MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010334	ATT	2	6	579568	579573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622422
10502	NC_010334	GAT	2	6	579609	579614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622422
10503	NC_010334	TCG	2	6	579633	579638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10504	NC_010334	CGT	2	6	579649	579654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10505	NC_010334	GAT	2	6	579787	579792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622422
10506	NC_010334	CGA	2	6	579828	579833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10507	NC_010334	CG	3	6	579874	579879	0 %	0 %	50 %	50 %	167622422
10508	NC_010334	CTA	2	6	579978	579983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622422
10509	NC_010334	GTT	2	6	580025	580030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622422
10510	NC_010334	CGTC	2	8	580154	580161	0 %	25 %	25 %	50 %	167622422
10511	NC_010334	GTC	2	6	580175	580180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10512	NC_010334	TGA	2	6	580191	580196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622422
10513	NC_010334	CGG	2	6	580310	580315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622422
10514	NC_010334	TGAT	2	8	580324	580331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_010334	CTTCGG	2	12	580568	580579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622423
10516	NC_010334	CTTGA	2	10	580652	580661	20 %	40 %	20 %	20 %	167622423
10517	NC_010334	GAC	2	6	580686	580691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622423
10518	NC_010334	CGG	2	6	580797	580802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622423
10519	NC_010334	TAA	2	6	580826	580831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622423
10520	NC_010334	ATT	2	6	580845	580850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622423
10521	NC_010334	GCC	2	6	580878	580883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622423
10522	NC_010334	AAACG	2	10	581042	581051	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10523	NC_010334	TAAAA	2	10	581055	581064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_010334	CTT	2	6	581127	581132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_010334	T	6	6	581187	581192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_010334	TAA	2	6	581309	581314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_010334	ATT	2	6	581361	581366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_010334	TTA	2	6	581385	581390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_010334	ACT	2	6	581404	581409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_010334	TTA	2	6	581487	581492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622424
10531	NC_010334	GAT	2	6	581522	581527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622424
10532	NC_010334	GCA	2	6	581661	581666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622424
10533	NC_010334	TCAA	2	8	581772	581779	50 %	25 %	0 %	25 %	167622424
10534	NC_010334	AGA	2	6	581801	581806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622424
10535	NC_010334	TCG	2	6	581843	581848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622424
10536	NC_010334	AAG	2	6	581952	581957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622424
10537	NC_010334	TGC	2	6	581989	581994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622424
10538	NC_010334	GTG	2	6	582082	582087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622424
10539	NC_010334	CAC	2	6	582096	582101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622424
10540	NC_010334	GACTG	2	10	582258	582267	20 %	20 %	40 %	20 %	167622424
10541	NC_010334	TCA	2	6	582362	582367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622424
10542	NC_010334	TCT	2	6	582387	582392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622424
10543	NC_010334	GC	3	6	582458	582463	0 %	0 %	50 %	50 %	167622424
10544	NC_010334	TAAA	2	8	582541	582548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_010334	CAT	2	6	582664	582669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_010334	GAT	2	6	582691	582696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_010334	TTG	2	6	582720	582725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_010334	TAT	2	6	582758	582763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_010334	CTG	2	6	582764	582769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_010334	CCT	2	6	582902	582907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167622425
10551	NC_010334	TGC	2	6	582911	582916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10552	NC_010334	TCAGCT	2	12	583031	583042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622425
10553	NC_010334	ATT	2	6	583085	583090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622425
10554	NC_010334	GCA	2	6	583111	583116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10555	NC_010334	CA	3	6	583115	583120	50 %	0 %	0 %	50 %	167622425
10556	NC_010334	GCT	2	6	583196	583201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10557	NC_010334	CAG	2	6	583238	583243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10558	NC_010334	AG	3	6	583277	583282	50 %	0 %	50 %	0 %	167622425
10559	NC_010334	CCA	2	6	583363	583368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622425
10560	NC_010334	AGATTG	2	12	583369	583380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622425
10561	NC_010334	G	9	9	583401	583409	0 %	0 %	100 %	0 %	167622425
10562	NC_010334	ATCT	2	8	583474	583481	25 %	50 %	0 %	25 %	167622425
10563	NC_010334	CCG	2	6	583597	583602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622425
10564	NC_010334	AT	3	6	583670	583675	50 %	50 %	0 %	0 %	167622425
10565	NC_010334	CTA	2	6	583728	583733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
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10567	NC_010334	TGAC	2	8	583801	583808	25 %	25 %	25 %	25 %	167622425
10568	NC_010334	CTA	2	6	583851	583856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
10569	NC_010334	AGCA	2	8	583870	583877	50 %	0 %	25 %	25 %	167622425
10570	NC_010334	AAG	2	6	583884	583889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622425
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10572	NC_010334	ATT	2	6	584052	584057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622425
10573	NC_010334	GGTGC	2	10	584058	584067	0 %	20 %	60 %	20 %	167622425
10574	NC_010334	AAG	2	6	584089	584094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622425
10575	NC_010334	TTA	2	6	584097	584102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622425
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10578	NC_010334	TTG	2	6	584179	584184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622425
10579	NC_010334	ATC	2	6	584195	584200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
10580	NC_010334	ATT	2	6	584370	584375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622425
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10583	NC_010334	ATCG	2	8	584441	584448	25 %	25 %	25 %	25 %	167622425
10584	NC_010334	GC	3	6	584499	584504	0 %	0 %	50 %	50 %	167622425
10585	NC_010334	CAA	2	6	584511	584516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622425
10586	NC_010334	CTA	2	6	584532	584537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
10587	NC_010334	TGC	2	6	584561	584566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10588	NC_010334	GCA	2	6	584578	584583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10589	NC_010334	CTA	2	6	584693	584698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
10590	NC_010334	TCTT	2	8	584714	584721	0 %	75 %	0 %	25 %	167622425
10591	NC_010334	G	6	6	584771	584776	0 %	0 %	100 %	0 %	167622425
10592	NC_010334	TGC	3	9	584804	584812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10593	NC_010334	TTG	2	6	584830	584835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622425
10594	NC_010334	TCA	2	6	584851	584856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622425
10595	NC_010334	CTT	2	6	584864	584869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622425
10596	NC_010334	AGT	2	6	584997	585002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622425
10597	NC_010334	CG	3	6	585051	585056	0 %	0 %	50 %	50 %	167622425
10598	NC_010334	GAT	2	6	585062	585067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622425
10599	NC_010334	GCTTT	2	10	585088	585097	0 %	60 %	20 %	20 %	167622425
10600	NC_010334	GAT	2	6	585105	585110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622425
10601	NC_010334	GCT	2	6	585178	585183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622425
10602	NC_010334	ATT	2	6	585297	585302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622425
10603	NC_010334	GATA	2	8	585597	585604	50 %	25 %	25 %	0 %	167622426
10604	NC_010334	GTTTAA	2	12	585642	585653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_010334	TCAC	2	8	585678	585685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_010334	AAT	2	6	585734	585739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_010334	A	6	6	585836	585841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_010334	GTTA	2	8	585883	585890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_010334	CG	3	6	585915	585920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_010334	CAT	2	6	585970	585975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_010334	TAGT	2	8	585988	585995	25 %	50 %	25 %	0 %	167622427
10612	NC_010334	CAT	2	6	586054	586059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622427
10613	NC_010334	ATA	2	6	586135	586140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622427
10614	NC_010334	GCC	2	6	586145	586150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622427
10615	NC_010334	CAC	2	6	586157	586162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622427
10616	NC_010334	CAT	2	6	586237	586242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622427
10617	NC_010334	TCA	2	6	586302	586307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622427
10618	NC_010334	CGC	2	6	586333	586338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622427
10619	NC_010334	CAT	2	6	586382	586387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622427
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10621	NC_010334	TGCCA	2	10	586505	586514	20 %	20 %	20 %	40 %	167622427
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10985	NC_010334	TGA	2	6	605197	605202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622442
10986	NC_010334	CAC	3	9	605369	605377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622442
10987	NC_010334	TCTT	2	8	605428	605435	0 %	75 %	0 %	25 %	167622442
10988	NC_010334	ACC	2	6	605484	605489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622442
10989	NC_010334	TTCC	2	8	605511	605518	0 %	50 %	0 %	50 %	167622442
10990	NC_010334	T	6	6	605540	605545	0 %	100 %	0 %	0 %	167622442
10991	NC_010334	T	6	6	605571	605576	0 %	100 %	0 %	0 %	167622442
10992	NC_010334	A	6	6	605620	605625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10993	NC_010334	GCA	2	6	605629	605634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10994	NC_010334	GTG	2	6	605774	605779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10995	NC_010334	TGA	2	6	605794	605799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10996	NC_010334	TAA	2	6	605850	605855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10997	NC_010334	GCT	2	6	605900	605905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10998	NC_010334	GATTTA	2	12	605934	605945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10999	NC_010334	ATTA	2	8	605951	605958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_010334	TCA	2	6	605959	605964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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