MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_010334	ATCTT	2	10	630612	630621	20 %	60 %	0 %	20 %	167622462
11503	NC_010334	ATCAA	2	10	630783	630792	60 %	20 %	0 %	20 %	167622462
11504	NC_010334	TAA	3	9	630863	630871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622462
11505	NC_010334	CTCA	2	8	630899	630906	25 %	25 %	0 %	50 %	167622462
11506	NC_010334	TTTC	2	8	630955	630962	0 %	75 %	0 %	25 %	167622462
11507	NC_010334	AGC	2	6	630983	630988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622462
11508	NC_010334	CGG	2	6	630999	631004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622462
11509	NC_010334	TAT	2	6	631066	631071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622462
11510	NC_010334	TG	3	6	631128	631133	0 %	50 %	50 %	0 %	167622462
11511	NC_010334	TTC	2	6	631148	631153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622462
11512	NC_010334	T	6	6	631163	631168	0 %	100 %	0 %	0 %	167622462
11513	NC_010334	A	6	6	631206	631211	100 %	0 %	0 %	0 %	167622462
11514	NC_010334	GC	3	6	631250	631255	0 %	0 %	50 %	50 %	167622462
11515	NC_010334	T	6	6	631402	631407	0 %	100 %	0 %	0 %	167622462
11516	NC_010334	TGT	2	6	631430	631435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622462
11517	NC_010334	TAATA	2	10	631535	631544	60 %	40 %	0 %	0 %	167622462
11518	NC_010334	CACC	2	8	631549	631556	25 %	0 %	0 %	75 %	167622462
11519	NC_010334	GCA	2	6	631569	631574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622462
11520	NC_010334	GTT	2	6	631612	631617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622462
11521	NC_010334	GTT	2	6	631646	631651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622462
11522	NC_010334	ATT	2	6	631655	631660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622462
11523	NC_010334	TGA	2	6	631681	631686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622462
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11526	NC_010334	AGT	2	6	631913	631918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622462
11527	NC_010334	TCA	2	6	631947	631952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622462
11528	NC_010334	GAA	2	6	631966	631971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622462
11529	NC_010334	T	6	6	631972	631977	0 %	100 %	0 %	0 %	167622462
11530	NC_010334	CCA	2	6	632040	632045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622462
11531	NC_010334	AT	3	6	632120	632125	50 %	50 %	0 %	0 %	167622462
11532	NC_010334	TCCG	2	8	632174	632181	0 %	25 %	25 %	50 %	167622462
11533	NC_010334	T	6	6	632219	632224	0 %	100 %	0 %	0 %	167622462
11534	NC_010334	ATT	2	6	632232	632237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622462
11535	NC_010334	TGT	2	6	632255	632260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622463
11536	NC_010334	GC	3	6	632272	632277	0 %	0 %	50 %	50 %	167622463
11537	NC_010334	T	7	7	632292	632298	0 %	100 %	0 %	0 %	167622463
11538	NC_010334	CT	3	6	632346	632351	0 %	50 %	0 %	50 %	167622463
11539	NC_010334	ATG	2	6	632552	632557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622463
11540	NC_010334	GTA	2	6	632577	632582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622463
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11542	NC_010334	TCA	2	6	632677	632682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622463
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11547	NC_010334	GC	3	6	632790	632795	0 %	0 %	50 %	50 %	167622464
11548	NC_010334	ATCA	2	8	632830	632837	50 %	25 %	0 %	25 %	167622464
11549	NC_010334	CA	3	6	632836	632841	50 %	0 %	0 %	50 %	167622464
11550	NC_010334	GGT	2	6	632975	632980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622464
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11554	NC_010334	CGA	2	6	633071	633076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622464
11555	NC_010334	TA	3	6	633099	633104	50 %	50 %	0 %	0 %	167622464
11556	NC_010334	T	6	6	633128	633133	0 %	100 %	0 %	0 %	167622464
11557	NC_010334	TTA	2	6	633306	633311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622464
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11559	NC_010334	ATC	2	6	633428	633433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622464
11560	NC_010334	TGC	2	6	633503	633508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622464
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11564	NC_010334	CAT	2	6	633672	633677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622464
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11569	NC_010334	ATC	2	6	633910	633915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622464
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11581	NC_010334	GCCA	2	8	634658	634665	25 %	0 %	25 %	50 %	167622465
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11589	NC_010334	GTC	2	6	634895	634900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622465
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11592	NC_010334	GTC	2	6	635010	635015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622465
11593	NC_010334	CCA	2	6	635022	635027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622465
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11595	NC_010334	TAT	2	6	635178	635183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_010334	CAC	2	6	635254	635259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_010334	AAC	2	6	635326	635331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_010334	TCA	2	6	635568	635573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622466
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11601	NC_010334	CTGC	2	8	635674	635681	0 %	25 %	25 %	50 %	167622466
11602	NC_010334	TTCT	2	8	635706	635713	0 %	75 %	0 %	25 %	167622466
11603	NC_010334	GTT	2	6	635728	635733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622466
11604	NC_010334	C	6	6	635743	635748	0 %	0 %	0 %	100 %	167622466
11605	NC_010334	GCTTCT	2	12	635754	635765	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	167622466
11606	NC_010334	TGC	2	6	635855	635860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622466
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11608	NC_010334	TA	3	6	635944	635949	50 %	50 %	0 %	0 %	167622466
11609	NC_010334	T	6	6	636012	636017	0 %	100 %	0 %	0 %	167622466
11610	NC_010334	TAAT	2	8	636076	636083	50 %	50 %	0 %	0 %	167622466
11611	NC_010334	TAA	2	6	636085	636090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622466
11612	NC_010334	TGC	2	6	636146	636151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_010334	AGC	2	6	636154	636159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_010334	GGC	2	6	636166	636171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_010334	TATGT	2	10	636181	636190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_010334	TCT	2	6	636225	636230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622467
11617	NC_010334	AAT	2	6	636287	636292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622467
11618	NC_010334	AATTTA	2	12	636294	636305	50 %	50 %	0 %	0 %	167622467
11619	NC_010334	CA	3	6	636329	636334	50 %	0 %	0 %	50 %	167622467
11620	NC_010334	TAA	2	6	636340	636345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622467
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11622	NC_010334	GAAT	2	8	636444	636451	50 %	25 %	25 %	0 %	167622467
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11990	NC_010334	ATCT	2	8	656464	656471	25 %	50 %	0 %	25 %	167622485
11991	NC_010334	AGCGA	2	10	656477	656486	40 %	0 %	40 %	20 %	167622485
11992	NC_010334	TGAG	2	8	656501	656508	25 %	25 %	50 %	0 %	167622485
11993	NC_010334	CCA	2	6	656524	656529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622485
11994	NC_010334	AG	3	6	656531	656536	50 %	0 %	50 %	0 %	167622485
11995	NC_010334	GCT	2	6	656571	656576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622485
11996	NC_010334	GTT	2	6	656631	656636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622485
11997	NC_010334	GAT	2	6	656671	656676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622485
11998	NC_010334	CCG	2	6	656711	656716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622485
11999	NC_010334	T	6	6	656722	656727	0 %	100 %	0 %	0 %	167622485
12000	NC_010334	CGA	2	6	656805	656810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622485

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