MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_010334	ACA	2	6	5132051	5132056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93002	NC_010334	CAA	2	6	5132072	5132077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93003	NC_010334	GGA	2	6	5132117	5132122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93004	NC_010334	AGC	2	6	5132133	5132138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93005	NC_010334	CTT	2	6	5132202	5132207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626131
93006	NC_010334	TAC	2	6	5132330	5132335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626131
93007	NC_010334	CAT	2	6	5132366	5132371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626131
93008	NC_010334	AGC	2	6	5132398	5132403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93009	NC_010334	AAG	2	6	5132610	5132615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626131
93010	NC_010334	CAA	2	6	5132653	5132658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626131
93011	NC_010334	GAT	2	6	5133011	5133016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626131
93012	NC_010334	GTC	2	6	5133042	5133047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93013	NC_010334	AAG	2	6	5133078	5133083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626131
93014	NC_010334	GAC	2	6	5133227	5133232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93015	NC_010334	CGC	2	6	5133239	5133244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626131
93016	NC_010334	AGC	2	6	5133255	5133260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93017	NC_010334	AGA	2	6	5133334	5133339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626131
93018	NC_010334	ACT	2	6	5133346	5133351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626131
93019	NC_010334	GAT	2	6	5133365	5133370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626131
93020	NC_010334	TCG	2	6	5133375	5133380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93021	NC_010334	GCC	2	6	5133417	5133422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626131
93022	NC_010334	CATCTG	2	12	5133436	5133447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626131
93023	NC_010334	TAC	2	6	5133458	5133463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626131
93024	NC_010334	CAG	3	9	5133479	5133487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626131
93025	NC_010334	TC	3	6	5133489	5133494	0 %	50 %	0 %	50 %	167626131
93026	NC_010334	T	7	7	5133546	5133552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93027	NC_010334	TGA	2	6	5133614	5133619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93028	NC_010334	TCA	2	6	5133753	5133758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626132
93029	NC_010334	GCC	2	6	5133803	5133808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626132
93030	NC_010334	CT	3	6	5133847	5133852	0 %	50 %	0 %	50 %	167626132
93031	NC_010334	CGCC	2	8	5133891	5133898	0 %	0 %	25 %	75 %	167626132
93032	NC_010334	GCAA	2	8	5133921	5133928	50 %	0 %	25 %	25 %	167626132
93033	NC_010334	GCA	2	6	5133946	5133951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626132
93034	NC_010334	AGA	2	6	5133976	5133981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626132
93035	NC_010334	TCAA	2	8	5134176	5134183	50 %	25 %	0 %	25 %	167626132
93036	NC_010334	AGC	2	6	5134210	5134215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626132
93037	NC_010334	AGA	2	6	5134285	5134290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626132
93038	NC_010334	CTT	2	6	5134411	5134416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626132
93039	NC_010334	TCA	2	6	5134422	5134427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626132
93040	NC_010334	AT	3	6	5134435	5134440	50 %	50 %	0 %	0 %	167626132
93041	NC_010334	GCA	2	6	5134594	5134599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626132
93042	NC_010334	ATC	2	6	5134601	5134606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626132
93043	NC_010334	GCC	2	6	5134706	5134711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626132
93044	NC_010334	AAG	2	6	5134721	5134726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626132
93045	NC_010334	CCA	2	6	5134945	5134950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626132
93046	NC_010334	CCG	2	6	5134996	5135001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626132
93047	NC_010334	GC	3	6	5135122	5135127	0 %	0 %	50 %	50 %	167626132
93048	NC_010334	G	7	7	5135336	5135342	0 %	0 %	100 %	0 %	167626132
93049	NC_010334	ATG	2	6	5135364	5135369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626132
93050	NC_010334	GCA	2	6	5135434	5135439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626132
93051	NC_010334	ATCA	2	8	5135473	5135480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93052	NC_010334	TAGC	2	8	5135607	5135614	25 %	25 %	25 %	25 %	167626133
93053	NC_010334	TCA	2	6	5135651	5135656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626133
93054	NC_010334	TCT	2	6	5135688	5135693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626133
93055	NC_010334	GCA	2	6	5135695	5135700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626133
93056	NC_010334	GAC	2	6	5135729	5135734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626133
93057	NC_010334	TCA	2	6	5135787	5135792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626133
93058	NC_010334	ATC	2	6	5135877	5135882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626133
93059	NC_010334	GCAC	2	8	5135900	5135907	25 %	0 %	25 %	50 %	167626133
93060	NC_010334	CGA	2	6	5135956	5135961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626133
93061	NC_010334	ACT	2	6	5136009	5136014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626133
93062	NC_010334	G	6	6	5136034	5136039	0 %	0 %	100 %	0 %	167626133
93063	NC_010334	CAG	2	6	5136287	5136292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626133
93064	NC_010334	CAGCTA	2	12	5136296	5136307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167626133
93065	NC_010334	CACC	2	8	5136312	5136319	25 %	0 %	0 %	75 %	167626133
93066	NC_010334	GCC	2	6	5136347	5136352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626133
93067	NC_010334	AGCA	2	8	5136354	5136361	50 %	0 %	25 %	25 %	167626133
93068	NC_010334	TCG	2	6	5136423	5136428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626133
93069	NC_010334	GC	3	6	5136445	5136450	0 %	0 %	50 %	50 %	167626133
93070	NC_010334	CTT	2	6	5136553	5136558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626133
93071	NC_010334	TAGC	2	8	5136600	5136607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93072	NC_010334	T	6	6	5136614	5136619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93073	NC_010334	CTGCC	2	10	5136637	5136646	0 %	20 %	20 %	60 %	167626134
93074	NC_010334	CAA	2	6	5136754	5136759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626134
93075	NC_010334	TGT	2	6	5136812	5136817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626134
93076	NC_010334	TCA	2	6	5136897	5136902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626134
93077	NC_010334	TCA	2	6	5136930	5136935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626134
93078	NC_010334	GCA	2	6	5137004	5137009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626134
93079	NC_010334	GA	3	6	5137147	5137152	50 %	0 %	50 %	0 %	167626134
93080	NC_010334	CAT	3	9	5137203	5137211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626134
93081	NC_010334	CCA	2	6	5137281	5137286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626134
93082	NC_010334	GCCTTA	2	12	5137307	5137318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167626134
93083	NC_010334	AGGC	2	8	5137353	5137360	25 %	0 %	50 %	25 %	167626134
93084	NC_010334	A	6	6	5137526	5137531	100 %	0 %	0 %	0 %	167626134
93085	NC_010334	ACG	2	6	5137552	5137557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626134
93086	NC_010334	TTA	2	6	5137851	5137856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626134
93087	NC_010334	TAA	2	6	5137873	5137878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626134
93088	NC_010334	CTG	2	6	5137879	5137884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626134
93089	NC_010334	GCAA	2	8	5137949	5137956	50 %	0 %	25 %	25 %	167626134
93090	NC_010334	CATG	2	8	5138037	5138044	25 %	25 %	25 %	25 %	167626134
93091	NC_010334	CCA	2	6	5138063	5138068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626134
93092	NC_010334	CAC	2	6	5138109	5138114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626134
93093	NC_010334	CCAT	2	8	5138132	5138139	25 %	25 %	0 %	50 %	167626134
93094	NC_010334	TC	3	6	5138183	5138188	0 %	50 %	0 %	50 %	167626134
93095	NC_010334	ATCG	2	8	5138227	5138234	25 %	25 %	25 %	25 %	167626134
93096	NC_010334	AGGCA	2	10	5138248	5138257	40 %	0 %	40 %	20 %	167626134
93097	NC_010334	CAC	2	6	5138311	5138316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626134
93098	NC_010334	TGA	2	6	5138322	5138327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626134
93099	NC_010334	TCA	2	6	5138328	5138333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626134
93100	NC_010334	CGA	2	6	5138355	5138360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626134
93101	NC_010334	ACC	2	6	5138368	5138373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626134
93102	NC_010334	GCA	2	6	5138411	5138416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626134
93103	NC_010334	CCCT	2	8	5138419	5138426	0 %	25 %	0 %	75 %	167626134
93104	NC_010334	TAG	2	6	5138491	5138496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626134
93105	NC_010334	TAA	2	6	5138599	5138604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626134
93106	NC_010334	TGG	2	6	5138608	5138613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626134
93107	NC_010334	TGT	2	6	5138732	5138737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626135
93108	NC_010334	CTG	2	6	5138782	5138787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626135
93109	NC_010334	CTG	2	6	5138863	5138868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626135
93110	NC_010334	AGT	2	6	5138883	5138888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626135
93111	NC_010334	CAT	2	6	5138928	5138933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626135
93112	NC_010334	TGC	2	6	5139110	5139115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626135
93113	NC_010334	TGA	2	6	5139206	5139211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626135
93114	NC_010334	TCG	2	6	5139314	5139319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626135
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93116	NC_010334	CAG	2	6	5139370	5139375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626135
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93237	NC_010334	GAT	2	6	5144504	5144509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626141
93238	NC_010334	AAC	2	6	5144553	5144558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626141
93239	NC_010334	A	6	6	5144645	5144650	100 %	0 %	0 %	0 %	167626141
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93265	NC_010334	AATA	2	8	5145969	5145976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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93331	NC_010334	TAT	2	6	5149480	5149485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626146
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93343	NC_010334	ATG	2	6	5150442	5150447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626147
93344	NC_010334	TGT	3	9	5150468	5150476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626147
93345	NC_010334	AG	3	6	5150511	5150516	50 %	0 %	50 %	0 %	167626147
93346	NC_010334	GAG	2	6	5150523	5150528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626147
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93349	NC_010334	TGC	3	9	5150662	5150670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626147
93350	NC_010334	CCA	2	6	5150733	5150738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626147
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93352	NC_010334	TGGC	2	8	5150794	5150801	0 %	25 %	50 %	25 %	167626147
93353	NC_010334	AGT	2	6	5151009	5151014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626147
93354	NC_010334	ATG	2	6	5151103	5151108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626147
93355	NC_010334	GCA	2	6	5151147	5151152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626147
93356	NC_010334	AGTT	2	8	5151214	5151221	25 %	50 %	25 %	0 %	167626147
93357	NC_010334	GCA	2	6	5151251	5151256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626147
93358	NC_010334	AAG	2	6	5151338	5151343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626148
93359	NC_010334	A	6	6	5151346	5151351	100 %	0 %	0 %	0 %	167626148
93360	NC_010334	GCA	2	6	5151366	5151371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626148
93361	NC_010334	GCC	2	6	5151379	5151384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167626148
93362	NC_010334	ATG	2	6	5151478	5151483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626148
93363	NC_010334	GAT	2	6	5151501	5151506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626148
93364	NC_010334	GAT	2	6	5151522	5151527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626148
93365	NC_010334	GCT	3	9	5151549	5151557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626148
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93380	NC_010334	CA	3	6	5152004	5152009	50 %	0 %	0 %	50 %	167626149
93381	NC_010334	GCT	2	6	5152097	5152102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626149
93382	NC_010334	TGC	2	6	5152187	5152192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626149
93383	NC_010334	TATCGA	2	12	5152215	5152226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	167626150
93384	NC_010334	GTT	2	6	5152293	5152298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626150
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93386	NC_010334	ATTA	2	8	5152541	5152548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93387	NC_010334	TGC	2	6	5152715	5152720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626151
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93399	NC_010334	CATAC	2	10	5153385	5153394	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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93402	NC_010334	GCTA	2	8	5153595	5153602	25 %	25 %	25 %	25 %	167626152
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93417	NC_010334	TC	3	6	5154364	5154369	0 %	50 %	0 %	50 %	167626154
93418	NC_010334	GC	3	6	5154392	5154397	0 %	0 %	50 %	50 %	167626154
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93422	NC_010334	A	6	6	5154748	5154753	100 %	0 %	0 %	0 %	167626154
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93433	NC_010334	TAC	2	6	5155462	5155467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626155
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93459	NC_010334	ACC	2	6	5156916	5156921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626157
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93465	NC_010334	AGCTA	2	10	5157190	5157199	40 %	20 %	20 %	20 %	167626157
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93467	NC_010334	CAGA	2	8	5157348	5157355	50 %	0 %	25 %	25 %	167626157
93468	NC_010334	CTG	2	6	5157400	5157405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626157
93469	NC_010334	AAC	2	6	5157423	5157428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626157
93470	NC_010334	GAG	2	6	5157540	5157545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626157
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93472	NC_010334	GAC	2	6	5157609	5157614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626157
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