MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_010334	GCCA	2	8	554644	554651	25 %	0 %	25 %	50 %	167622408
10002	NC_010334	AGC	2	6	554673	554678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622408
10003	NC_010334	AGC	2	6	554715	554720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622408
10004	NC_010334	CTG	2	6	554758	554763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622408
10005	NC_010334	ATA	2	6	554830	554835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622408
10006	NC_010334	TAA	2	6	554858	554863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622408
10007	NC_010334	CAA	2	6	554893	554898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622408
10008	NC_010334	AAG	2	6	554958	554963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622408
10009	NC_010334	AACC	2	8	555051	555058	50 %	0 %	0 %	50 %	167622408
10010	NC_010334	GCAG	2	8	555107	555114	25 %	0 %	50 %	25 %	167622408
10011	NC_010334	GCT	2	6	555169	555174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622408
10012	NC_010334	TTG	2	6	555177	555182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622408
10013	NC_010334	T	6	6	555197	555202	0 %	100 %	0 %	0 %	167622408
10014	NC_010334	TGC	2	6	555231	555236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622408
10015	NC_010334	TCA	3	9	555247	555255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622408
10016	NC_010334	CGG	2	6	555298	555303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622408
10017	NC_010334	ATT	2	6	555369	555374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622408
10018	NC_010334	TCA	2	6	555445	555450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10019	NC_010334	CTA	2	6	555453	555458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10020	NC_010334	TAGG	2	8	555477	555484	25 %	25 %	50 %	0 %	167622409
10021	NC_010334	GCC	2	6	555502	555507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622409
10022	NC_010334	ACC	2	6	555524	555529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622409
10023	NC_010334	CAT	2	6	555570	555575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10024	NC_010334	ATC	2	6	555644	555649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10025	NC_010334	AAC	2	6	555674	555679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622409
10026	NC_010334	GTG	2	6	555683	555688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622409
10027	NC_010334	CTG	2	6	555777	555782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622409
10028	NC_010334	GGT	2	6	555823	555828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622409
10029	NC_010334	GCGA	2	8	555838	555845	25 %	0 %	50 %	25 %	167622409
10030	NC_010334	GC	4	8	555942	555949	0 %	0 %	50 %	50 %	167622409
10031	NC_010334	AAG	2	6	555996	556001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622409
10032	NC_010334	ATG	2	6	556025	556030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622409
10033	NC_010334	AGC	2	6	556100	556105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622409
10034	NC_010334	ATA	2	6	556121	556126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622409
10035	NC_010334	CGA	2	6	556128	556133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622409
10036	NC_010334	CGG	3	9	556140	556148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622409
10037	NC_010334	CTT	2	6	556162	556167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622409
10038	NC_010334	ATC	2	6	556276	556281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10039	NC_010334	AG	4	8	556312	556319	50 %	0 %	50 %	0 %	167622409
10040	NC_010334	TGG	2	6	556347	556352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622409
10041	NC_010334	AGT	2	6	556355	556360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622409
10042	NC_010334	AGC	2	6	556394	556399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622409
10043	NC_010334	GTC	2	6	556406	556411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622409
10044	NC_010334	CAGC	2	8	556428	556435	25 %	0 %	25 %	50 %	167622409
10045	NC_010334	TGG	2	6	556437	556442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622409
10046	NC_010334	TCA	2	6	556455	556460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622409
10047	NC_010334	T	7	7	556482	556488	0 %	100 %	0 %	0 %	167622409
10048	NC_010334	T	6	6	556526	556531	0 %	100 %	0 %	0 %	167622409
10049	NC_010334	T	6	6	556658	556663	0 %	100 %	0 %	0 %	167622409
10050	NC_010334	TTG	2	6	556695	556700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622409
10051	NC_010334	AT	3	6	556725	556730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_010334	AGG	2	6	556748	556753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_010334	GCTT	2	8	556856	556863	0 %	50 %	25 %	25 %	167622410
10054	NC_010334	GCC	2	6	556882	556887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622410
10055	NC_010334	ATG	2	6	556892	556897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622410
10056	NC_010334	TCA	2	6	556923	556928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622410
10057	NC_010334	GCC	2	6	556957	556962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622410
10058	NC_010334	G	6	6	556992	556997	0 %	0 %	100 %	0 %	167622410
10059	NC_010334	TAG	2	6	557038	557043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622410
10060	NC_010334	CTG	2	6	557046	557051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622410
10061	NC_010334	AAT	2	6	557110	557115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622410
10062	NC_010334	GCC	2	6	557231	557236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622410
10063	NC_010334	CACC	2	8	557274	557281	25 %	0 %	0 %	75 %	167622410
10064	NC_010334	CAC	2	6	557284	557289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622410
10065	NC_010334	AGCGC	2	10	557313	557322	20 %	0 %	40 %	40 %	167622410
10066	NC_010334	CGG	2	6	557400	557405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622410
10067	NC_010334	ATC	2	6	557495	557500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622410
10068	NC_010334	GCA	2	6	557514	557519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622410
10069	NC_010334	AAT	2	6	557531	557536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622410
10070	NC_010334	TCT	2	6	557610	557615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622410
10071	NC_010334	GC	3	6	557743	557748	0 %	0 %	50 %	50 %	167622410
10072	NC_010334	CAT	2	6	557916	557921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622410
10073	NC_010334	TCA	2	6	557942	557947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622410
10074	NC_010334	TATCGG	2	12	557952	557963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167622410
10075	NC_010334	TTC	2	6	557986	557991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622410
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10077	NC_010334	GGCA	2	8	558182	558189	25 %	0 %	50 %	25 %	167622410
10078	NC_010334	CTT	2	6	558208	558213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622410
10079	NC_010334	TGA	2	6	558330	558335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622410
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10083	NC_010334	TC	3	6	558611	558616	0 %	50 %	0 %	50 %	167622411
10084	NC_010334	TA	3	6	558639	558644	50 %	50 %	0 %	0 %	167622411
10085	NC_010334	CTG	2	6	558662	558667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622411
10086	NC_010334	TAA	2	6	558680	558685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622411
10087	NC_010334	AGT	2	6	558723	558728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622411
10088	NC_010334	GCT	2	6	558739	558744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622411
10089	NC_010334	CAG	2	6	558809	558814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622411
10090	NC_010334	TGC	2	6	558819	558824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622411
10091	NC_010334	CTTT	2	8	558857	558864	0 %	75 %	0 %	25 %	167622411
10092	NC_010334	GCAAT	2	10	558884	558893	40 %	20 %	20 %	20 %	167622411
10093	NC_010334	TCA	2	6	558974	558979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622411
10094	NC_010334	TAC	2	6	559102	559107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_010334	CATAAT	3	18	559129	559146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10096	NC_010334	GTC	2	6	559220	559225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_010334	CTAA	2	8	559245	559252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10098	NC_010334	TAA	2	6	559286	559291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_010334	GTT	2	6	559429	559434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_010334	A	6	6	559470	559475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_010334	GTAG	2	8	559485	559492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_010334	GTT	2	6	559506	559511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_010334	TGT	2	6	559518	559523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_010334	T	7	7	559553	559559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_010334	GGT	2	6	559560	559565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_010334	TAT	2	6	559578	559583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_010334	ATT	2	6	559592	559597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_010334	TTAT	2	8	559598	559605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_010334	ATTG	2	8	559612	559619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_010334	A	6	6	559636	559641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_010334	ATG	2	6	559749	559754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_010334	TAA	2	6	559756	559761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_010334	GA	3	6	559788	559793	50 %	0 %	50 %	0 %	167622412
10114	NC_010334	TGT	2	6	559930	559935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622412
10115	NC_010334	ATC	2	6	559953	559958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622412
10116	NC_010334	CGA	2	6	560047	560052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622412
10117	NC_010334	GCT	2	6	560076	560081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622412
10118	NC_010334	GCC	2	6	560099	560104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622412
10119	NC_010334	ATG	2	6	560112	560117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622412
10120	NC_010334	TTAA	2	8	560127	560134	50 %	50 %	0 %	0 %	167622412
10121	NC_010334	GAT	2	6	560158	560163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622412
10122	NC_010334	GCC	2	6	560168	560173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622412
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10127	NC_010334	TGG	2	6	560595	560600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622412
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10131	NC_010334	GAT	2	6	560818	560823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_010334	AAGT	2	8	560867	560874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10142	NC_010334	TGA	2	6	561324	561329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622413
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10163	NC_010334	TTA	2	6	562563	562568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10362	NC_010334	GCA	2	6	572199	572204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622419
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10484	NC_010334	GTGC	2	8	578737	578744	0 %	25 %	50 %	25 %	167622422
10485	NC_010334	AGA	2	6	578879	578884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622422
10486	NC_010334	TGG	2	6	578885	578890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622422
10487	NC_010334	TAC	2	6	578967	578972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622422
10488	NC_010334	TGA	2	6	578988	578993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622422
10489	NC_010334	CA	3	6	579052	579057	50 %	0 %	0 %	50 %	167622422
10490	NC_010334	CAC	2	6	579091	579096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622422
10491	NC_010334	AC	3	6	579095	579100	50 %	0 %	0 %	50 %	167622422
10492	NC_010334	TCA	2	6	579110	579115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622422
10493	NC_010334	GGT	2	6	579124	579129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622422
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10495	NC_010334	TGC	3	9	579273	579281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10496	NC_010334	AATC	2	8	579311	579318	50 %	25 %	0 %	25 %	167622422
10497	NC_010334	ATTAC	2	10	579352	579361	40 %	40 %	0 %	20 %	167622422
10498	NC_010334	GAA	2	6	579420	579425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622422
10499	NC_010334	AGC	2	6	579476	579481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622422
10500	NC_010334	GCG	2	6	579532	579537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622422

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