MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010334	G	6	6	711407	711412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_010334	GGC	2	6	711471	711476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_010334	GAA	2	6	711714	711719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_010334	TGC	2	6	711790	711795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_010334	GTC	2	6	711802	711807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_010334	CCTTAT	2	12	711854	711865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_010334	TGG	2	6	711880	711885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_010334	GGA	2	6	711916	711921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_010334	GAC	2	6	711929	711934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_010334	TCA	2	6	711941	711946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_010334	AC	3	6	711967	711972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_010334	AC	3	6	712136	712141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_010334	CCT	2	6	712277	712282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_010334	GTT	2	6	712305	712310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_010334	CA	3	6	712318	712323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_010334	TTGT	2	8	712330	712337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_010334	GCGA	2	8	712348	712355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13018	NC_010334	TAA	2	6	712414	712419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_010334	ATT	2	6	712428	712433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_010334	A	6	6	712442	712447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_010334	TTG	2	6	712484	712489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_010334	A	6	6	712506	712511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_010334	AAC	2	6	712575	712580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_010334	TGG	2	6	712635	712640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_010334	GTA	2	6	712671	712676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_010334	GGA	2	6	712822	712827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_010334	TAG	2	6	712851	712856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_010334	GCGA	2	8	712859	712866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_010334	AACT	2	8	712952	712959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13030	NC_010334	G	6	6	713008	713013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_010334	TCC	2	6	713018	713023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_010334	CTGA	2	8	713038	713045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_010334	GGA	2	6	713328	713333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_010334	AC	3	6	713338	713343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_010334	TGA	2	6	713362	713367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_010334	AC	3	6	713545	713550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13037	NC_010334	CGTC	2	8	713563	713570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13038	NC_010334	AAC	2	6	713582	713587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_010334	AGC	2	6	713672	713677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_010334	CAT	2	6	713678	713683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_010334	AAAG	2	8	713686	713693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_010334	AGTCG	2	10	713708	713717	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13043	NC_010334	TGAAGG	2	12	713812	713823	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_010334	CCT	2	6	713891	713896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_010334	GA	3	6	714024	714029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_010334	AGGCT	2	10	714036	714045	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13047	NC_010334	GCG	2	6	714049	714054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_010334	TGA	2	6	714124	714129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_010334	AGT	2	6	714149	714154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_010334	TCT	2	6	714177	714182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_010334	TAG	2	6	714194	714199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_010334	GGT	2	6	714223	714228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_010334	GA	3	6	714253	714258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_010334	GTG	2	6	714318	714323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_010334	ATTG	2	8	714456	714463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_010334	CGG	2	6	714504	714509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_010334	ATG	2	6	714580	714585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_010334	TCG	2	6	714741	714746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_010334	TGGAG	2	10	714752	714761	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_010334	ACC	2	6	714775	714780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13061	NC_010334	TGG	2	6	714836	714841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_010334	TCC	2	6	714862	714867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_010334	GGA	2	6	714879	714884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_010334	GGT	2	6	714999	715004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_010334	CGG	2	6	715086	715091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_010334	TCA	2	6	715114	715119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_010334	CGT	2	6	715194	715199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_010334	GAT	2	6	715234	715239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_010334	GAAG	2	8	715241	715248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_010334	GTT	2	6	715297	715302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_010334	GT	3	6	715447	715452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_010334	AGAATT	2	12	715555	715566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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13074	NC_010334	T	6	6	715845	715850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_010334	GGT	2	6	715909	715914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_010334	ACGT	2	8	715928	715935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13081	NC_010334	TCAAT	2	10	716289	716298	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13082	NC_010334	GAC	2	6	716306	716311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13090	NC_010334	GACT	2	8	716994	717001	25 %	25 %	25 %	25 %	167622531
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13098	NC_010334	CATG	2	8	717670	717677	25 %	25 %	25 %	25 %	167622531
13099	NC_010334	AATT	2	8	717788	717795	50 %	50 %	0 %	0 %	167622531
13100	NC_010334	AAG	2	6	717818	717823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_010334	CTT	2	6	717844	717849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_010334	ATT	2	6	717862	717867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_010334	GTTTTG	2	12	717988	717999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_010334	GC	3	6	718012	718017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13105	NC_010334	A	7	7	718037	718043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_010334	GAT	2	6	718052	718057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_010334	G	7	7	718061	718067	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_010334	ATT	3	9	718095	718103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_010334	CTGA	2	8	718106	718113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13110	NC_010334	AAAT	2	8	718182	718189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_010334	ACG	2	6	718223	718228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_010334	TCA	2	6	718245	718250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_010334	TGA	2	6	718283	718288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_010334	ATT	2	6	718292	718297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_010334	TAA	2	6	718308	718313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_010334	CTAG	2	8	718398	718405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13117	NC_010334	TAT	2	6	718466	718471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622532
13118	NC_010334	TTGG	2	8	718516	718523	0 %	50 %	50 %	0 %	167622532
13119	NC_010334	AGC	2	6	718543	718548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622532
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13121	NC_010334	GCA	2	6	718624	718629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622532
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13128	NC_010334	TGA	2	6	718896	718901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622532
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13130	NC_010334	AGA	3	9	718924	718932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622532
13131	NC_010334	TTA	2	6	718982	718987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622532
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13143	NC_010334	CT	3	6	719560	719565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13253	NC_010334	A	7	7	724810	724816	100 %	0 %	0 %	0 %	167622542
13254	NC_010334	AC	3	6	724821	724826	50 %	0 %	0 %	50 %	167622542
13255	NC_010334	ATG	2	6	724828	724833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622542
13256	NC_010334	CTT	2	6	724902	724907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622542
13257	NC_010334	CTAC	2	8	724933	724940	25 %	25 %	0 %	50 %	167622542
13258	NC_010334	GGT	2	6	724983	724988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622542
13259	NC_010334	GCA	2	6	725023	725028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622542
13260	NC_010334	ATG	2	6	725042	725047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622542
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13262	NC_010334	CATGAT	2	12	725095	725106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167622542
13263	NC_010334	ACGGTC	2	12	725132	725143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167622542
13264	NC_010334	ATG	2	6	725144	725149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622542
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13266	NC_010334	GAT	2	6	725164	725169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622542
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13269	NC_010334	TAGA	2	8	725318	725325	50 %	25 %	25 %	0 %	167622542
13270	NC_010334	TAC	2	6	725414	725419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622542
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13272	NC_010334	CGT	2	6	725527	725532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622542
13273	NC_010334	CAG	2	6	725708	725713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622542
13274	NC_010334	TACC	2	8	725956	725963	25 %	25 %	0 %	50 %	167622542
13275	NC_010334	AGC	2	6	726013	726018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622542
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13277	NC_010334	GCT	2	6	726211	726216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13278	NC_010334	ATT	2	6	726289	726294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622543
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13280	NC_010334	AGA	2	6	726393	726398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622543
13281	NC_010334	CG	3	6	726534	726539	0 %	0 %	50 %	50 %	167622543
13282	NC_010334	CAG	2	6	726541	726546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622543
13283	NC_010334	AT	3	6	726645	726650	50 %	50 %	0 %	0 %	167622543
13284	NC_010334	ATG	2	6	726727	726732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622543
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13288	NC_010334	TAA	2	6	726861	726866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622543
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13291	NC_010334	TGA	2	6	727077	727082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622543
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13342	NC_010334	ATGG	2	8	729495	729502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13343	NC_010334	T	6	6	729560	729565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13344	NC_010334	AGTTT	2	10	729618	729627	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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13347	NC_010334	CT	3	6	729754	729759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13348	NC_010334	TC	4	8	729761	729768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13365	NC_010334	AGT	2	6	730737	730742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622544
13366	NC_010334	GTT	3	9	730754	730762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_010334	ATC	2	6	731007	731012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622545
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13373	NC_010334	CAC	2	6	731172	731177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622545
13374	NC_010334	CTG	2	6	731196	731201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622545
13375	NC_010334	CAA	2	6	731390	731395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622545
13376	NC_010334	ATG	2	6	731398	731403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622545
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13378	NC_010334	AAT	2	6	731649	731654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13379	NC_010334	GATT	2	8	731686	731693	25 %	50 %	25 %	0 %	167622546
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13392	NC_010334	TAAG	2	8	732775	732782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13393	NC_010334	GCTG	2	8	732802	732809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13394	NC_010334	GCT	2	6	732821	732826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13395	NC_010334	CCTA	2	8	732864	732871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13396	NC_010334	GAG	2	6	732879	732884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13481	NC_010334	AG	3	6	738122	738127	50 %	0 %	50 %	0 %	167622551
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13491	NC_010334	ACAG	2	8	738747	738754	50 %	0 %	25 %	25 %	167622551
13492	NC_010334	CTA	2	6	738810	738815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622551
13493	NC_010334	GCT	3	9	738863	738871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622551
13494	NC_010334	TGGG	2	8	738895	738902	0 %	25 %	75 %	0 %	167622551
13495	NC_010334	GGC	2	6	738930	738935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622551
13496	NC_010334	A	6	6	738997	739002	100 %	0 %	0 %	0 %	167622551
13497	NC_010334	ATT	2	6	739009	739014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622552
13498	NC_010334	GAT	2	6	739018	739023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622552
13499	NC_010334	ATG	2	6	739088	739093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622552
13500	NC_010334	CTG	2	6	739105	739110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622552

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