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_010334	TGT	2	6	886207	886212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_010334	ATT	2	6	886279	886284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_010334	AT	3	6	886335	886340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_010334	TTA	2	6	886360	886365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_010334	TCT	2	6	886504	886509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622657
16061	NC_010334	TGC	2	6	886558	886563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16062	NC_010334	CTG	2	6	886587	886592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16063	NC_010334	TGT	2	6	886601	886606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622657
16064	NC_010334	TGT	2	6	886648	886653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622657
16065	NC_010334	TAT	2	6	886664	886669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622657
16066	NC_010334	CAT	2	6	886700	886705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622657
16067	NC_010334	CTG	2	6	886734	886739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16068	NC_010334	CT	3	6	886767	886772	0 %	50 %	0 %	50 %	167622657
16069	NC_010334	AGCC	2	8	886777	886784	25 %	0 %	25 %	50 %	167622657
16070	NC_010334	CAT	2	6	886797	886802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622657
16071	NC_010334	GTA	3	9	886854	886862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622657
16072	NC_010334	TCG	2	6	886960	886965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16073	NC_010334	TCA	2	6	886996	887001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622657
16074	NC_010334	TGC	2	6	887003	887008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16075	NC_010334	TTG	2	6	887028	887033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622657
16076	NC_010334	TTGC	2	8	887109	887116	0 %	50 %	25 %	25 %	167622657
16077	NC_010334	AT	3	6	887137	887142	50 %	50 %	0 %	0 %	167622657
16078	NC_010334	GCT	2	6	887144	887149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16079	NC_010334	GCCATT	2	12	887172	887183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622657
16080	NC_010334	GCGG	2	8	887197	887204	0 %	0 %	75 %	25 %	167622657
16081	NC_010334	ACC	2	6	887282	887287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622657
16082	NC_010334	TCA	2	6	887302	887307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622657
16083	NC_010334	GCT	2	6	887336	887341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622657
16084	NC_010334	TAG	2	6	887445	887450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622657
16085	NC_010334	CCT	2	6	887479	887484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622658
16086	NC_010334	CAG	2	6	887522	887527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16087	NC_010334	CAG	2	6	887648	887653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16088	NC_010334	GCAA	2	8	887682	887689	50 %	0 %	25 %	25 %	167622658
16089	NC_010334	ACTC	2	8	887750	887757	25 %	25 %	0 %	50 %	167622658
16090	NC_010334	G	6	6	887779	887784	0 %	0 %	100 %	0 %	167622658
16091	NC_010334	GGC	2	6	887831	887836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622658
16092	NC_010334	GACAGC	2	12	887943	887954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16093	NC_010334	CGG	2	6	888001	888006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622658
16094	NC_010334	TGC	2	6	888010	888015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16095	NC_010334	A	6	6	888094	888099	100 %	0 %	0 %	0 %	167622658
16096	NC_010334	AGG	2	6	888116	888121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622658
16097	NC_010334	ATC	2	6	888201	888206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622658
16098	NC_010334	GT	3	6	888330	888335	0 %	50 %	50 %	0 %	167622658
16099	NC_010334	ATAG	2	8	888347	888354	50 %	25 %	25 %	0 %	167622658
16100	NC_010334	CAT	2	6	888530	888535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622658
16101	NC_010334	GA	3	6	888539	888544	50 %	0 %	50 %	0 %	167622658
16102	NC_010334	AGT	3	9	888648	888656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622658
16103	NC_010334	TTG	2	6	888695	888700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622658
16104	NC_010334	TAT	2	6	888746	888751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622658
16105	NC_010334	TCT	2	6	888779	888784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622658
16106	NC_010334	CAA	2	6	888877	888882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622658
16107	NC_010334	GCT	2	6	888952	888957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16108	NC_010334	ATC	2	6	888972	888977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622658
16109	NC_010334	CAA	2	6	889070	889075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622658
16110	NC_010334	AATA	2	8	889160	889167	75 %	25 %	0 %	0 %	167622658
16111	NC_010334	CGC	2	6	889243	889248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622658
16112	NC_010334	ATC	2	6	889424	889429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622658
16113	NC_010334	CGC	2	6	889493	889498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622658
16114	NC_010334	GAT	2	6	889517	889522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622658
16115	NC_010334	CTG	2	6	889580	889585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622658
16116	NC_010334	GGC	2	6	889625	889630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622658
16117	NC_010334	TCGC	2	8	889638	889645	0 %	25 %	25 %	50 %	167622658
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16119	NC_010334	TGG	2	6	889846	889851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622658
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16487	NC_010334	TA	3	6	910214	910219	50 %	50 %	0 %	0 %	167622672
16488	NC_010334	CGG	2	6	910245	910250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622672
16489	NC_010334	CA	3	6	910279	910284	50 %	0 %	0 %	50 %	167622672
16490	NC_010334	ACT	2	6	910289	910294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622672
16491	NC_010334	CTT	2	6	910374	910379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622672
16492	NC_010334	ACCGC	2	10	910454	910463	20 %	0 %	20 %	60 %	167622672
16493	NC_010334	ATC	2	6	910534	910539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622672
16494	NC_010334	GAT	2	6	910629	910634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622672
16495	NC_010334	TGA	2	6	910662	910667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622672
16496	NC_010334	AGC	2	6	910724	910729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622672
16497	NC_010334	CTA	3	9	910798	910806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622672
16498	NC_010334	ATG	2	6	910828	910833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622672
16499	NC_010334	CAA	2	6	911091	911096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622672
16500	NC_010334	AAG	2	6	911138	911143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622672

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