MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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94002	NC_010334	TAT	2	6	5186979	5186984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626183
94003	NC_010334	AATG	2	8	5187130	5187137	50 %	25 %	25 %	0 %	167626183
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94006	NC_010334	TAC	2	6	5187384	5187389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626184
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94012	NC_010334	AGAT	2	8	5187658	5187665	50 %	25 %	25 %	0 %	167626184
94013	NC_010334	CGG	2	6	5187691	5187696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626184
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94098	NC_010334	TA	3	6	5192749	5192754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94099	NC_010334	A	6	6	5192760	5192765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94101	NC_010334	A	8	8	5192894	5192901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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94104	NC_010334	ATTTA	2	10	5192961	5192970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94105	NC_010334	ACTA	2	8	5193063	5193070	50 %	25 %	0 %	25 %	167626189
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94238	NC_010334	TCA	2	6	5199954	5199959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626193
94239	NC_010334	GTA	2	6	5200015	5200020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626193
94240	NC_010334	GCT	3	9	5200030	5200038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626193
94241	NC_010334	GCCATA	2	12	5200067	5200078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626193
94242	NC_010334	GAA	2	6	5200159	5200164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626193
94243	NC_010334	TAC	2	6	5200214	5200219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626193
94244	NC_010334	TTA	2	6	5200281	5200286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94245	NC_010334	TTA	2	6	5200311	5200316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94246	NC_010334	CGACT	2	10	5200321	5200330	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94247	NC_010334	CCA	2	6	5200370	5200375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626194
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94249	NC_010334	GCAT	2	8	5200450	5200457	25 %	25 %	25 %	25 %	167626194
94250	NC_010334	T	6	6	5200484	5200489	0 %	100 %	0 %	0 %	167626194
94251	NC_010334	CTG	2	6	5200512	5200517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626194
94252	NC_010334	GAT	2	6	5200683	5200688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626194
94253	NC_010334	TTA	2	6	5200715	5200720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94254	NC_010334	CAA	2	6	5200731	5200736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94255	NC_010334	ACTCAA	2	12	5200743	5200754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94256	NC_010334	TCA	2	6	5200770	5200775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94257	NC_010334	ATG	2	6	5200781	5200786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94258	NC_010334	ATT	2	6	5200819	5200824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626195
94259	NC_010334	AGC	2	6	5201061	5201066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626195
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94263	NC_010334	CCTTAA	2	12	5201332	5201343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626195
94264	NC_010334	AAT	2	6	5201371	5201376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626195
94265	NC_010334	TAGC	2	8	5201406	5201413	25 %	25 %	25 %	25 %	167626195
94266	NC_010334	TCA	2	6	5201476	5201481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626195
94267	NC_010334	GCC	2	6	5201514	5201519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626195
94268	NC_010334	TAA	2	6	5201530	5201535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626195
94269	NC_010334	ATC	2	6	5201618	5201623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626195
94270	NC_010334	TAC	2	6	5201729	5201734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626195
94271	NC_010334	CTCA	2	8	5201756	5201763	25 %	25 %	0 %	50 %	167626195
94272	NC_010334	CG	3	6	5201765	5201770	0 %	0 %	50 %	50 %	167626195
94273	NC_010334	CCT	2	6	5201788	5201793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167626195
94274	NC_010334	ACC	2	6	5201817	5201822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626195
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94291	NC_010334	AAAT	2	8	5202936	5202943	75 %	25 %	0 %	0 %	167626195
94292	NC_010334	TGC	3	9	5202969	5202977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626195
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94331	NC_010334	ACA	2	6	5205125	5205130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626197
94332	NC_010334	ATA	2	6	5205148	5205153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626197
94333	NC_010334	CA	3	6	5205260	5205265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94334	NC_010334	CATTTT	2	12	5205270	5205281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94335	NC_010334	T	6	6	5205278	5205283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94336	NC_010334	TA	4	8	5205368	5205375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94337	NC_010334	AGC	2	6	5205396	5205401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94338	NC_010334	AAC	2	6	5205520	5205525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94339	NC_010334	AAG	2	6	5205543	5205548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94340	NC_010334	CTT	2	6	5205687	5205692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94341	NC_010334	A	7	7	5205701	5205707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94342	NC_010334	T	7	7	5205722	5205728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94343	NC_010334	TTC	2	6	5205756	5205761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626198
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94346	NC_010334	CTGC	2	8	5205886	5205893	0 %	25 %	25 %	50 %	167626198
94347	NC_010334	TCA	2	6	5205894	5205899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626198
94348	NC_010334	ACG	2	6	5205918	5205923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626198
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94351	NC_010334	CTT	2	6	5205985	5205990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626198
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94470	NC_010334	A	6	6	5211741	5211746	100 %	0 %	0 %	0 %	167626205
94471	NC_010334	AC	3	6	5211759	5211764	50 %	0 %	0 %	50 %	167626205
94472	NC_010334	AGGTA	2	10	5211815	5211824	40 %	20 %	40 %	0 %	167626205
94473	NC_010334	TAA	2	6	5211829	5211834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626205
94474	NC_010334	GGC	2	6	5211841	5211846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167626205
94475	NC_010334	TCA	2	6	5211885	5211890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626205
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94480	NC_010334	TCA	2	6	5212347	5212352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626206
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94484	NC_010334	C	6	6	5212536	5212541	0 %	0 %	0 %	100 %	167626206
94485	NC_010334	AAAAG	2	10	5212551	5212560	80 %	0 %	20 %	0 %	167626206
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94490	NC_010334	ATA	2	6	5212844	5212849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94491	NC_010334	TAAT	2	8	5212915	5212922	50 %	50 %	0 %	0 %	167626207
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