MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010334	TGTTT	2	10	682871	682880	0 %	80 %	20 %	0 %	167622507
12502	NC_010334	GCT	2	6	682903	682908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622507
12503	NC_010334	GAACA	2	10	682973	682982	60 %	0 %	20 %	20 %	167622507
12504	NC_010334	ATT	2	6	683031	683036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622507
12505	NC_010334	GTG	2	6	683117	683122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622507
12506	NC_010334	ATCT	2	8	683208	683215	25 %	50 %	0 %	25 %	167622507
12507	NC_010334	AAC	2	6	683227	683232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622507
12508	NC_010334	A	6	6	683354	683359	100 %	0 %	0 %	0 %	167622507
12509	NC_010334	ACA	2	6	683366	683371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622507
12510	NC_010334	CTAT	2	8	683414	683421	25 %	50 %	0 %	25 %	167622507
12511	NC_010334	TC	3	6	683549	683554	0 %	50 %	0 %	50 %	167622507
12512	NC_010334	TCA	2	6	683655	683660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622507
12513	NC_010334	GAA	2	6	683770	683775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622507
12514	NC_010334	GAA	2	6	683799	683804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622507
12515	NC_010334	GGT	2	6	683860	683865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622507
12516	NC_010334	TGG	2	6	683874	683879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622507
12517	NC_010334	GGC	2	6	683884	683889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622507
12518	NC_010334	CAT	2	6	684011	684016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622507
12519	NC_010334	TAC	2	6	684075	684080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622507
12520	NC_010334	TGAC	2	8	684101	684108	25 %	25 %	25 %	25 %	167622507
12521	NC_010334	TAC	2	6	684129	684134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622507
12522	NC_010334	AAGA	2	8	684145	684152	75 %	0 %	25 %	0 %	167622507
12523	NC_010334	TGG	2	6	684384	684389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622507
12524	NC_010334	GAA	2	6	684427	684432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622507
12525	NC_010334	AAGAC	2	10	684683	684692	60 %	0 %	20 %	20 %	167622507
12526	NC_010334	AAGA	2	8	684742	684749	75 %	0 %	25 %	0 %	167622507
12527	NC_010334	TGC	2	6	684798	684803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622507
12528	NC_010334	TAAG	2	8	684858	684865	50 %	25 %	25 %	0 %	167622507
12529	NC_010334	GCAT	2	8	684887	684894	25 %	25 %	25 %	25 %	167622508
12530	NC_010334	AG	3	6	684921	684926	50 %	0 %	50 %	0 %	167622508
12531	NC_010334	A	6	6	684937	684942	100 %	0 %	0 %	0 %	167622508
12532	NC_010334	GGT	2	6	685003	685008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622508
12533	NC_010334	ATG	2	6	685063	685068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622508
12534	NC_010334	TATT	2	8	685158	685165	25 %	75 %	0 %	0 %	167622508
12535	NC_010334	A	6	6	685183	685188	100 %	0 %	0 %	0 %	167622508
12536	NC_010334	CTGC	2	8	685192	685199	0 %	25 %	25 %	50 %	167622508
12537	NC_010334	TAA	2	6	685200	685205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622508
12538	NC_010334	GCA	2	6	685261	685266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622508
12539	NC_010334	CAT	2	6	685267	685272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622508
12540	NC_010334	ATGG	2	8	685322	685329	25 %	25 %	50 %	0 %	167622508
12541	NC_010334	CT	3	6	685333	685338	0 %	50 %	0 %	50 %	167622508
12542	NC_010334	TTTA	2	8	685400	685407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_010334	GAT	2	6	685412	685417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622509
12544	NC_010334	A	6	6	685425	685430	100 %	0 %	0 %	0 %	167622509
12545	NC_010334	ACC	2	6	685440	685445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622509
12546	NC_010334	TGT	2	6	685451	685456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622509
12547	NC_010334	A	6	6	685794	685799	100 %	0 %	0 %	0 %	167622509
12548	NC_010334	GAAGGT	2	12	685848	685859	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	167622509
12549	NC_010334	TGA	2	6	685969	685974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622509
12550	NC_010334	AAG	2	6	685993	685998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622509
12551	NC_010334	AATG	2	8	686009	686016	50 %	25 %	25 %	0 %	167622509
12552	NC_010334	CAG	2	6	686044	686049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622509
12553	NC_010334	CATGG	2	10	686151	686160	20 %	20 %	40 %	20 %	167622509
12554	NC_010334	GGCATG	2	12	686169	686180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	167622509
12555	NC_010334	GGC	2	6	686181	686186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622509
12556	NC_010334	ATG	2	6	686187	686192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622509
12557	NC_010334	GGC	2	6	686193	686198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622509
12558	NC_010334	GTTT	2	8	686295	686302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_010334	AG	3	6	686314	686319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_010334	TCA	3	9	686387	686395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622510
12561	NC_010334	AAAG	2	8	686615	686622	75 %	0 %	25 %	0 %	167622510
12562	NC_010334	ATT	2	6	686651	686656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622510
12563	NC_010334	GGC	2	6	686682	686687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622510
12564	NC_010334	ACT	2	6	686720	686725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622510
12565	NC_010334	TGA	2	6	686738	686743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622510
12566	NC_010334	CGA	2	6	686843	686848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622510
12567	NC_010334	TAA	2	6	686975	686980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622510
12568	NC_010334	A	6	6	687001	687006	100 %	0 %	0 %	0 %	167622510
12569	NC_010334	TAA	2	6	687052	687057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_010334	AT	3	6	687064	687069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_010334	GGA	2	6	687090	687095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_010334	AG	3	6	687114	687119	50 %	0 %	50 %	0 %	167622511
12573	NC_010334	ATA	2	6	687157	687162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622511
12574	NC_010334	GCG	2	6	687257	687262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622511
12575	NC_010334	AGG	2	6	687269	687274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622511
12576	NC_010334	CAA	2	6	687288	687293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622511
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12578	NC_010334	CGTGT	2	10	687411	687420	0 %	40 %	40 %	20 %	167622511
12579	NC_010334	GGCGC	2	10	687463	687472	0 %	0 %	60 %	40 %	167622511
12580	NC_010334	TGA	2	6	687477	687482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622511
12581	NC_010334	TAA	2	6	687570	687575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622511
12582	NC_010334	CCTG	2	8	687640	687647	0 %	25 %	25 %	50 %	167622511
12583	NC_010334	TG	3	6	687646	687651	0 %	50 %	50 %	0 %	167622511
12584	NC_010334	ATG	2	6	687665	687670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622511
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12586	NC_010334	GCA	2	6	687981	687986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622512
12587	NC_010334	TGT	2	6	688018	688023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622512
12588	NC_010334	TTC	2	6	688053	688058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622512
12589	NC_010334	GAA	2	6	688164	688169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622512
12590	NC_010334	TCG	2	6	688232	688237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622512
12591	NC_010334	CTGT	2	8	688273	688280	0 %	50 %	25 %	25 %	167622512
12592	NC_010334	ATC	2	6	688323	688328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622512
12593	NC_010334	TAC	2	6	688339	688344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622512
12594	NC_010334	TGC	2	6	688379	688384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622512
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12597	NC_010334	TGG	2	6	688613	688618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622512
12598	NC_010334	TCTA	2	8	688675	688682	25 %	50 %	0 %	25 %	167622512
12599	NC_010334	ATG	2	6	688707	688712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622512
12600	NC_010334	GGTA	2	8	688817	688824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_010334	A	6	6	688936	688941	100 %	0 %	0 %	0 %	167622513
12602	NC_010334	ATG	2	6	689059	689064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622513
12603	NC_010334	GAA	2	6	689103	689108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622513
12604	NC_010334	TTG	2	6	689249	689254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622513
12605	NC_010334	CTG	2	6	689309	689314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622513
12606	NC_010334	AAG	2	6	689333	689338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622513
12607	NC_010334	TGG	2	6	689364	689369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622513
12608	NC_010334	ACT	2	6	689403	689408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622513
12609	NC_010334	TGA	2	6	689448	689453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_010334	GGT	2	6	689462	689467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_010334	GTT	2	6	689497	689502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622514
12612	NC_010334	TAA	2	6	689568	689573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622514
12613	NC_010334	ATT	2	6	689650	689655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622514
12614	NC_010334	TCA	2	6	689691	689696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622514
12615	NC_010334	ATT	2	6	689701	689706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622514
12616	NC_010334	CAT	2	6	689727	689732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622514
12617	NC_010334	ATA	2	6	689879	689884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622514
12618	NC_010334	CT	3	6	689886	689891	0 %	50 %	0 %	50 %	167622514
12619	NC_010334	AGC	2	6	689968	689973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622514
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12621	NC_010334	AGTAAA	2	12	690085	690096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	167622514
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12989	NC_010334	GGC	2	6	710779	710784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12990	NC_010334	GCG	2	6	710843	710848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12991	NC_010334	AGG	2	6	710938	710943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12992	NC_010334	TGG	2	6	710994	710999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12993	NC_010334	CGA	2	6	711018	711023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12994	NC_010334	GAT	2	6	711043	711048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12995	NC_010334	GCA	2	6	711092	711097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12997	NC_010334	GAA	2	6	711151	711156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12999	NC_010334	AGA	2	6	711234	711239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13000	NC_010334	CAG	2	6	711260	711265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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