MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010334	GTTA	2	8	605971	605978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_010334	TGT	2	6	605991	605996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_010334	TTAA	2	8	606109	606116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_010334	TTG	3	9	606138	606146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_010334	TAT	2	6	606159	606164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_010334	ATTA	2	8	606228	606235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_010334	TAT	2	6	606254	606259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_010334	TGTT	3	12	606263	606274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_010334	TAAA	2	8	606292	606299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_010334	TTG	2	6	606304	606309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_010334	TAC	2	6	606336	606341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_010334	TAA	2	6	606342	606347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_010334	TAA	2	6	606379	606384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010334	TGA	3	9	606396	606404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622443
11015	NC_010334	TAA	2	6	606412	606417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622443
11016	NC_010334	AGC	2	6	606457	606462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11017	NC_010334	TGA	3	9	606487	606495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622443
11018	NC_010334	CGT	2	6	606520	606525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11019	NC_010334	AGA	2	6	606571	606576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622443
11020	NC_010334	GTG	2	6	606581	606586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11021	NC_010334	GAG	2	6	606611	606616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622443
11022	NC_010334	GCT	2	6	606619	606624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11023	NC_010334	CGCA	2	8	606682	606689	25 %	0 %	25 %	50 %	167622443
11024	NC_010334	TGG	2	6	606718	606723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11025	NC_010334	GAG	2	6	606734	606739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622443
11026	NC_010334	CAG	2	6	606801	606806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11027	NC_010334	AC	3	6	606904	606909	50 %	0 %	0 %	50 %	167622443
11028	NC_010334	GCG	2	6	606950	606955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622443
11029	NC_010334	A	6	6	607069	607074	100 %	0 %	0 %	0 %	167622443
11030	NC_010334	AGA	2	6	607083	607088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622443
11031	NC_010334	ATCA	2	8	607097	607104	50 %	25 %	0 %	25 %	167622443
11032	NC_010334	ATG	2	6	607203	607208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622443
11033	NC_010334	CGA	2	6	607255	607260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11034	NC_010334	GCA	2	6	607318	607323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11035	NC_010334	ACG	2	6	607328	607333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11036	NC_010334	AAC	2	6	607381	607386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622443
11037	NC_010334	GCA	2	6	607466	607471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11038	NC_010334	GTCG	2	8	607526	607533	0 %	25 %	50 %	25 %	167622443
11039	NC_010334	TGG	2	6	607552	607557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11040	NC_010334	GCG	2	6	607601	607606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622443
11041	NC_010334	AGC	2	6	607683	607688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622443
11042	NC_010334	GGC	2	6	607700	607705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622443
11043	NC_010334	ATG	2	6	607707	607712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622443
11044	NC_010334	GTT	2	6	607739	607744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622443
11045	NC_010334	AAC	2	6	607820	607825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622443
11046	NC_010334	ACTA	2	8	607829	607836	50 %	25 %	0 %	25 %	167622443
11047	NC_010334	TGG	2	6	607861	607866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11048	NC_010334	TG	3	6	607874	607879	0 %	50 %	50 %	0 %	167622443
11049	NC_010334	TGCA	2	8	608049	608056	25 %	25 %	25 %	25 %	167622443
11050	NC_010334	TGG	2	6	608227	608232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11051	NC_010334	ATA	2	6	608292	608297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622443
11052	NC_010334	GGT	2	6	608330	608335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622443
11053	NC_010334	CTG	2	6	608550	608555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_010334	T	6	6	608582	608587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_010334	ATT	3	9	608597	608605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622444
11056	NC_010334	TTA	2	6	608658	608663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622444
11057	NC_010334	AAT	2	6	608664	608669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622444
11058	NC_010334	AC	3	6	608692	608697	50 %	0 %	0 %	50 %	167622444
11059	NC_010334	GCA	2	6	608829	608834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622444
11060	NC_010334	TGC	2	6	608852	608857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622444
11061	NC_010334	TTG	2	6	608877	608882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622444
11062	NC_010334	ATC	2	6	609089	609094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622444
11063	NC_010334	CTG	2	6	609278	609283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622444
11064	NC_010334	AGT	2	6	609346	609351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622444
11065	NC_010334	GCT	2	6	609474	609479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622444
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11068	NC_010334	TAA	2	6	609581	609586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_010334	AGT	2	6	609599	609604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11091	NC_010334	GAT	2	6	610936	610941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622446
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11093	NC_010334	GCT	2	6	611029	611034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622446
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11103	NC_010334	TCG	2	6	611469	611474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622446
11104	NC_010334	CGG	2	6	611475	611480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622446
11105	NC_010334	GCT	2	6	611542	611547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622446
11106	NC_010334	CATC	2	8	611610	611617	25 %	25 %	0 %	50 %	167622446
11107	NC_010334	T	6	6	611773	611778	0 %	100 %	0 %	0 %	167622446
11108	NC_010334	TTA	2	6	611794	611799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622446
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11112	NC_010334	CG	3	6	612037	612042	0 %	0 %	50 %	50 %	167622446
11113	NC_010334	GAAA	2	8	612046	612053	75 %	0 %	25 %	0 %	167622446
11114	NC_010334	GCG	2	6	612116	612121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622446
11115	NC_010334	GCA	3	9	612178	612186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622446
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11118	NC_010334	CGT	2	6	612247	612252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622446
11119	NC_010334	GCT	2	6	612350	612355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11121	NC_010334	GTT	2	6	612435	612440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11245	NC_010334	CAT	2	6	618251	618256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622451
11246	NC_010334	AATT	2	8	618278	618285	50 %	50 %	0 %	0 %	167622451
11247	NC_010334	AGC	3	9	618341	618349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622451
11248	NC_010334	TGAG	2	8	618368	618375	25 %	25 %	50 %	0 %	167622451
11249	NC_010334	TGA	2	6	618419	618424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622451
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11251	NC_010334	ATG	2	6	618479	618484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622451
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11255	NC_010334	TGA	2	6	618848	618853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622452
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11260	NC_010334	A	7	7	619084	619090	100 %	0 %	0 %	0 %	167622452
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11264	NC_010334	CAA	2	6	619284	619289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11265	NC_010334	CCA	2	6	619296	619301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11266	NC_010334	AGA	2	6	619343	619348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11267	NC_010334	TACC	2	8	619398	619405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11268	NC_010334	GTT	2	6	619430	619435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11269	NC_010334	TA	3	6	619525	619530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11270	NC_010334	TGAT	2	8	619557	619564	25 %	50 %	25 %	0 %	167622453
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11274	NC_010334	CT	3	6	619859	619864	0 %	50 %	0 %	50 %	167622453
11275	NC_010334	A	6	6	619888	619893	100 %	0 %	0 %	0 %	167622453
11276	NC_010334	ATTA	2	8	619972	619979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11278	NC_010334	ATA	2	6	620009	620014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11279	NC_010334	TA	3	6	620030	620035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11283	NC_010334	A	6	6	620176	620181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11284	NC_010334	T	6	6	620239	620244	0 %	100 %	0 %	0 %	167622454
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11307	NC_010334	TGG	2	6	621271	621276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11367	NC_010334	AAG	2	6	624022	624027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622456
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11494	NC_010334	TC	3	6	630167	630172	0 %	50 %	0 %	50 %	167622462
11495	NC_010334	AAC	2	6	630228	630233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622462
11496	NC_010334	TTA	2	6	630283	630288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622462
11497	NC_010334	TAT	2	6	630457	630462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622462
11498	NC_010334	GCT	2	6	630475	630480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622462
11499	NC_010334	TTCT	2	8	630533	630540	0 %	75 %	0 %	25 %	167622462
11500	NC_010334	T	6	6	630563	630568	0 %	100 %	0 %	0 %	167622462

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