MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
91501	NC_010334	CGA	2	6	5048735	5048740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91502	NC_010334	CAT	2	6	5048896	5048901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91503	NC_010334	GCC	2	6	5048971	5048976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91504	NC_010334	CAAT	2	8	5049018	5049025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91505	NC_010334	CAC	2	6	5049158	5049163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91506	NC_010334	TC	3	6	5049223	5049228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91507	NC_010334	ACC	2	6	5049253	5049258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91508	NC_010334	CTA	2	6	5049282	5049287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91509	NC_010334	AGA	2	6	5049299	5049304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91510	NC_010334	ACT	2	6	5049327	5049332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91511	NC_010334	TCA	2	6	5049333	5049338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91512	NC_010334	TCA	2	6	5049352	5049357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91513	NC_010334	CAAC	2	8	5049420	5049427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91514	NC_010334	CTAGC	2	10	5049434	5049443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91515	NC_010334	TC	3	6	5049452	5049457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91516	NC_010334	CCTTCA	2	12	5049658	5049669	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91517	NC_010334	CTC	2	6	5049685	5049690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91518	NC_010334	CGACT	2	10	5049765	5049774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91519	NC_010334	CTTT	2	8	5049789	5049796	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91520	NC_010334	ATG	2	6	5049799	5049804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91521	NC_010334	GCT	2	6	5049805	5049810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91522	NC_010334	GTT	2	6	5049895	5049900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91523	NC_010334	ACG	2	6	5049910	5049915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91524	NC_010334	GT	3	6	5049932	5049937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91525	NC_010334	GAG	2	6	5050062	5050067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91526	NC_010334	TCA	2	6	5050115	5050120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91527	NC_010334	GT	3	6	5050139	5050144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91528	NC_010334	TCC	2	6	5050149	5050154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91529	NC_010334	GTCA	2	8	5050436	5050443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91530	NC_010334	GGA	2	6	5050459	5050464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91531	NC_010334	C	6	6	5050469	5050474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91532	NC_010334	AGTT	2	8	5050523	5050530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91533	NC_010334	TCGC	2	8	5050616	5050623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91534	NC_010334	CTA	2	6	5050626	5050631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91535	NC_010334	TCC	2	6	5050655	5050660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91536	NC_010334	CACTA	2	10	5050696	5050705	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91537	NC_010334	TAC	2	6	5050806	5050811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91538	NC_010334	CCA	2	6	5050842	5050847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91539	NC_010334	GTT	2	6	5050903	5050908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91540	NC_010334	CAA	2	6	5051008	5051013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91541	NC_010334	T	6	6	5051051	5051056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91542	NC_010334	AAC	2	6	5051080	5051085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91543	NC_010334	A	6	6	5051157	5051162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91544	NC_010334	TGG	2	6	5051244	5051249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91545	NC_010334	CCT	2	6	5051274	5051279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91546	NC_010334	AGGC	2	8	5051287	5051294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91547	NC_010334	CAAA	2	8	5051333	5051340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91548	NC_010334	TCTT	2	8	5051358	5051365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91549	NC_010334	TGG	2	6	5051385	5051390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91550	NC_010334	ACC	2	6	5051407	5051412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91551	NC_010334	CTTT	2	8	5051475	5051482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91552	NC_010334	TG	3	6	5051497	5051502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91553	NC_010334	CAA	2	6	5051509	5051514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91554	NC_010334	AGG	2	6	5051538	5051543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91555	NC_010334	GT	3	6	5051679	5051684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91556	NC_010334	GT	3	6	5051848	5051853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91557	NC_010334	ATG	2	6	5051873	5051878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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91559	NC_010334	TCC	2	6	5051899	5051904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91560	NC_010334	CCA	2	6	5051935	5051940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91561	NC_010334	ATAAGG	2	12	5051955	5051966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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91563	NC_010334	GCA	2	6	5052025	5052030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91564	NC_010334	TTC	2	6	5052101	5052106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91565	NC_010334	GCC	2	6	5052344	5052349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91566	NC_010334	C	6	6	5052408	5052413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91567	NC_010334	GCT	2	6	5052554	5052559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91568	NC_010334	CTT	2	6	5052579	5052584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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91574	NC_010334	TCG	2	6	5052797	5052802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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91577	NC_010334	CCG	2	6	5052971	5052976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91578	NC_010334	GCC	2	6	5053036	5053041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91579	NC_010334	T	7	7	5053082	5053088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91581	NC_010334	TCAT	2	8	5053161	5053168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91582	NC_010334	T	6	6	5053176	5053181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91583	NC_010334	CA	3	6	5053231	5053236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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91590	NC_010334	TGCT	2	8	5053481	5053488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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91592	NC_010334	T	6	6	5053679	5053684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91593	NC_010334	AC	3	6	5053690	5053695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91594	NC_010334	TAA	2	6	5053708	5053713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91595	NC_010334	TTA	2	6	5053732	5053737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91597	NC_010334	TTC	2	6	5053761	5053766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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91601	NC_010334	CTA	2	6	5053934	5053939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626057
91602	NC_010334	CTA	2	6	5053970	5053975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626057
91603	NC_010334	CCTT	2	8	5053995	5054002	0 %	50 %	0 %	50 %	167626057
91604	NC_010334	GTGAA	2	10	5054018	5054027	40 %	20 %	40 %	0 %	167626057
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91608	NC_010334	GAA	2	6	5054268	5054273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626058
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91613	NC_010334	CTG	2	6	5054468	5054473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626058
91614	NC_010334	CT	3	6	5054672	5054677	0 %	50 %	0 %	50 %	167626058
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91618	NC_010334	ATAG	2	8	5054953	5054960	50 %	25 %	25 %	0 %	167626058
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91622	NC_010334	ACAA	2	8	5055051	5055058	75 %	0 %	0 %	25 %	167626058
91623	NC_010334	AAC	2	6	5055077	5055082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91624	NC_010334	A	6	6	5055091	5055096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91626	NC_010334	TAAT	2	8	5055223	5055230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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